PREPARACION DE ERC STARTING GRANT NOISYNBIO: ADVANCED ANALYSIS AND DESIGN OF BIO...
PREPARACION DE ERC STARTING GRANT NOISYNBIO: ADVANCED ANALYSIS AND DESIGN OF BIOMOLECULAR CIRCUITS FOR SYNTHETIC BIOLOGY UNDER STOCHASTIC NOISE
LA BIOLOGIA SINTETICA, POSTULADA COMO UNO DE LOS PILARES DE LA BIOECONOMIA DEL FUTURO, SE BASA EN DISEÑAR SISTEMAS CELULARES UTILIZANDO PARADIGMAS Y FORMALISMOS DE LA INGENIERIA, EL OBJETIVO ES REPROGRAMAR CELULAS PARA QUE EJECUT...
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Descripción del proyecto
LA BIOLOGIA SINTETICA, POSTULADA COMO UNO DE LOS PILARES DE LA BIOECONOMIA DEL FUTURO, SE BASA EN DISEÑAR SISTEMAS CELULARES UTILIZANDO PARADIGMAS Y FORMALISMOS DE LA INGENIERIA, EL OBJETIVO ES REPROGRAMAR CELULAS PARA QUE EJECUTEN UNA ACCION O FUNCION DETERMINADA, AUNQUE EN LOS ULTIMOS AÑOS SE HA INVERTIDO UN GRAN ESFUERZO PARA PASAR DE ESTRATEGIAS INEFICIENTES BASADAS EN PRUEBA Y ERROR A UN DISEÑO EFICIENTE Y AUTOMATIZADO MEDIANTE HERRAMIENTAS CAD, EL ESTADO DEL ARTE ES TODAVIA INSATISFACTORIO, EN PARTE DEBIDO A LA FALTA DE METODOLOGIAS COMPUTACIONALES QUE SEAN CAPACES DE PROCESAR CON LA EFICIENCIA REQUERIDA LOS NIVELES DE INCERTIDUMBRE Y DE ESTOCASTICIDAD INHERENTES AL TIPO DE PROCESOS CONSIDERADOS (LA EXPRESION GENETICA ES INHERENTEMENTE ESTOCASTICA Y EL RUIDO MOLECULAR ES EN TERMINOS GENERALES CRUCIAL EN SU COMPORTAMIENTO DINAMICO),NOISYNBIO CONTRIBUIRA CON HERRAMIENTAS MATEMATICAS Y COMPUTACIONALES PARA EL ANALISIS Y EL DISEÑO BOTTOM-UP AUTOMATICO DE BIOCIRCUITOS MOLECULARES ESTOCASTICOS, PARA ELLO TRABAJAREMOS EN LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS: I) CARACTERIZACION DE PARTES STANDARD BIOLOGICAS EN EL CONTEXTO DE EXPRESION GENETICA INHERENTEMENTE ESTOCASTICA II) DESARROLLO DE HERRAMIENTAS DE DISEÑO ASISTIDO POR COMPUTADOR DE BIOCIRCUITOS ESTOCASTICOS, HACIENDO USO Y AVANZANDO RECIENTES RESULTADOS PROPIOS EN SIMULACION EFICIENTE DE REDES DE REGULACION GENETICA EN PRESENCIA DE ESTOCASTICIDAD III) DESARROLLO DE NUEVOS METODOS DE BIFURCACION QUE PERMITAN EL ANALISIS NOLINEAL DE CIRCUITOS BIOMOLECULARES TENIENDO EN CUENTA EL EFECTO DE LA ESTOCASTICIDAD INHERENTE,EL PROYECTO NO SOLO AVANZARA SIGNIFICATIVAMENTE EL CAMPO DE LA BIOLOGIA SINTETICA SINO QUE ADEMAS, PERMITIRA MEJORAR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LA FUNCION CELULAR EN PRESENCIA DE RUIDO MOLECULAR, ASI COMO LA RELACION DE CARACTERISTICAS COMPLEJAS DE LAS REDES DE REGULACION ESTOCASTICAS (Y BIOCIRCUITOS MOLECULARES EN GENERAL) CON LA ROBUSTEZ FRENTE AL RUIDO MOLECULAR, BIOLOGIA SINTETICA\ANALISIS NOLINEAL\ESTOCASTICO\MODELO DINAMICO\CONTROL\DISEÑO AUTOMATICO
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