Descripción del proyecto
LAS PLANTAS SON ORGANISMOS SESILES, POR ELLO HAN DESARROLLADO MECANISMOS MOLECULARES QUE LES PERMITEN ADAPTAR SU DESARROLLO A LOS CAMBIOS EN EL MEDIO AMBIENTE DE UNA FORMA PRECISA. EN CONSECUENCIA, ESTOS MECANISMOS DEBEN TENER LA CAPACIDAD DE DETECTAR ESAS VARIACIONES Y, ADEMAS, INTEGRAR INFORMACION PROVENIENTE DE DIFERENTES SEÑALES AMBIENTALES. DOS SEÑALES AMBIENTALES MUY IMPORTANTES PARA EL DESARROLLO DE LAS PLANTAS A LO LARGO DE TODO SU CICLO VITAL SON LA LUZ Y LA TEMPERATURA. ESTUDIOS MOLECULARES RECIENTES HAN REVELADO QUE SUS RUTAS DE SEÑALIZACION ESTAN ENTRELAZADAS, CULMINANDO ASI CON CAMBIOS TRANSCRIPCIONALES COMUNES QUE, A SU VEZ, ADAPTAN EL CRECIMIENTO DE LAS PLANTAS DE UNA FORMA SIMILAR. SIN EMBARGO, A PESAR DE LAS IMPORTANTES CONEXIONES ENCONTRADAS A NIVEL TRANSCRIPCIONAL, NO SE SABE NADA SOBRE OTROS MECANISMOS MOLECULARES QUE TAMBIEN PUEDEN AFECTAR A LA INTERRELACION MOLECULAR ENTRE LA LUZ Y LA TEMPERATURA, COMO POR EJEMPLO EL SPLICING ALTERNATIVO (AS). EL SPLICING SUCEDE CUANDO LOS SITIOS DE SPLICING, EN EL PRECURSOR DEL ARN MENSAJERO, SON RECONOCIDOS POR EL ESPLICEOSOMA; ESTO PROVOCA QUE LOS INTRONES SE ELIMINEN, Y LOS EXONES FLANQUEANTES SE UNAN PARA GENERAR EL ARN MENSAJERO MADURO. SIN EMBARGO, NO TODOS LOS SITIOS DE SPLICING SON RECONOCIDOS CADA VEZ QUE UN GEN SE TRANSCRIBE, LO QUE CONDUCE AL AS, UN PROCESO QUE ES MODULABLE A TRAVES DE LA UNION DE FACTORES DE SPLICING, TALES COMO, LAS PROTEINAS SR Y HNRNP. SORPRENDENTEMENTE, LA MAYORIA DE ESTOS FACTORES MUESTRAN PATRONES DINAMICOS DE EXPRESION, SPLICING Y FOSFORILACION, EN RESPUESTA A SEÑALES AMBIENTALES; SIN EMBARGO, TODAVIA SE SABE MUY POCO SOBRE LA FUNCION DE ESTOS EVENTOS MOLECULARES EN LAS VIAS DE SEÑALIZACION QUE PERMITEN ADAPTAR EL DESARROLLO A LAS CONDICIONES AMBIENTALES. EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES DEFINIR LA FUNCION DE LOS FACTORES DE SPLICING COMO REGULADORES DEL CRECIMIENTO EN RESPUESTA A SEÑALES AMBIENTALES DE LUZ Y TEMPERATURA, UN OBJETIVO RESPALDADO POR NUESTROS DATOS PRELIMINARES. EN UN PRIMER MOMENTO, A TRAVES DE ESTUDIOS DE FENOTIPO, IDENTIFICAREMOS LOS FACTORES DE SPLICING QUE REGULAN EL CRECIMIENTO EN RESPUESTA A CAMBIOS EN LAS CONDICIONES DE LUZ Y TEMPERATURA. UNA VEZ IDENTIFICADOS, DEFINIREMOS LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE REGULAN SU ACTIVIDAD, ASI COMO LOS CAMBIOS EN LOS PATRONES DE SPLICING REGULADOS POR ESTAS PROTEINAS. POR TANTO, ESTE PROYECTO ESCLARECERA LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE PERMITEN A ESTOS ESTOS FACTORES DE SPLICING TRANSDUCIR SEÑALES AMBIENTALES Y PRODUCIR CAMBIOS CONCRETOS EN EL DESARROLLO.ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION SE LLEVARA A CABO EN EL ORGANISMO MODELO ARABIDOPSIS THALIANA; NO OBSTANTE, LOS CAMBIOS EN LAS CONDICIONES DE LUZ Y TEMPERATURA TAMBIEN AFECTAN AL DESARROLLO DE PLANTAS DE INTERES AGRICOLA, LO QUE CAUSA UN IMPACTO EN LA PRODUCTIVIDAD DE LAS MISMAS. DADA LA CRECIENTE DEMANDA DE ALIMENTOS, ASI COMO LOS EFECTOS DEL CALENTAMIENTO GLOBAL A LOS QUE NUESTRA SOCIEDAD ESTARA EXPUESTA EN UN FUTURO CERCANO, EXISTE LA NECESIDAD DE TRASPASAR EL CONOCIMIENTO GENERADO EN ARABIDOPSIS A ESPECIES AGRICOLAS. DEBIDO A ESTA NECESITAD, EN EL MARCO DE ESTE PROYECTO, NUESTRO OBJETIVO ES IMPLEMENTAR EN ORYZA SATIVA LAS HERRAMIENTAS GENOMICAS CREADAS PARA EL ESTUDIO DE AS EN ARABIDOPSIS: VAS-TOOLS, PARA DETECTAR Y CUANTIFICAR CAMBIOS EN EL PATRON DE SPLICING A PARTIR DE DATOS DE RNA-SEQ; Y PASTDB, UNA BASE DE DATOS PUBLICA CON DATOS DE AS EN MULTIPLES TEJIDOS Y CONDICIONES AMBIENTALES DE ARABIDOPSIS THALIANA. RECIMIENTO VEGETAL\ORYZA SATIVA\ARABIDOPSIS THALIANA\REGULADORES DEL SPLICING\TERMOMORFOGENESIS\FOTOMORFOGENESIS\GENOMICA\TRANSCRIPTOMICA\SPLICING ALTERNATIVO\EXPANSION CELULAR