OPTIMIZACION DE CONSORCIOS MICROBIANOS CON APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS CONDUCID...
OPTIMIZACION DE CONSORCIOS MICROBIANOS CON APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS CONDUCIDOS POR SYNECHOCOCCUS MEDIANTE EL USO DE HERRAMIENTAS DE BIOLOGIA DE SISTEMAS Y SINTETICA.
SYCOSYS TIENE COMO OBJETIVO DISECCIONAR, OPTIMIZAR Y MODELAR LOS FLUJOS DE ENERGIA Y MATERIA EN CONSORCIOS SINTETICOS DISEÑADOS A LA VEZ QUE LA OPTIMIZACION DE LAS CONDICIONES OPERATIVAS EN NUEVOS BIORREACTORES BASADOS EN COMUNIDA...
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Descripción del proyecto
SYCOSYS TIENE COMO OBJETIVO DISECCIONAR, OPTIMIZAR Y MODELAR LOS FLUJOS DE ENERGIA Y MATERIA EN CONSORCIOS SINTETICOS DISEÑADOS A LA VEZ QUE LA OPTIMIZACION DE LAS CONDICIONES OPERATIVAS EN NUEVOS BIORREACTORES BASADOS EN COMUNIDADES MICROBIANAS. MEDIANTE EL EMPLEO DE ENFOQUES DE BIOLOGIA DE SISTEMAS Y DE BIOLOGIA SINTETICA, SYCOSYS TIENE COMO OBJETIVO PROPORCIONAR CONOCIMIENTO MECANISTICO SOBRE COMO SE PUEDE DISEÑAR UN MICROBIOMA SINTETICO. SYCOSYS PROPORCIONARA UN BIOPROCESO ALTERNATIVO DE CERO EMISIONES NETAS DE CO2 ALIMENTADO POR CIANOBACTERIAS RECOMBINANTES QUE CATALIZARAN LA FIJACION DE CO2 EN AZUCARES FACILMENTE METABOLIZABLES. EN UN PROCESO CONTINUO, EL CARBONO ORGANICO PRODUCIDO POR LA CIANOBACTERIA ALIMENTARA A P. PUTIDA COMO FACTORIA CELULAR QUE SERA OPTIMIZADA PARA PRODUCIR TERPENOIDES CICLICOS PRECURSORES DEL ACIDO TEREFTALICO, COMPONENTE MAYORITARIO DEL POLIETILENO DE TEREFTALATO (PET), UN PLASTICO AMPLIAMENTE UTILIZADO. POR LO TANTO, SYCOSYS PROPORCIONARA UN PRIMER PASO HACIA LA PRODUCCION DE PET DE BASE BIOLOGICA.SYCOSYS OPTIMIZARA DIFERENTES CAPAS DE COMPONENTES BIOLOGICOS, INCLUIDO EL PRODUCTOR PRIMARIO Y LOS CONVERTIDORES SECUNDARIOS. EN PRIMER LUGAR, SE DISEÑARIA UNA CEPA DE CIANOBACTERIA SUPERPRODUCTORA DE SACAROSA SUPERIOR, QUE SEA CAPAZ DE PROPORCIONAR UNA TASA ALTA Y CONTINUA DE CARBONO ORGANICO PARA ALIMENTAR A LOS CONVERTIDORES SECUNDARIOS. PARA ELLO, SE OPTIMIZARA UNA VIA METABOLICA SINTETICA QUE CANALIZARA EL FLUJO DE CARBONO DESDE EL CICLO DE CALVIN HASTA SACAROSA. FINALMENTE, ESTA RUTA SINTETICA SE SOBREEXPRESARA HETEROLOGAMENTE EN LA CEPA DE CRECIMIENTO RAPIDO PROPORCIONADA POR EL SUBPROYECTO I. EN SEGUNDO LUGAR, SE DISEÑARA UNA NUEVA VIA METABOLICA SINTETICA QUE CONDUZCA LA PRODUCCION DE P-CIMENO Y P-CUMATO DESDE ACETIL-COA A TRAVES DE LA VIA DEL MEVALONATO EN P. PUTIDA. PARA ESTO, SE ABORDARA UNA OPTIMIZACION MODULAR DE LOS PASOS BIOQUIMICOS CLAVE QUE PRODUCEN LA PRODUCCION DE ESTOS TERPENOIDES CICLICOS UTILIZANDO ENFOQUES DE BIOLOGIA SINTETICA Y DE SISTEMAS. ADEMAS, SYCOSYS TAMBIEN EXPLORARA Y OPTIMIZARA NUEVOS PROCEDIMIENTOS DE FERMENTACION DE MICROBIOMAS BASADOS EN LA SEPARACION FISICA DE LAS CEPAS PRODUCTORAS Y CONVERTIDORAS. SE ABORDARAN VARIAS ESTRATEGIAS, INCLUIDA LA SEGREGACION ESPACIAL BASADA EN MEMBRANAS CERAMICAS SEMIPERMEABLES. COMO OBJETIVO TRANSVERSAL, SYCOSYS PROPORCIONARA ANALISIS DE SISTEMAS Y DISEÑO BASADO EN MODELOS A TODO EL CONSORCIO SYNECO. LOS MODELOS METABOLICOS A ESCALA DEL GENOMA SE UTILIZARAN A FONDO PARA DISEÑAR CEPAS PRODUCTORAS Y CONVERTIDORAS Y PARA COMPRENDER MEJOR EL METABOLISMO DE ESTAS CEPAS MODIFICADAS TANTO EN MONOCULTIVOS COMO EN MICROBIOMAS SINTETICOS.EN GENERAL, SYCOSYS PERSIGUE UN CAMBIO DE PARADIGMA EN LA SINTESIS DE PRODUCTOS QUIMICOS FINOS, REEMPLAZANDO LA PETROQUIMICA Y EL CULTIVO Y TRANSPORTE DE MATERIAS PRIMAS A GRAN ESCALA POR UN BIOPROCESO INTEGRADO QUE IMPLICA LA FIJACION NETA DE CO2 Y LA PRODUCCION DE MATERIAS PRIMAS EN EL MISMO ESCENARIO ESPACIOTEMPORAL QUE EL PROCESO DE BIOPRODUCCION
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