ORIGEN, EVOLUCION Y ADAPTACION EN PATOGENOS DEL GENERO CANDIDA: UNA APROXIMACION...
ORIGEN, EVOLUCION Y ADAPTACION EN PATOGENOS DEL GENERO CANDIDA: UNA APROXIMACION GENOMICA Y TRANSCRIPTOMICA
COMO SE HA ILUSTRADO TRISTEMENTE DURANTE LA ACTUAL PANDEMIA DE COVID-19, LOS SERES HUMANOS (PERO TAMBIEN LOS CULTIVOS, LOS ANIMALES, Y LOS ECOSISTEMAS) ESTAN EXPUESTOS A UNA AMENAZA CONSTANTE POR LA APARICION DE NUEVOS PATOGENOS....
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Descripción del proyecto
COMO SE HA ILUSTRADO TRISTEMENTE DURANTE LA ACTUAL PANDEMIA DE COVID-19, LOS SERES HUMANOS (PERO TAMBIEN LOS CULTIVOS, LOS ANIMALES, Y LOS ECOSISTEMAS) ESTAN EXPUESTOS A UNA AMENAZA CONSTANTE POR LA APARICION DE NUEVOS PATOGENOS. SIN EMBARGO, A PESAR DE LA RELEVANCIA DE ESTE PROCESO EVOLUTIVO, TODAVIA TENEMOS UN COMPRENSION MUY INCOMPLETA SOBRE COMO APARECEN NUEVOS ORGANISMOS PATOGENOS Y COMO ESTOS SE ADAPTAN AL INTERACCIONAR CON EL SER HUMANO. LAS LEVADURAS PATOGENAS DEL GENERO CANDIDA SON UN CASO PARADIGMATICO PARA ESTUDIAR LA APARICION EVOLUTIVO DE LA PATOGENESIS OPORTUNISTA HACIA UN DETERMINADO HOSPEDADOR, YA QUE EN ESTE CLADO LA CAPACIDAD DE INFECTAR A LOS HUMANOS HA SURGIDO DE FORMA INDEPENDIENTE EN OCASIONES MULTIPLES Y RECURRENTES. ADEMAS, LOS PATOGENOS DEL GENERO CANDIDA SON UN PROBLEMA MEDICO IMPORTANTE Y QUE GENERAN UNA CRECIENTE PREOCUPACION, YA QUE LAS INFECCIONES SUPERFICIALES POR ESTOS ORGANISMOS SON COMUNES (POR EJEMPLO, LA CANDIDIASIS VULVOVAGINAL AFECTA AL 75% DE LAS MUJERES AL MENOS UNA VEZ A LO LARGO DE SU VIDA) Y LA CANDIDASIS INVASIVA CONSTITUYE UNA DE LAS PRINCIPALES FUENTES DE INFECCION HOSPITALARIA ASOCIADA CON NIVELES MUY ALTOS DE MORTALIDAD (30- 40%). ESTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO ACLARAR QUE RASGOS Y FACTORES PROMOVIERON LA CAPACIDAD DE INFECTAR A LOS HUMANOS EN ALGUNOS LINAJES DE CANDIDA Y NO EN OTROS Y QUE ADAPTACIONES RECIENTES PUEDEN HABER APARECIDO COMO RESULTADO DE INTERACCIONES ESTABLECIDAS CON EL HUESPED HUMANO. PARA ELLO, SEGUIREMOS UN ENFOQUE COMPARATIVO UTILIZANDO EL POTENCIAL COMBINADO DE LA GENOMICA, LA TRANSCRIPTOMICA, LA BIOINFORMATICA Y LA EDICION DEL GENOMA EN UN CONJUNTO DE DIVERSAS ESPECIES DE CANDIDA Y SUS PARIENTES NO PATOGENOS MAS CERCANOS. EN PRIMER LUGAR, SENTAREMOS LAS BASES PARA LA EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR EN CANDIDA, MEDIANTE LA EVALUACION DE LAS TASAS DE MUTACION Y LOS PATRONES DE VARIACION DENTRO DE LAS POBLACIONES CLONALES. EN SEGUNDO LUGAR, UTILIZAREMOS ENFOQUES INTEGRADORES Y DE FENOTIPADO A GRAN ESCALA PARA AVANZAR EN LA COMPRENSION DE LAS BASES GENETICAS DE LOS RASGOS DE VIRULENCIA RELEVANTES Y COMO VARIAN ENTRE ESPECIES Y AISLAMIENTOS. EN TERCER LUGAR, CONSIDERAREMOS LAS POSIBLES FUENTES AMBIENTALES DE ESTOS PATOGENOS E INVESTIGAREMOS SI LOS AISLAMIENTOS AMBIENTALES Y CLINICOS DIFIEREN GENETICA O FENOTIPICAMENTE. SE PRESTARA ESPECIAL ATENCION AL PAPEL POTENCIAL DE LA HIBRIDACION EN LA FORMACION DE NUEVAS ESPECIES CON UN MAYOR POTENCIAL PATOGENICO. FINALMENTE, BASANDONOS EN NUESTROS RESULTADOS ANTERIORES Y DESARROLLANDO UNA METODOLOGIA NOVEDOSA PARA ESTUDIAR LAS INTERACCIONES HUESPED-PATOGENO-MICROBIOTA, ESTUDIAREMOS COMO LAS DIFERENTES ESPECIES DE CANDIDA (Y CELULAS INDIVIDUALES) INTERACTUAN CON LA MUCOSA DEL HOSPEDADOR DURANTE LA INFECCION Y LA COLONIZACION COMENSAL. UN ASPECTO NOVEDOSO DE NUESTRO PROYECTO ES LA CONSIDERACION DE ARN LARGOS NO CODIFICANTES (LNCRNAS) RECIENTEMENTE DESCUBIERTOS POR NUESTRO EQUIPO EN ESTOS ORGANISMOS. ATOGENOS EMERGENTES\EVOLUCION GENOMICA\CANDIDA\INTERACCIONES HOSPEDADOR-PATOGENO\HONGOS PATOGENOS\GENOMICA COMPARADA
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