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PID2022-140399NB-I00

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Biología molecular y celular

UN GRAN DESAFIO CIENTIFICO EN BIOLOGIA ES COMPRENDER COMO MILES DE CELULAS COORDINAN DE MANERA DINAMICA SU COMPORTAMIENTO PARA CREAR O REPARAR ORGANOS COMPLEJOS QUE CONSISTEN EN DIFERENTES TEJIDOS CON GEOMETRIAS 3D ESPECIALIZADAS.... ver más

01/01/2022

EUROPEAN MOLECULAR...

363K€

Presupuesto del proyecto: 363K€

Líder del proyecto

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 50K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2022-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

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1 Participantes

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY L...

362.50K€ | Lider

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Líder del proyecto

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 363K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto UN GRAN DESAFIO CIENTIFICO EN BIOLOGIA ES COMPRENDER COMO MILES DE CELULAS COORDINAN DE MANERA DINAMICA SU COMPORTAMIENTO PARA CREAR O REPARAR ORGANOS COMPLEJOS QUE CONSISTEN EN DIFERENTES TEJIDOS CON GEOMETRIAS 3D ESPECIALIZADAS. CADA CELULA ES UN "AGENTE" QUE TOMA DECISIONES SOBRE SU DESTINO Y SOBRE SUS MOVIMIENTOS. EN EL CENTRO DE ESTAS DECISIONES HAY CIENTOS DE GENES INTERCONECTADOS EN REDES. ESTAS REDES REPRESENTAN EL "CEREBRO" DEL PROCESO DE TOMA DE DECISIONES EN LOS ORGANOS. PARA ENTENDER LOS ORGANOS, NECESITAMOS ACCEDER AL ESTADO DINAMICO DE LOS GENES EN ESTE "CEREBRO".EL PROYECTO DYNAMO-C3PO HA ELEGIDO UN EJEMPLO PARADIGMATICO DE ORGANOGENESIS, EL DESARROLLO DE LOS MIEMBROS DE LOS MAMIFEROS, Y SEGUIRA DOS ENFOQUES PRINCIPALES: EL DESARROLLO DE UNA NUEVA TECNOLOGIA OMICA Y EL DESARROLLO DE UN MODELO INFORMATICO.DURANTE LA ULTIMA DECADA, LA TRANSCRIPTOMICA UNICELULAR HA PROPORCIONADO UNA CAPACIDAD SIN PRECEDENTES DE ANALISIS DE LA EXPRESION GENICA. LAS TECNICAS QUE COMBINAN DATOS TRANSCRIPTOMICOS CON INFORMACION SOBRE LA UBICACION DE LAS CELULAS SE DENOMINAN TRANSCRIPTOMICA ESPACIAL Y SE HAN CONVERTIDO EN EL NUEVO "SANTO GRIAL" PARA MUCHOS CIENTIFICOS. EL ESTADO DEL ARTE ACTUAL PARA LA TRANSCRIPTOMICA ESPACIAL ES BIDIMENSIONAL, BASADO EN EL ANALISIS DE IMAGENES DE SECCIONES 2D DE TEJIDO. PERO LA BIOLOGIA ES INTRINSECAMENTE 3D Y DINAMICA: MUCHAS PREGUNTAS BIOLOGICAS NO SE PUEDEN ENTENDER SI SE EVALUAN SOLO MEDIANTE CORTES 2D A TRAVES DEL TEJIDO.EL LABORATORIO DE JAMES SHARPE ES INTERDISCIPLINARIO E INCLUYE EXPERIENCIA EN EMBRIOLOGIA, BIOLOGIA MOLECULAR, OMICA, OPTICA, IMAGENES MESOSCOPICAS Y MODELIZACION POR COMPUTADORA. DURANTE LOS ULTIMOS 4 AÑOS, EN COLABORACION CON LA MESOSCOPIC IMAGING FACILITY DE EMBL, HEMOS INVENTADO UNA NUEVA TECNOLOGIA LLAMADA C3PO (SOLICITUD DE PATENTE PRESENTADA EN DICIEMBRE DE 2022) QUE ES LA PRIMERA EN GENERAR DATOS OMICOS DIRECTAMENTE EN 3D. LOS METODOS ACTUALES PARA CODIFICAR LAS POSICIONES DE LAS CELULAS EN 2D UTILIZAN CODIGOS DE BARRAS MOLECULARES, PREDISEÑADOS EN UNA RED. POR EL CONTRARIO, C3PO (POSICIONAMIENTO TRIDIMENSIONAL DE CELULAS MEDIANTE CODIFICACION OPTICA) CODIFICA POSICIONES CELULARES OPTICAMENTE EN LUGAR DE MOLECULARMENTE. POR LO QUE SABEMOS, ESTE ES EL PRIMER INTENTO SERIO DE UTILIZAR LA CODIFICACION OPTICA Y TIENE LA VENTAJA ESPECIFICA DE PERMITIRNOS PASAR DE LA CODIFICACION 2D A LA CODIFICACION 3D. HEMOS LOGRADO HACER UNA PRUEBA DE CONCEPTO PARA C3PO, PERO AUN NO HEMOS HECHO UN ANALISIS TRANSCRIPTOMICA 3D POR COMPLETO, POR LO QUE EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PRESENTE ES ESTABLECER Y CONFIRMAR C3PO COMO UNA TECNOLOGIA CONFIABLE DE TRANSCRIPTOMICA 3D Y VALIDARLA UTILIZANDO METODOS INDEPENDIENTES.LA SEGUNDA PARTE DE DYNAMO-C3PO CONSISTE EN UTILIZAR DATOS TRANSCRIPTOMICOS 3D DEL BROTE DEL MIEMBRO DEL RATON EN DESARROLLO PARA CREAR UN MODELO COMPUTACIONAL 3D DE LAS REDES GENETICAS DINAMICAS QUE IMPULSAN LA ORGANOGENESIS. ESTO SE BASARA EN NUESTRO TRABAJO DURANTE LA ULTIMA DECADA EN SIMULACIONES POR COMPUTADORA DEL DESARROLLO DE EXTREMIDADES EN 2D Y 3D. COMPRENDER EL COMPORTAMIENTO ESTAS REDES DE GENES PROPORCIONARA INFORMACION SOBRE OTROS PROCESOS QUE DEPENDEN DE MUCHOS DE LOS MISMOS GENES QUE EL DESARROLLO DE LAS EXTREMIDADES, COMO EL CANCER, LAS CELULAS MADRE Y LA REGENERACION. ORGANOGENESIS\SIMULACION\MODELIZACION COMPUTACIONAL\EXPRESION GENICA\REGULACION DE GENES EN RED\DESARROLLO

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