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WhiskTrackGP

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Real time tracking of whisker kinematics for closed loop neuroscientific experim...

Real time tracking of whisker kinematics for closed loop neuroscientific experiments We study the sensorimotor adaptation in the cerebellum with the whiskers of the mouse as a model system. The whiskers are a sophisticated sensorimotor apparatus with which the mouse actively profiles its immediate 3D environment b... ver más

31/08/2018

ERASMUS MC

150K€

Presupuesto del proyecto: 150K€

Líder del proyecto

ERASMUS UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM ROTTERDA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 2 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2018-08-31

ERC-2017-PoC: ERC-Proof of Concept Scope:Scope:

I+D

Cerrada hace 8 años

0% 100% 100%

Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

Información adicional privada

No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

2 Participantes

ERASMUS MC

149.94K€ | Lider

ONE WAY LIVER GENOMICS

300.00K€ | Participante

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Duración del proyecto: 12 meses Fecha Inicio: 2017-08-23
Fecha Fin: 2018-08-31

Líder del proyecto

ERASMUS UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM ROTTERDA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 150K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto We study the sensorimotor adaptation in the cerebellum with the whiskers of the mouse as a model system. The whiskers are a sophisticated sensorimotor apparatus with which the mouse actively profiles its immediate 3D environment by swiftly whisking. To estimate distances, orientation and texture of its surroundings, the mouse uses a ‘maximum contact, minimum penetration’ scheme, with sensorimotor decisions taking place within as little as 10 ms. This scheme imposes the main experimental challenge to whisker-based studies: hair-like structures moving at high speeds need to be tracked accurately to ascribe whisker motion to cerebellar function. In order to capture the motion of the whiskers accurately, high-speed image acquisition at high frame rates (ca. 1000 fps) is required. On account of the paradigms developed to relate neural activity to whisker behavior, high-throughput and real-time whisker tracking are required. We have evaluated all presently available whisker-tracking tools that delivered the desired kinematics of whisker behavior. However, all have failed in terms of computational time and/or acquisition frequency, which rendered them unsuited both for offline use and for real-time applications. To address these limitations, we propose the commercialization of WhiskTrackGP, a high-performance image-acquisition and -processing platform for bleeding-edge neuroscientific experiments on behavior. WhiskTrackGP is a hardware-software platform that can recognize the kinematics of multiple whiskers simultaneously with minimal intervention from the experimenter. It is realized as powerful whisker-tracking software ported on a special hardware platform based on NVidia GP-GPUs and Maxeler Dataflow-Engines. We demonstrate accelerated offline video analysis in the order of 10000x (from an original processing time of 9.4 sec down to 0.9 msec). WhiskTrackGP comprises a one-stop shop solution for labs and companies active in the field of behavioral studies.

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