Descripción del proyecto
EL DESARROLLO DE UN FARMACO ES UNA TAREA ALTAMENTE COSTOSA DESDE UN PUNTO DE VISTA ECONOMICO Y TEMPORAL. CON UNA MEDIA DE TIEMPO ENTORNO A LOS 10-17 AÑOS Y UN COSTE MEDIO DE 3.000 MILLONES DE DOLARES, EL DESARROLLO DE UN FARMACO DEBE PASAR POR DIFERENTES FASES, DANDO LUGAR A QUE DE UN GRAN NUMERO DE MOLECULAS DE PARTIDA (EN TORNO A 10.000) QUE SON CONSIDERADAS A SER USADAS PARA EL DESARROLLO DE UN FARMACO, SOLO UNA SUELE SER FINALMENTE APROBADA PARA SU USO. EN ESTE CONTEXTO, TAL Y COMO ADEMAS HA DEMOSTRADO LA RECIENTE PANDEMIA DE LA COVID-19, LAS ESTRATEGIAS DE REPOSICIONAMIENTO DE FARMACOS (UTILIZAR UN FARMACO EXISTENTE PARA OTRA PATOLOGIA DIFERENTE DE PARA LA QUE FUE ORIGINALMENTE DESARROLLADO) SON DE VITAL IMPORTANCIA CON EL OBJETIVO DE REDUCIR COSTES, DISMINUIR LOS TIEMPOS Y PODER TENER ALTERNATIVAS TERAPEUTICAS A DETERMINADAS ENFERMEDADES. ESTO TIENE ADEMAS UNA IMPORTANCIA MUCHO MAYOR EN CONTEXTOS DONDE ES URGENTE LA NECESIDAD DE ENCONTRAR FARMACOS (COMO EL DE LA CITADA PANDEMIA) O EN CONTEXTOS COMO EL DE LAS ENFERMEDADES RARAS, DONDE LA BAJA PREVALENCIA DE DETERMINADAS PATOLOGIAS DISMINUYE LOS ESFUERZOS DE INVESTIGACION O DE DESARROLLO ANTE DICHAS ENFERMEDADES, SIENDO POR LO TANTO DE NECESARIAS ESTRATEGIAS COMO EL REPOSICIONAMIENTO DE FARMACOS. POR OTRA PARTE, CON UNA SOCIEDAD DONDE CADA VEZ EXISTEN MAS PATOLOGIAS ASOCIADAS A LOS CONSTANTES CAMBIOS DEL ENTORNO, EL RITMO DE VIDA, O FACTORES SOCIO-ECONOMICOS DERIVADOS DE LOS MISMOS, ES IMPERANTE ENCONTRAR NUEVAS ALTERNATIVAS TERAPEUTICAS TANTO PARA ESTAS NUEVAS ENFERMEDADES O SITUACIONES, COMO PARA LAS EXISTENTES, DONDE UNA MAYOR ALTERNATIVA FARMACOLOGICA PUEDE AYUDAR A LIDIAR CON SITUACIONES DE POTENCIAL INCOMPATIBILIDAD ENTRE FARMACOS O DADAS LAS CARACTERISTICAS BIOLOGICAS DE UN PACIENTE (EJ. ALERGIAS). EN ESTE CONTEXTO, EL PROYECTO 3DR-GNN SURGE COMO UNA EXTENSION DE UN PROYECTO PREVIAMENTE FINANCIADO POR EL PLAN NACIONAL (DISNET, RTI2018-094576-A-I00) DURANTE EL PERIODO 2018-2021, PARA EXTENDER LA LINEA DE INVESTIGACION QUE DISNET LLEVO A CABO DURANTE LOS 3 AÑOS ANTERIORES, Y TRATAR DE INCORPORAR NUEVAS ESTRATEGIAS EN LO REFERIDO A LA INCORPORACION DE FUENTES DE INFORMACION, LA SEMANTIZACION E INTEGRACION DE LOS DATOS EN LA LINKED OPEN DATA CLOUD, Y SOBRE TODO, LA APLICACION DE NUEVAS TECNICAS DE APRENDIZAJE PROFUNDO EN REDES, PRINCIPALMENTE CENTRADAS EN EL CONCEPTO DE GRAPH NEURAL NETWORKS PARA LA PREDICCION DE POTENCIALES ENLACES QUE PERMITAN CALCULAR Y GENERAR HIPOTESIS DE REPOSICIONAMIENTO TENIENDO EN CUENTA NO SOLO LAS CARACTERISTICAS DE CADA ENTIDAD SINO TAMBIEN SUS RELACIONES Y ESTRUCTURA GLOBAL. MEDIANTE LA INCLUSION DE NUEVAS TIPOLOGIAS DE INFORMACION Y LA APLICACION DE TECNICAS PREDICTIVAS AVANZADAS SE PODRA ENTENDER MEJOR LAS RELACIONES EXISTENTES ENTRE LAS ENFERMEDADES QUE EXISTEN A NIVEL MOLECULAR Y QUE LAS ASOCIACIONES DE LOS COMPONENTES BIOLOGICOS Y FENOTIPICOS EXPRESAN, PERMITIENDO MEJORAR NUESTRA COMPRENSION DE COMO LAS ENFERMEDADES SE CARACTERIZAN, COMO ESTAN DE RELACIONADAS Y USANDO ESTA INFORMACION PARA DISEÑAR ESTRATEGIAS Y METODOLOGIAS DE GENERACION DE HIPOTESIS DE REPOSICIONAMIENTO DESDE UN ENFOQUE BASADO EN LOS DATOS. EPOSICIONAMIENTO DE FARMACOS\REDES COMPLEJAS\APRENDIZAJE AUTOMATICO\APRENDIZAJE PROFUNDO EN REDES