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Autophagy in vitro

Financiado

Reconstituting Autophagosome Biogenesis in vitro

Autophagy is a catabolic pathway that delivers cytoplasmic material to lysosomes for degradation. Under vegetative conditions, the pathway serves as quality control system, specifically targeting damaged or superfluous organelles... ver más

31/01/2021

1M€

Presupuesto del proyecto: 1M€

Líder del proyecto

INSTITUT PASTEUR No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Ver 3 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-31

Línea de financiación objetivo El proyecto se financió a través de la siguiente ayuda:

ERC-StG-2014: ERC Starting Grant

I+D

Cerrada hace 10 años

0% 100%

3 Participantes

1.19M€ | Lider

SMC ESPAÑA

MPG

314.67K€ | Participante

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Duración del proyecto: 71 meses Fecha Inicio: 2015-02-13
Fecha Fin: 2021-01-31

Líder del proyecto

INSTITUT PASTEUR

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 1M€

Descripción del proyecto Autophagy is a catabolic pathway that delivers cytoplasmic material to lysosomes for degradation. Under vegetative conditions, the pathway serves as quality control system, specifically targeting damaged or superfluous organelles and protein-aggregates. Cytotoxic stresses and starvation, however, induces the formation of larger autophagosomes that capture cargo unselectively. Autophagosomes are being generated from a cup-shaped precursor membrane, the isolation membrane, which expands to engulf cytoplasmic components. Sealing of this structure gives rise to the double-membrane surrounded autophagosomes. Two interconnected ubiquitin (Ub)-like conjugation systems coordinate the expansion of autophagosomes by conjugating the autophagy related (Atg)-protein Atg8 to the isolation membrane. In an effort to unravel the function of Atg8, we reconstituted the system on model membranes in vitro and found that Atg8 forms together with the Atg12–Atg5-Atg16 complex a membrane scaffold which is required for productive autophagy in yeast. Humans possess seven Atg8-homologs and two mutually exclusive Atg16-variants. Here, we propose to investigate the function of the human Ub-like conjugation system using a fully reconstituted in vitro system. The spatiotemporal organization of recombinant fluorescent-labeled proteins with synthetic model membranes will be investigated using confocal and TIRF-microscopy. Structural information will be obtained by atomic force and electron microscopy. Mechanistic insights, obtained from the in vitro work, will be tested in vivo in cultured human cells. We belief that revealing 1) the function of the human Ub-like conjugation system in autophagy, 2) the functional differences of Atg8-homologs and the two Atg16-variants Atg16L1 and TECPR1 and 3) how Atg16L1 coordinates non-canonical autophagy will provide essential insights into the pathophysiology of cancer, neurodegenerative, and autoimmune diseases.

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