Descripción del proyecto
EL OBJETIVO DEL PROYECTO ES EL DESARROLLO DE UNA PLATAFORMA UNIVERSAL PARA EL ANALISIS MULTIPLEXADO Y MULTIMODAL DE BIOMARCADORES PARA EL DIAGNOSTICO CLINICO. ESTA PLATAFORMA DE DIAGNOSTICO IN VITRO (IVD) PERMITIRIA DETECTAR Y MEDIR DIFERENTES COMBINACIONES DE BIOMARCADORES, INDEPENDIENTEMENTE DE SU NATURALEZA QUIMICA (PEPTIDO, PROTEINA, DNA, RNA, ETC.) CON EL MISMO CHIP Y CON LA MISMA TECNOLOGIA DE SENSORES, USANDO NANOPARTICULAS APROPIADAMENTE FUNCIONALIZADAS.PARA CONSEGUIR ESTE OBJETIVO SE PROPONE UNA ESTRATEGIA BASADA EN PREPARAR PARA CADA BIOMARCADOR, NANOPARTICULAS CODIFICADAS CON OLIGONUCLEOTIDOS Y PARTICULAS MAGNETICAS, AMBAS FUNCIONALIZADAS CON EL BIORECEPTORS CORRESPONDIENTE (ANTICUERPOS, OLIGONUCLEOTIDOS, ETC.). EN EL CASO MAS SIMPLE, AMBAS PARTICULAS INTERACCIONARIA CON EL BIOMARCADOR EN UNA CONFIGURACION DE TIPO SANDWICH. LAS PARTICULAS CODIFICADAS CON LOS OLIGONUCLEOTIDOS (CODIGOS) PERMITIRAN IDENTIFICAR EL BIOMARCADOR, ADEMAS DE ACTUAR AMPLIFICANDO LA SEÑAL PRIMARIA RESULTANTE DE LA INTERACCION BIOMOLECULAR. A SU VEZ, LAS PARTICULAS MAGNETICAS SERVIRAN PARA SEPARAR LOS COMPLEJOS DEL RESTO DE LA MATRIZ, LOS CUALES PODRAN SER TRATADOS PARA LIBERAR LOS OLIGONUCLEOTIDOS DE LAS NANOPARTICULAS DE ORO, QUE SERAN CAPTURADOS EN EL MICROARRAY DE DNA. ESTA ESTRATEGIA SE DEMOSTRARA ABORDANDO LA DETECCION DE BIOMARCADORES DE DOS IMPORTANTES ENFERMEDADES COMO SON LAS CARDIOVASCULARES (CVDS) Y EL CANCER, Y SELECCIONANDO BIOMARCADORES DE DIFERENTE NATURALEZA QUIMICA. EL PRINCIPAL OBJETIVO DEL SUBPROYECTO 1 ES DEMOSTRAR ESTA ESTRATEGIA MEDIANTE LA DETECCION DE BIOMARCADORES DE CVDS, COMO PRUEBA DE CONCEPTO, Y UTILIZANDO MICROARRAYS DE DNA FLUORESCENTES (DNA-FMICROARRAY). LA INVESTIGACION REALIZADA SERVIRA DE BASE PARA LA DETECCION DE BIOMARCADORES DE OTRAS ENFERMEDADES, COMO POR EJEMPLO EL CANCER DE PANCREAS (SUBPROYECTO 2) Y LA IMPLEMENTACION SOBRE UN SENSOR DNA MULTIPLEXADO (DNA-ESENSOR) DESARROLLADO POR EL IBEC (SUBPROYECTO 3). EN BASE A SU EXPERIENCIA, LA CONTRIBUCION DEL GRUPO AMR TENDRA LUGAR FUNDAMENTALMENTE A TRAVES DE LAS TAREAS 1, 3 Y 4, DIRIGIDAS A I) DESARROLLAR BIORECEPTORES (ANTICUERPOS Y OLIGONUCLEOTIDOS) CONTRA CVDS Y ESTABLECER SUS CONDICIONES DE USO, II) EL DESARROLLO DE LOS PROCEDIMIENTOS PARA LA PREPARACION DE LAS NANOPARTICULAS BIOHIBRIDAS DE MANERA REPRODUCIBLE, Y III) EL ESTABLECIMIENTO DE LAS CONDICIONES DE ENSAYO DE ACUERDO CON LA ESTRATEGIA PROPUESTA UTILIZANDO EL DNA-FMICROARRAY. EN ESTE CONTEXTO, LA METODOLOGIA SERA INICIALMENTE EVALUADA CON ESTE SISTEMA PARA DESPUES SER TRANSFERIDA AL DNA-ESENSOR EN COLABORACION CON EL IBEC (TAREA 6). UN ASPECTO CLAVE SERA ENCONTRAR LA RELACION OLIGONUCLEOTIDO:BIORECEPTOR APROPIADA PARA CONSEGUIR LA DETECTABILIDAD NECESARIA CONSIDERANDO LA AMPLIFICACION QUE CADA BIOMARCADOR REQUIERE. ASI PUES UNA DE LAS APORTACIONES DE ESTA ESTRATEGIA ES LA POSIBILIDAD DE EXPANDIR EL RANGO DINAMICO DEL DISPOSITIVO MULTIPLEXADO MEDIANTE LA MODULACION DE LA CARGA DE OLIGONUCLEOTIDOS DE LAS NANOPARTICULAS PARA CADA BIOMARCADOR. FINALMENTE, EN COLABORACION CON EL RESTO DE GRUPOS, LAS PLATAFORMAS UNIVERSALES SERAN EVALUADAS ANALITICAMENTE CON EL OBJETIVO DE DEMOSTRAR LA UNIVERSALIDAD Y LA POSIBILIDAD DE REALIZAR ANALISIS MULTIPLEXADO Y MULTIMODAL DE MANERA FIABLE PARA LA DETERMINACION DE BIOMARCADORES DE RELEVANCIA CLINICA (TAREA 7). ANOPARTICULAS BIOFUNCIONALES\TECNICAS BIOANALITICAS\ANALISIS MULTIPLEXADO\DIAGNOSTICO CLINICO\SENSORES ELECTROQUIMICOS\OLIGONUCLEOTIDOS\INMUNOQUIMICA\ANTICUERPOS\MICROARRAY\BIOFUNCIONALIZACION DE MATERIALES