Descripción del proyecto
CON EL OBJETO DE MEJORAR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LOS FACTORES (EPI)-GENOMICOS (EPIGENETICOS Y GENOMICOS), ASI COMO DE LOS MECANISMOS QUE MEDIAN EN LA ADAPTACION A CAMBIO CLIMATICO (RESPUESTAS A ESTRES ABIOTICO) Y REPROGRAMACION CELULAR DURANTE EL DESARROLLO DE ESPECIES FORESTALES, SE PLANTEA UN PROYECTO MULTIDISCIPLINAR QUE INCLUYE ECOFISIOLOGIA, GENETICA, BIOQUIMICA Y BIOLOGIA CELULAR, ASI COMO APROXIMACIONES EPIGENETICAS, TRANSCRIPTOMICAS Y PROTEOMICAS. SE DISPONE DE LIBRERIAS DE GENES Y PROTEINAS GENERADAS DURANTE EL DESARROLLO DEL PROYECTO PREVIO AGL2007-62907. COMO ESPECIE DE ESTUDIO SE CONSIDERA UNA ESPECIE FORESTAL DE IMPORTANCIA ECOLOGICA Y PRODUCTIVA EN NUESTRO PAIS: PINUS RADIATA. SE INCLUYEN MODELOS MORFOGENICOS ESPECIFICOS DERIVADOS DE LA ESPECIE OBJETO DE ESTUDIO CASTANEA Y QUERCUS, ESTOS MODELOS COMPLEMENTARIOS QUE IMPLICAN REPROGRAMACION CELULAR SON: MICROINJERTO EN PINUS, ABORTO DE OVULOS Y EMBRYOGENESIS SEXUAL Y ASEXUAL EN CASTANEA Y QUERCUS. METODOLGIAS DESARROLLDAS Y OPTIMIZADAS POR EL EQUIPO SOLICITANTE. EPIDOMICAS PROPONE EL ESTUDIO, MEDIANTE EL USO DE PLATAFORMAS (EPI)-GENOMICAS (EPIGENETICAS, TRANSCRIPTOMICAS Y PROTEOMICAS), DE LOS MECANISMOS DE REGULACION GENICA FRENTE AL ESTRES ABIOTICO INDUCIDO POR RADIACION UV Y ALTAS TEMPERATURAS. EL PROYECTO SE CENTRA EN PROCESOS VITALES DE SUPERVIVENCIA, TALES COMO: PRODUCCION PRIMARIA, CRECIMIENTO ACTIVO, POTENCIAL DE DIFERENCIACION Y REPROGRAMACION BAJO CONDICIONES DE ESTRES. PARA LA CONSECUCION DE LOS OBJETIVOS PLANTEADOS SE IDENTIFICARAN Y ESTUDIARAN LOS GENES RELACIONADOS CON LOS MECANISMOS DE ADAPTACION CLIMATICA, ESPECIALMENTE LOS GENES CON REGULACION EPIGENETICA. DISPONER DE PLATAFORMAS EPIGENETICAS PARA LA SELECCION DE FENOTIPOS ADAPTADOS CONSTITUYE UN OBJETIVO PRIORITARIO. SE PRESTARA ESPECIAL ESFUERZO AL ANALISIS DE LA FUNCION DE LOS GENES REGULADORES Y AL ESTUDIO DE LA REMODELACION DE LA CROMATINA Y ORGANIZACION NUCLEAR. ASPECTOS TODOS ELLOS NECESARIOS PARA ABORDAR EL PLANTEAMIENTO DE ESTUDIO INDICADO Y QUE, A PESAR DE SU IMPORTANCIA Y POTENCIAL INTERES ECONOMICO, NO ES FRECUENTE SU ESTUDIO DE UNA FORMA INTEGRADA.LA APROXIMACION A LA MODULACION DE LA ADAPTACION CLIMATICA DE ESPECIES FORESTALES, Y PROPAGACION MASIVA DE ARBOLES ELITE, MEDIANTE LA EXPLOTACION DE LA PLASTICIDAD FENOTIPICA Y LA VARIACION GENOTIPICA DESDE LA PERSPECTIVA DE UN CONTROL EPIGENETICO DE LA RESPUESTA SE SUSTENTA EN DOS AREAS DE INVESTIGACION PRIORITARIAS: REGULACION (EPI)-GENOMICA DEL POTENCIAL DE DIFERENCIACION-ENVEJECIMIENTO: PLASTICIDAD FENOTIPICA Y CONTROL (EPI)-GENOMICO Y PRODUCTIVIDAD BAJO CONDICIONES DE ESTRES ABIOTICO: PERFILES DE EXPRESION GENICA, AMBAS INTEGRADAS MEDIANTE LA INVESTIGACION EN PLASTICIDAD (EPI)-GENOMICA Y ARTICULADAS EN TORNO A LOS SIGUIENTES OBJETIVOS PROPUESTOS: 1. IDENTIFICAR GENES CANDIDATOS MEDIANTE PERFILES DE EXPRESION EN RESPUESTA A RADIACION UV Y ALTAS TEMPERATURAS. 2. IDENTIFICAR PROTEINAS CANDIDATAS IMPLICADAS EN LA RESPUESTA A RADIACION UV Y ALTAS TEMPERATURAS. 3. DEFINIR GENES CANDIDATOS Y CARACTERIZAR SU REGULACION EPIGENETICA Y PERFILES DE EXPRESION ESPACIO-TEMPORAL. 4. EVALUAR EL SIGNIFICADO BIOLOGICO DEL SILENCIAMIENTO/EXPRESION MEDIANTE MECANISMOS EPIGENETICOS DE LOS GENES CARACTERIZADOS. 5. VALIDAR LOS MARCADORES (EPI)-GENOMICOS DURANTE EL DESARROLLO Y REPROGRAMACION BAJO LAS CONDICIONES DE ESTRES DEFINIDAS. 6. APLICACION DE LA (EPI)-GENOMICA EN LA SELECCION Y CLONACION DE FENOTIPOS DE INTERES: SISTEMAS DE INMERSION TEMPORAL. PIGENETICA\ESPECIES AGROFORESTALES\ESTRES ABIOTICO\DESARROLLO Y PRODUCTIVIDAD VEGETAL\CLONACION\GENE REGULATION\TRANSCRIPTOMICA\PROTEOMICA