Descripción del proyecto
DURANTE LOS ULTIMOS AÑOS SE HA INCREMENTADO MUCHO EL CONOCIMIENTO DE LA DIVERSIDAD DE ANFIBIOS EN EL NEOTROPICO, MIENTRAS SE DESCRIBEN ESPECIES NUEVAS CADA AÑO, OTRAS MUCHAS PASAN A ENGROSAR LAS LISTAS DE ESPECIES EN PELIGRO DE EXTINCION, SIN EMBARGO, SE SABE MUY POCO SOBRE LOS PATRONES Y PROCESOS QUE EXPLICAN ESTA DIVERSIDAD, EN ESTA PROPUESTA UNIMOS ESFUERZOS DE GRUPOS DE INVESTIGACION DE CUATRO PAISES (ESPAÑA, SUECIA, ESTADOS UNIDOS Y BRASIL) PARA ESTUDIAR EL ORIGEN DE LA DIVERSIDAD DE ANFIBIOS, EN EL NEOTROPICO Y EN UNA ESPECIE IBERICA DE LA QUE SE CONOCE MUY BIEN SU ECOLOGIA, A DIVERSAS ESCALAS ESPACIALES Y TEMPORALES, Y MEDIANTE LA UTILIZACION DE METODOS DE ANALISIS MUY DIFERENTES,EN PRIMER LUGAR, VAMOS A ESTUDIAR PATRONES MACROEVOLUTIVOS EN LA DIVERSIFICACION DE LOS ANFIBIOS NEOTROPICALES, VAMOS A INVESTIGAR SI LAS CONDICIONES ECOLOGICAS IMPONEN UN LIMITE A LA DIVERSIFICACION DE ANFIBIOS, TAL Y COMO LO SUGIERE EL MODELO ECOLOGICO DE ESPECIACION, SEGUN EL CUAL LA DISPONIBILIDAD DE NICHOS ECOLOGICOS DESOCUPADOS IMPONE UN LIMITE EN EL NUMERO POSIBLE DE ESPECIES DE UN LINAJE, VAMOS A ABORDAR ESTA CUESTION MEDIANTE EL ANALISIS DE LA RADIACION DE ELEUTERODACTYLUS EN EL CARIBE, ESTE MISMO GRUPO DE ESPECIES PERMITIRA INVESTIGAR SI LA TASA DE VARIACION FENOTIPICA Y LA TASA DE DIVERSIFICACION ESTAN RELACIONADAS, COMO SE ESPERARIA SI LA ECOLOGIA FUERA MAS IMPORTANTE QUE EL AISLAMIENTO GEOGRAFICO Y LA DERIVA GENETICA EN EL PROCESO DE DIVERSIFICACION (COMO EN RADIACIONES ADAPTATIVAS), VAMOS A RESPONDER A ESTAS PREGUNTAS MEDIANTE EL USO DE METODOS TRADICIONALES Y DE DESARROLLO RECIENTE PARA LOS ANALISIS COMPARATIVOS INTEGRANDO UNA FILOGENIA CALIBRADA CON AMPLIA INFORMACION FENOTIPICA Y ECOLOGICO PARA TODAS LAS ESPECIES DEL GRUPO (ALREDEDOR DE 190),EN SEGUNDO LUGAR, VAMOS A UTILIZAR ENFOQUES GENOMICOS PARA ESTUDIAR LA HISTORIA DEMOGRAFICA Y EVOLUTIVA DEL GENERO OREOBATES EN AUSENCIA DE UN GENOMA DE REFERENCIA, SE TRATA DE UN GENERO POCO CONOCIDO DE RANAS NEOTROPICALES QUE INCLUYE ESPECIES ADAPTADAS A AMBIENTES DE TIERRAS ALTAS Y TIERRAS BAJAS, VAMOS A ENSAMBLAR EL TRANSCRIPTOMA DE UNA DE LAS ESPECIES PARA UTILIZARLO COMO REFERENCIA, PARA LAS OTRAS ESPECIES GENERAREMOS SECUENCIAS DE TODO EL GENOMA Y LAS LECTURAS SE VAN A PROYECTAR CONTRA EL TRANSCRIPTOMA DE REFERENCIA PARA IDENTIFICAR POLIMORFISMOS, CON ESTA INFORMACION VAMOS A INVESTIGAR LAS RELACIONES FILOGENETICAS ENTRE LAS ESPECIES, VAMOS A ESTUDIAR CAMBIOS DEMOGRAFICOS A TRAVES DEL TIEMPO Y SU CORRESPONDENCIA CON CAMBIOS EN EL HABITAT, Y VAMOS A IDENTIFICAR LAS PARTES DEL GENOMA MAS DIFERENCIADAS ENTRE POBLACIONES CON DIFERENTE GRADO DE AISLAMIENTO Y QUE PODRIA INDICAR UN PROCESO INCIPIENTE DE ESPECIACION,POR ULTIMO, VAMOS A UTILIZAR UN PANEL DE MICROSATELITES Y UN GRAN NUMERO DE MARCADORES SNP (OBTENIDO UTILIZANDO METODOS DE GENOTYPING-BY-SEQUENCING) PARA INVESTIGAR LOS CAMBIOS EN LA MODULARIDAD Y LA DIFERENCIACION DE LAS POBLACIONES DE SAPO PARTERO BETICO (ALYTES DICKHILLENI) COMO CONSECUENCIA DE LAS DIFERENCIAS EN LA ESTRUCTURA DEL HABITAT, ESTE ESTUDIO PERMITIRA VER SI LA UTILIZACION DE TECNICAS GENOMICAS CON UN PUÑADO DE INDIVIDUOS ES SUFICIENTEMENTE ROBUSTA COMO PARA DETECTAR LA ESTRUCTURA DE POBLACION EN PEQUEÑAS ESCALAS ESPACIALES Y TEMPORALES DE MODO QUE EN ESTUDIOS FUTUROS SE PODRIA REDUCIR EL IMPACTO SOBRE LAS POBLACIONES NATURALES, DIVERSIFICACIÓN\ EVOLUCIÓN\ GENÉTICA DEL PAISAJE\ GENÓMICA\ MÉTODO COMPARADO\ NEOTRÓPICO\ ADAPTACIÓN\ ANUROS.