Descripción del proyecto
LA EXPRESION GENICA NECESITA UNA REGULACION ESPACIO-TEMPORAL MUY PRECISA DURANTE EL DESARROLLO EMBRIONARIO ANIMAL QUE ASEGURE LA CORRECTA ORGANOGENESIS Y EL MODELADO DEL PLAN CORPORAL. ESTA REGULACION OCURRE EN GRAN MEDIDA A NIVEL TRANSCRIPCIONAL A TRAVES DE ELEMENTOS REGULADORES EN CIS (DEL INGLES CIS-REGULATORY ELEMENTS, CRES), TANTO PROMOTORES COMO POTENCIADORES O ENHANCERS, Y LA UNION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION A SECUENCIAS ESPECIFICAS DE DNA CONTENIDAS EN ELLOS. SIN EMBARGO, EVIDENCIAS RECIENTES SUGIEREN QUE CIERTOS RNAS NO CODIFICANTES SINTETIZADOS EN ESTOS CRES DESEMPEÑAN FUNCIONES EN EL CONTROL DE LA TRANSCRIPCION, AÑADIENDO PUES UN NUEVO NIVEL DE COMPLEJIDAD A LA REGULACION GENICA. ESTAS MOLECULAS DE RNA ASOCIADAS A LOS CRES SE ENCUENTRAN A MENUDO EN FORMA DE R LOOPS, ESTRUCTURAS FORMADAS POR TRES CADENAS DE ACIDOS NUCLEICOS QUE CONSISTEN EN UN HIBRIDO DNA-RNA Y LA CADENA SENCILLA DE DNA DESPLAZADA. LA VISION TRADICIONAL DE LOS R LOOPS COMO SUBPRODUCTOS PERJUDICIALES DE LA TRANSCRIPCION QUE PROVOCAN INESTABILIDAD GENOMICA CONTRASTA CON DESCUBRIMIENTOS RECIENTES QUE MUESTRAN QUE ESTOS TIENEN MULTIPLES FUNCIONES FISIOLOGICAS RELACIONADAS CON LA REGULACION Y ESTRUCTURA DE LA CROMATINA. DADO QUE LA REGULACION GENICA Y DE LA CROMATINA SON ESPECIALMENTE COMPLEJAS DURANTE EL DESARROLLO EMBRIONARIO, ESTE PROYECTO PRETENDE EXPLORAR LA FUNCION DE LOS R LOOPS REGULADORES DURANTE EL DESARROLLO DE VERTEBRADOS USANDO COMO MODELO EMBRIONES DE PEZ CEBRA. SE UTILIZARAN INNOVADORAS TECNICAS OMICAS PARA DETERMINAR LOS SITIOS DE FORMACION DE R LOOPS DURANTE EL DESARROLLO TEMPRANO DEL PEZ CEBRA Y ANALIZAR SUS CARACTERISTICAS EPIGENOMICAS Y SU RELACION CON LA TRANSCRIPCION DE LOS GENES. SE EVALUARAN LAS FUNCIONES REGULADORAS DE LOS R LOOPS EN LA REGULACION GENICA DEL DESARROLLO MEDIANTE LA ALTERACION DE SUS NIVELES DE FORMA GLOBAL Y LOCAL Y MEDIANTE EL ANALISIS DE SUS CONSECUENCIAS SOBRE LA EXPRESION GENICA Y LA ACCESIBILIDAD DE LA CROMATINA. FINALMENTE, SE EXPLORARAN LAS FUNCIONES DE LOS R LOOPS EN LA ARQUITECTURA DE LA CROMATINA. EN CONJUNTO, EL PROYECTO PROPUESTO PERMITIRA ELUCIDAR LA CONTRIBUCION DE LOS R LOOPS A LA REGULACION GENICA Y DE LA CROMATINA COMO UN NUEVO NIVEL DE COMPLEJIDAD NECESARIO PARA LA ORGANIZACION DEL PLAN CORPORAL DE VERTEBRADOS. ESTO REPRESENTA UNA APROXIMACION MUY INNOVADORA QUE SE NUTRE DE LA EXPERIENCIA ADQUIRIDA DURANTE DISTINTAS ETAPAS DE MI CARRERA Y DISEÑADA PARA ABORDAR UN TEMA EMOCIONANTE QUE APENAS SE HA EXPLORADO, LO CUAL REPRESENTA UN NICHO UNICO PARA LA CONSOLIDACION DE MI LINEA DE INVESTIGACION INDEPENDIENTE. R LOOPS\CTCF\HIC\EPIGENOMICA\ARQUITECTURA DE LA CROMATINA\DESARROLLO EMBRIONARIO\REGULACION GENICA