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Regulatory and functional architecture of Nested Sensitivity microexon program...

Regulatory and functional architecture of Nested Sensitivity microexon programs Neural microexons are a paradigmatic example of a cell type-specific transcriptomic program. Microexons are tiny exons that we revealed to have striking neuronal specificity established by their master splicing regulator Srrm4, wh... ver más

30/06/2026

UPF

2M€

Presupuesto del proyecto: 2M€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 324

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 3 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2021-05-07

ERC-2020-COG: ERC CONSOLIDATOR GRANTS Scope:Objectives

I+D

Cerrada hace 5 años

0% 100% 100%

Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

Información adicional privada

No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

3 Participantes

UPF

878.97K€ | Lider

OPEL ESPAÑA,

466.45K€ | Participante

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE R...

1.10M€ | Participante

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Duración del proyecto: 61 meses Fecha Inicio: 2021-05-07
Fecha Fin: 2026-06-30

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 324

Presupuesto del proyecto 2M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Neural microexons are a paradigmatic example of a cell type-specific transcriptomic program. Microexons are tiny exons that we revealed to have striking neuronal specificity established by their master splicing regulator Srrm4, which activates them during neuronal differentiation. However, our unpublished data challenge this on/off regulatory and functional paradigm. We found that a related paralog, Srrm3, is lowly but significantly expressed also in endocrine pancreas and, together with Srrm4, configure a 3-step switch of Srrm3/4 activity in pancreas (low), brain (mid) and retina (high). These different levels of expression activate increasingly larger subsets of microexons in the three tissues, configuring a triple-nested microexon program. Remarkably, initial results support a model in which microexon subclass inclusion is dictated largely by their sensitivity to Srrm3/4, and each subclass is differentially enriched for distinct functional categories including vesicle-mediated transport, neuronal differentiation and cilium biogenesis. This project will assess the regulatory and functional architecture of this new paradigm by answering: (1) How are the different levels of the master regulators controlled in each cell type? (2) How are the distinct sensitivities of microexons to Srrm3/4 genomically encoded? (3) What are the functional implications of the 'nestedness' of the microexon programs? (4) How does misregulation of the nested programs contribute to disease? These goals will be achieved by a combination of high-throughput methods and focused experiments using in vitro and in vivo systems. The expected results will provide a transformative multi-level portrait of microexons, from quantitative regulatory logic to organismal functions. Moreover, this novel paradigm is likely to apply to many other master regulators, expanding the impact of the project and shedding new light into how cell type-specific transcriptomes are established in embryogenesis.

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