BFU2013-43136-P
Financiado
REDES ESPACIO-TEMPORALES QUE CONECTAN EL OSCILADOR CIRCADIANO CON LA LUZ Y RUTAS METABOLICAS.
LOS RITMOS CIRCADIANOS SON GENERADOS POR UN MECANISMO CELULAR ENDOGENO DENOMINADO RELOJ BIOLOGICO O CIRCADIANO, ADEMAS DEL OSCILADOR CENTRAL, EL RELOJ CONSTA DE RUTAS DE ENTRADA QUE SINCRONIZAN EL OSCILADOR CON LAS VARIACIONES DE...
LOS RITMOS CIRCADIANOS SON GENERADOS POR UN MECANISMO CELULAR ENDOGENO DENOMINADO RELOJ BIOLOGICO O CIRCADIANO, ADEMAS DEL OSCILADOR CENTRAL, EL RELOJ CONSTA DE RUTAS DE ENTRADA QUE SINCRONIZAN EL OSCILADOR CON LAS VARIACIONES DE LUZ Y TEMPERATURA Y DE RUTAS DE SALIDA QUE VINCULAN EL OSCILADOR CON LOS PROCESOS BIOLOGICOS RITMICOS, EL OBJETIVO GENERAL DE ESTA PROPUESTA SE CENTRA EN EXPLORAR LOS DETERMINANTES ESPACIO-TEMPORALES QUE CONECTAN LOS DIFERENTES COMPONENTES DEL SISTEMA CIRCADIANO, I,E, EL OSCILADOR CENTRAL CON LAS RUTAS DE ENTRADA DE LUZ Y LAS RUTAS DE SALIDA METABOLICAS, MEDIANTE EL USO DE MODELOS MATEMATICOS SE INTEGRARAN LOS DATOS OBTENIDOS PARA CONSTRUIR REDES MODULARES CON VALOR PREDICTIVO,EN UN PRIMER OBJETIVO SE ESTUDIARAN LAS REDES INTERACTIVAS PROTEINA-PROTEINA IMPLICADAS EN LA RUTA DE ENTRADA DE LUZ AL RELOJ, ESTUDIOS PREVIOS HAN IDENTIFICADO VARIOS FACTORES DE SEÑALIZACION DE LUZ (TIFS) QUE INTERACCIONAN CON TOC1, UNA PROTEINA ESENCIAL DEL OSCILADOR, SE ESTUDIARAN LOS CAMBIOS CIRCADIANOS DE EXPRESION GENICA, FENOTIPOS DEPENDIENTES DE LA LUZ, ASI COMO ALTERACIONES FISIOLOGICAS Y DE DESARROLLO EN PLANTAS CON EXPRESION ALTERADA DE TIFS, TAMBIEN SE CARACTERIZARA LA INTERACCION GENETICA Y MOLECULAR DE TIFS CON TOC1 Y SU RELEVANCIA EN PROCESOS CLAVE DEL RELOJ COMO LA SINCRONIZACION, GATING Y RESPUESTA A SOMBRA, SE EXAMINARA TAMBIEN LA REGULACION CIRCADIANA DE LA INTERACCION TIF-TOC1, LA ESTABILIDAD DE LAS PROTEINAS TIFS Y LA ESPECIFICIDAD CELULAR DE ESTAS INTERACCIONES (OBJETIVO 3), LOS RESULTADOS PERMITIRAN OBTENER UNA VISION GLOBAL DE LAS REDES QUE CONECTAN LA RUTA DE ENTRADA DE LUZ CON EL OSCILADOR,EN UN SEGUNDO OBJETIVO SE EXPLORARA LA RELEVANCIA DE LOS COMPLEJOS PROTEICOS EN EL CONTROL DEL METABOLISMO CELULAR DE LA PLANTA, EL USO DEL SISTEMA DE DOS-HIBRIDOS EN LEVADURA (Y2H) CON PROTEINAS ESENCIALES DEL OSCILADOR HA IDENTIFICADO NUEVOS COMPONENTES CIRCADIANOS (LIFS), DATOS PRELIMINARES SUGIEREN QUE LOS FACTORES LIFS PUDIERAN ESTAR IMPLICADOS EN LA REGULACION DE VIAS METABOLICAS CLAVE EN LAS PLANTAS, SE VERIFICARA LA EXPRESION CIRCADIANA DE COMPONENTES RELEVANTES DENTRO DE ESTAS VIAS Y SE EXAMINARAN LOS EFECTOS EN PLANTAS CON EXPRESION ALTERADA DE LOS LIFS, EL ANALISIS DE METABOLITOS EN DIFERENTES CONDICIONES AMBIENTALES Y EN VARIOS FONDOS GENETICOS PROPORCIONARA INFORMACION SOBRE LA FUNCION ESPECIFICA DE ESTOS FACTORES, TAMBIEN SE ESTUDIARA LA ESPECIFICIDAD CELULAR DE ESTAS ACTIVIDADES (OBJETIVO 3), LOS RESULTADOS PERMITIRAN DETERMINAR LA FUNCION DE LOS FACTORES LIFS COMO EJES MOLECULARES QUE CONECTAN EL OSCILADOR CON EL METABOLISMO DE LA PLANTA,EL TERCER OBJETIVO SE CENTRARA EN EL ANALISIS DEL OSCILADOR, RUTAS DE ENTRADA Y SALIDA DEL RELOJ EN DIFERENTES CELULAS Y TEJIDOS, LA IDEA ES OBTENER UN ATLAS DEL SISTEMA CIRCADIANO EN PLANTAS, SE UTILIZARA MICRO-DISECCION POR LASER SEGUIDA DEL ANALISIS DE EXPRESION GENICA MEDIANTE MATRICES NANOFLUIDICAS O RNA-SEQ, ESTE NUEVO ENFOQUE CONFERIRA A NUESTROS ESTUDIOS NO SOLO UNA ESPECIFICIDAD TEMPORAL SINO TAMBIEN ESPACIAL, EXPLORAREMOS LOS DETERMINANTES RESPONSABLES DEL PERIODO, FASE Y AMPLITUD CIRCADIANA EN CADA UNO DE ESTOS TEJIDOS, POR ULTIMO, SE DESARROLLARAN NUEVOS MODELOS MATEMATICOS CAPACES DE PREDECIR LAS SIMILITUDES Y DIFERENCIAS DE LA PROGRESION DEL RELOJ CIRCADIANO, LOS MODELOS DEFINIRAN BLOQUES MODULARES QUE SERVIRAN PARA DELINEAR LAS REDES INTERACTIVAS QUE CONECTAN LA RUTA DE ENTRADA DE LUZ Y LA RUTAS METABOLICAS CON EL OSCILADOR CIRCADIANO, RELOJ CIRCADIANO\ RITMOS CIRCADIANOS\ ARABIDOPSIS THALIANA\ REDES ESPACIO-TEMPORALES.
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01
AEI
No se conoce la línea exacta de financiación, pero conocemos el organismo encargado de la revisión del proyecto.
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
387K€
Líder del proyecto
CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB...
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