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AGL2011-25596

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OBTENCION DE UN MAPA CROMOSOMICO PRELIMINAR DEL CARIOTIPO DEL LENGUADO (SOLEA SE...

OBTENCION DE UN MAPA CROMOSOMICO PRELIMINAR DEL CARIOTIPO DEL LENGUADO (SOLEA SENEGALENSIS). INTEGRACION DEL MAPEO FISICO Y GENETICO EL LENGUADO (SOLEA SENEGALENSIS) ES UNA DE LAS ESPECIES MAS VALORADAS ECONOMICAMENTE EN LA ACUICULTURA PORQUE TRIPLICA EL PRECIO DE OTRAS ESPECIES COMERCIALES Y ES UN BUEN CANDIDATO PARA LA DIVERSIFICACION DE LOS MERCADOS EUROPEO... ver más

01/01/2011

UCA

91K€

Presupuesto del proyecto: 91K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE CÁDIZ No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1444

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UCA

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE CÁDIZ No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1444

Presupuesto del proyecto 91K€

Descripción del proyecto EL LENGUADO (SOLEA SENEGALENSIS) ES UNA DE LAS ESPECIES MAS VALORADAS ECONOMICAMENTE EN LA ACUICULTURA PORQUE TRIPLICA EL PRECIO DE OTRAS ESPECIES COMERCIALES Y ES UN BUEN CANDIDATO PARA LA DIVERSIFICACION DE LOS MERCADOS EUROPEOS, SATURADOS A CAUSA DE LA SUPERPRODUCCION DE DORADA Y LUBINA. SIN EMBARGO, HAY UNA SERIE DE BARRERAS QUE LIMITAN LA EXPANSION DE SU CULTIVO Y QUE SE CENTRAN EN EL CONTROL DE LA REPRODUCCION EN CAUTIVIDAD, LA METAMORFOSIS, Y LAS PATOLOGIAS.LA BIOTECNOLOGIA OFRECE NUEVAS HERRAMIENTAS Y OPORTUNIDADES PARA AYUDAR A CUMPLIR TODAS ESTAS DEMANDAS PARA FAVORECER UN CRECIMIENTO MAS RAPIDO DE LA PRODUCCION ACUICOLA. UNA DE ESTAS HERRAMIENTAS SON LOS MAPAS GENETICOS Y FISICOS INTEGRADOS QUE APORTAN UNA INFORMACION COMPLETA PARA COMPRENDER LA ESTRUCTURA DEL GENOMA Y SU FUNCION, Y POR ELLO SON RECURSOS EXTREMADAMENTE VALIOSOS EN AUSENCIA DE LA SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO DEL ORGANISMO. ADEMAS UN MAPA GENETICO ANCLADO FISICAMENTE PERMITE UN ENFOQUE ORIENTADO A LA SECUENCIACION COMPLETA DEL GENOMA. LA MICRODISECCION CROMOSOMICA Y MICROCLONACION OFRECE UN ENFOQUE DIRECTO PARA AISLAR CUALQUIER CROMOSOMA O EL ADN DE CUALQUIER REGION CITOGENETICAMENTE RECONOCIBLE DE UN CROMOSOMA. EL ADN AISLADO SE PUEDE UTILIZAR PARA LA GENERACION DE SONDAS DE PINTADO CROMOSOMICO, Y RASTREO DE GENOTECAS BAC. LOS BACS PERMITEN ASIGNAR Y ORGANIZAR LOS SCAFFOLDS GENOMICOS EN LOS BRAZOS CROMOSOMICOS ESPECIFICOS ASI COMO CONFIRMAR LA UBICACION DE SECUENCIAS ENSAMBLADAS SOBRE LOS CROMOSOMAS.EL LENGUADO PRESENTA UN CARIOTIPO CON 42 CROMOSOMAS, Y 48 BRAZOS CROMOSOMICOS, DISTRIBUIDOS EN 3 PAREJAS METACENTRICAS, 2 PAREJAS SUBMETACENTRICAS, 4 PAREJAS SUBTELOCENTRICAS Y 12 PARES CROMOSOMICOS ACROCENTRICOS. DISTINGUIR LAS PAREJAS DENTRO DE CADA UNA DE LAS CATEGORIAS ANTERIORES ES UNA TAREA ARDUA DEBIDO A SU SIMILITUD EN TAMAÑO Y MORFOLOGIA. MEDIANTE FISH ENCONTRAMOS MARCADORES PARA 2 PAREJAS CROMOSOMICAS, UNA SUBMETACENTRICA Y OTRA ACROCENTRICA. LA CARACTERIZACION Y RASTREO DE UNA GENOTECA BAC, NOS HA PERMITIDO LOCALIZAR POR FISH LOS CLONES BAC QUE CONTIENEN LOS GENES DE LA HEPCIDINA Y LISOZIMA (CADA UNO EN UNA PAREJA ACROCENTRICA), PROTEINA MX (UNA PAREJA SUBTELOCENTRICA, CON LO QUE PUEDE DISTINGUIRSE DE LA OTRA DE IGUAL TAMAÑO) Y UN RECEPTOR DE LA HORMONA TIROIDEA (TRB EN DOS PAREJAS ACROCENTRICAS). TENEMOS ADEMAS DOS CLONES ANONIMOS LOCALIZADOS (A3) EN UN PAR ACROCENTRICO Y (A7) (EN DOS PAREJAS ACROCENTRICAS). LAS DOBLES FISH HAN DESCARTADO CO-HIBRIDACION CON LO CUAL TENEMOS EN ESTE MOMENTO MARCADORES CROMOSOMICOS PARA 10 PAREJAS DE LAS 21 EXISTENTES EN EL GENOMA DEL LENGUADO, QUE NOS PERMITIRIAN DISTINGUIR 11 PAREJAS EN TOTAL. DURANTE EL DESARROLLO DE UN PROYECTO EN MARCHA (AQUAGENET) SECUENCIAREMOS EL GENOMA DEL LENGUADO UTILIZANDO TECNOLOGIA NGS. PARA COMPLETAR Y ANCLAR ESOS DATOS A UN MAPA GENETICO PROPONEMOS LA ELABORACION DE UN MAPA CROMOSOMICO DEL CARIOTIPO EN EL LENGUADO UTILIZANDO MICRODISECCION DE LOS CROMOSOMAS MARCADOS CON CLONES BAC DE REFERENCIA. LOS CROMOSOMAS SIN MARCADORES PREVIOS SERAN IDENTIFICADOS PARA MICRODISECCION POR BAC-FISH SUSTRACTIVA. LA MICRODISECCION NOS PERMITIRA OBTENER SONDAS ESPECIFICAS PARA CROMOSOMAS. LAS SECUENCIAS DE ESTOS CLONES FORMARAN UN SCAFFOLD INICIAL QUE SE INTEGRARA CON EL MAPA CROMOSOMICO Y ANALISIS DE MAPEO COMPARATIVO CON OTRAS ESPECIES DE PECES AL QUE SE ANCLARAN SECUENCIAS EST DISPONIBLES. APA CROMOSOMICO\SOLEA SENEGALENSIS\LENGUADO\MAPA GENETICO\MICRO-FISH\FISH-BAC

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