Descripción del proyecto
EL REPOSICIONAMIENTO DE DROGAS (DRUG REPURPOSING OR REPOSITIONING) ES UNA ESTRATEGIA MEDIANTE LA CUAL SE IDENTIFICAN NUEVOS COMPUESTOS O DROGAS A PARTIR DE SU CAPACIDAD PARA TRATAR ENFERMEDADES DISTINTAS DE AQUELLAS PARA LAS QUE FUERON DISEÑADAS ORIGINALMENTE, EL PROCESO DE REPURPSING ESTA CADA VEZ MAS EN AUGE AL EXISTIR UNA GRAN CANTIDAD DE INFORMACION, PROCESOS, DIANAS, COMPUESTOS ESTUDIADOS HASTA MUY AVANZADAS FASES, QUE PUEDEN SER VALORADOS EN EL CONTEXTO DE NUEVAS ENFERMEDADES Y QUE PODRIAN EVENTUALMENTE RECORTAR SIGNIFICATIVAMENTE EL TIEMPO Y DINERO INVERTIDO EN EL DESARROLLO DE FARMACOS, EXISTEN VARIAS ESTRATEGIAS EFECTIVAS PARA ESTE PROCESO DE REPOSICIONAMIENTO Y QUE DEPENDIENDO DE LA METODOLOGIA UTILIZADA SE SUELEN CENTRAR EN LA PROPIA DROGA DE INTERES, EN LA DIANA O EN LA MISMA ENFERMEDAD, EJEMPLOS DE ESTAS APROXIMACIONES HAY MUCHOS, LA BUSQUEDA DE LAS CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES DE LAS MOLECULAS YA APROBADAS PARA CIERTAS INDICACIONES O ENFERMEDADES, TAMBIEN EL USO DE BIOLOGIA DE SISTEMAS PARA EVALUAR DE QUE MANERA CIERTAS DIANAS ESTAN POSICIONADAS CON RESPECTO A OTRAS DIANAS EXITOSAS, DE LA MISMA MANERA, EL USO DE TECNICAS OMICAS DE ALTO RENDIMIENTO EN LAS ENFERMEDADES OBJETO DE ESTUDIOS PARA IDENTIFICAR FENOTIPOS SIMILARES U OPUESTOS QUE DEN PISTAS SOBRE OTRAS PATOLOGIAS O PROCESOS SIMILARES PARA LOS CUALES SI EXISTAN DROGAS EFECTIVAS, ES EN ESTE ULTIMO PUNTO DONDE SE ENMARCA ESTE PROYECTO QUE, APROVECHANDO TODA LA EXPERIENCIA, ESTUDIOS Y RESULTADOS ACUMULADOS DURANTE LOS ULTIMOS AÑOS EN EL GRUPO DE INVESTIGACION, PERMITA DISEÑAR UN SISTEMA COMPUTACIONAL PARA REPOSICIONAMIENTO DE DROGAS, ES DECIR, QUE A PARTIR DE UN FENOTIPO DE INTERES (UNA ENFERMEDAD RARA POR EJEMPLO) BUSQUE Y EVALUE DATOS EXISTENTES PARA ENCONTRAR CONDICIONES (ENFERMEDADES, DROGAS, LINEAS CELULARES TRATADAS CON COMPUESTOS, ETC) QUE PRODUZCAN FENOTIPOS SIMILARES O ANTAGONICOS SUSCEPTIBLES DE ESTAR RELACIONADOS CON EL PROCESO BUSCADO, DE ESTA MANERA ES POSIBLE LA IDENTIFICACION DE GENES, DROGAS, COMPUESTOS Y ENFERMEDADES RELACIONADAS QUE SERVIRIAN DE CANDIDATOS PARA SER REPOSICIONADOS, PARA COMPLETAR ESTOS OBJETIVOS SE PROPONE UTILIZAR Y DESARROLLAR APROXIMACIONES NOVEDOSAS PARA ANALISIS DE DATOS TRANSCRIPTOMICOS (RNA-SEQ, MIRNA-SEQ, RTPCR, MICROARRAYS) DISPONIBLES EN REPOSITORIOS PUBLICOS Y EVENTUALMENTE PRIVADOS (A TRAVES DE COLABORACIONES) PARA LA IDENTIFICACION DE AQUELLOS EXPERIMENTOS Y CONDICIONES FENOTIPICAS SIMILARES U OPUESTAS A LAS DE INTERES, ESTA INFORMACION SE COMBINARA CON OTROS TIPOS DE DATOS OMICOS COMO PUEDEN SER NUMERO DE COPIAS (CNV), INFORMACION REGULATORIA (DATOS EXPERIMENTALES DE FACTORES DE TRANSCRIPCION Y MIRNAS), EXPRESION DE PROTEINAS E INFORMACION FUNCIONAL Y ESTRUCTURAL DE LAS MISMAS PARA ENTENDER LOS PROCESOS DE LA ENFERMEDAD E IDENTIFICAR POTENCIALES DROGAS EXISTENTES, TODO ESTO SERA DESARROLLADO EN ESTRECHA COLABORACION CON GRUPOS DE TRABAJO EN CONTEXTOS EXPERIMENTALES MUY CONCRETOS, ACTUALMENTE EXISTEN MUY POCOS SISTEMAS SIMILARES QUE RESUELVAN ESTE PROBLEMA DE MANERA EFICIENTE LO QUE LO DOTA DE GRAN INTERES, SOCIAL Y TAMBIEN ECONOMICO, INICIALMENTE SE TRABAJARA EN ESTA LINEA CON LA CHILDREN TUMOR FOUNDATION, ORGANIZACION CENTRADA EN EL ESTUDIO DE ENFERMEDADES RARAS QUE AFECTAN A POBLACION INFANTIL COMO SON LA NEUROFIBROMATOSIS (NF) Y EL SCHWANNOMATOSIS Y MALIGNANT PERIPHERAL NERVE SHEATH TUMORS (MPNSTS) BIOINFORMATICA\ REPOSICIONAMIENTO DE DROGAS\ EXPRESIÓN GÉNICA\ RNA-SEQ\ MICROARRAYS