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PID2019-107931GA-I00

Financiado

PREDICCION DE EVOLUCION DE PROTEINAS CONSIDERANDO SELECCION SOBRE ESTABILIDAD Y...

TRADICIONALMENTE, LOS MODELOS DE EVOLUCION GENETICA HAN SIDO APLICADOS A LA RECONSTRUCCION ANCESTRAL DE MATERIAL GENETICO, SIN EMBARGO, EN LOS ULTIMOS AÑOS EL AREA ESTA EXPLORANDO LA PREDICCION DE EVOLUCION MEDIANTE EL DESARROLLO... ver más

01/01/2019

UVIGO

85K€

Presupuesto del proyecto: 85K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDADE DE VIGO No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 410

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01

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Participantes

UVIGO

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDADE DE VIGO

Total investigadores 410

Presupuesto del proyecto 85K€

Descripción del proyecto TRADICIONALMENTE, LOS MODELOS DE EVOLUCION GENETICA HAN SIDO APLICADOS A LA RECONSTRUCCION ANCESTRAL DE MATERIAL GENETICO, SIN EMBARGO, EN LOS ULTIMOS AÑOS EL AREA ESTA EXPLORANDO LA PREDICCION DE EVOLUCION MEDIANTE EL DESARROLLO DE MAPAS TEMPORALMENTE DINAMICOS DE FITNESS, IDEALMENTE, ESTA PREDICCION PERMITIRIA CONOCER DE ANTEMANO FUTURAS VARIANTES GENETICAS, HASTA LA FECHA POCOS ESTUDIOS SE HAN DESARROLLADO EN ESTA LINEA PERO, DESAFORTUNADAMENTE, LA PREDICCION DE EVOLUCION DE PROTEINAS TODAVIA NO SE HA EXPLORADO, UNA UTILIDAD RELEVANTE DE ESTA PREDICCION SE CENTRA EN EL DISEÑO DE TERAPIAS ORIENTADAS A INHIBIR PROTEINAS DIANA DE PATOGENOS, NOTESE QUE DIVERSAS ENFERMEDADES CAUSADAS POR PATOGENOS SON HABITUALMENTE TRATADAS CON TERAPIAS DE FARMACOS DISEÑADAS, ENTRE OTROS ASPECTOS, A PARTIR DE UNA EVALUACION DE DIANAS FARMACOLOGICAS DEL PATOGENO OBSERVADAS EN UN INSTANTE DADO, ESTA METODOLOGIA IGNORA PROCESOS DE EVOLUCION DE LAS PROTEINAS DIANA Y LA GENETICA DE POBLACIONES DEL PATOGENO, CONLLEVANDO A MENUDO A LA APARICION DE RESISTENCIA A LA TERAPIA Y AL REQUERIMIENTO DEL DISEÑO Y APLICACION DE UNA NUEVA TERAPIA, POR LO TANTO, ES ESPERADO QUE TERAPIAS QUE CONSIDERAN LA EVOLUCION DE SUS DIANAS MOLECULARES SERAN ACTIVAS DURANTE MAS TIEMPO QUE LAS TERAPIAS BASADAS EN METODOS TRADICIONALES, EN ESTE PROYECTO DESARROLLAREMOS UNA HERRAMIENTA DE PREDICCION DE EVOLUCION DE PROTEINAS QUE CONSIDERARA PROCESOS MOLECULARES Y POBLACIONES Y, COMO APLICACION PRACTICA, LA ORIENTAREMOS AL DISEÑO INTELIGENTE DE TERAPIAS MOLECULARES CONTRA VIH-1, INICIALMENTE DESARROLLAREMOS UNA HERRAMIENTA PARA LA SELECCION ENTRE ESCENARIOS EVOLUTIVOS ALTERNATIVOS, ESTIMA DE PARAMETROS EVOLUTIVOS DE PROTEINAS Y PARAMETROS POBLACIONALES A TRAVES DE APROXIMACION BAYESIANA COMPUTACIONAL, SE APLICARA LA ESTABILIDAD DE EMPAQUETAMIENTO Y ACTIVIDAD DE LAS PROTEINAS BAJO ESTUDIO PARA DEFINIR UN MAPA DE FITNESS QUE SERA USADO PARA EVALUAR EVENTOS EVOLUTIVOS Y PARA DETERMINAR LAS TASAS DE NACIMIENTO Y MUERTE DENTRO DE UN MODELO EVOLUTIVO BIRTH-DEATH, EL CUAL SERA USADO PARA MODELAR LA HISTORIA EVOLUTIVA HACIA EL FUTURO, EL METODO DE PREDICCION DE EVOLUCION SERA VALIDADO CON DATOS GENETICOS DE VIH-1 OBTENIDOS EN MUESTREOS LONGITUDINALES EN EL TIEMPO, ADICIONALMENTE ESTUDIAREMOS EL IMPACTO DE DIVERSOS ESCENARIOS EVOLUTIVOS SOBRE LA PRECISION DE LA PREDICCION DE EVOLUCION, COMO APLICACION A PROTEINAS DIANA DE FARMACOS DE VIH-1, USAREMOS EL METODO PARA OBTENER UN RANKING DE FARMACOS POR SU AFINIDAD CON LAS VARIANTES EVOLUTIVAMENTE ESPERADAS, AUNQUE EN ESTE PROYECTO APLICAREMOS EL METODO EVOLUTIVO A VIH-1, ESTE PODRA SER TAMBIEN APLICABLE A OTROS PATOGENOS Y EN ESTA LINEA PLANEAMOS EXTENDERLO A PROTEINAS DIANA DE TERAPIAS CONTRA POBLACIONES DE CELULAS TUMORALES, EVOLUCION MOLECULAR\EVOLUCION DE PROTEINAS\PREDICCION DE EVOLUCION\MODELOS DE EVOLUCION\GENETICA DE POBLACIONES\EVOLUCION DE VIRUS

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