Descripción del proyecto
LA ARQUITECTURA Y FUNCION DE LOS GENOMAS VEGETALES ESTA MOLDEADA EN GRAN MEDIDA POR LA CONTINUA ADQUISICION DE GENES Y FUNCIONES GENICAS NUEVAS, CONSIDERADOS IMPORTANTES CONTRIBUYENTES A LA INNOVACION EVOLUTIVA Y LA ADAPTACION CON CONSECUENCIAS INMEDIATAS EN EL MAPA GENOTIPO-FENOTIPO, LOS GENES DUPLICADOS SON LA PRINCIPAL FUENTE DE MATERIAL GENETICO SOBRE EL QUE LA MUTACION, LA DERIVA GENICA Y LA SELECCION PUEDEN ACTUAR PARA EVOLUCIONAR FUNCIONES BIOLOGICAS ESPECIALIZADAS Y/O NOVEDOSAS Y SE HAN ENCONTRADO EN LA BASE DE ADAPTACIONES MORFOLOGICAS Y FISIOLOGICAS CLAVE DE LAS PLANTAS Y DE CARACTERISTICAS AGRONOMICAS DESEABLES, LOS GENES DUPLICADOS PUEDEN SURGIR DE DUPLICACIONES DEL GENOMA COMPLETO, QUE RESULTAN EN LA DUPLICACION DE CADA GEN, O DE DUPLICACIONES A PEQUEÑA ESCALA, QUE IMPLICAN SOLO UNO A UNOS POCOS GENES, LA DENOMINADA HIPOTESIS DEL BALANCE DE DOSIS (DB) HA ATRIBUIDO UN IMPORTANTE PAPEL AL MECANISMO DE DUPLICACION PARA EXPLICAR LA RETENCION DE GENES DESPUES DE LA DUPLICACION, I, E,, SU DUPLICABILIDAD, SIN EMBARGO, LAS RESTRICCIONES SELECTIVAS POR DB NO SON INDEFINIDAMENTE ACTIVAS Y OTROS MECANISMOS ESTARIAN TAMBIEN INFLUYENDO EN EL DESTINO EVOLUTIVO Y FUNCIONAL DE LOS GENES DUPLICADOS, INCLUIDOS ALGUNOS PROPIOS DE ESPECIE QUE REFLEJARIAN RESTRICCIONES ECOLOGICAS ESPECIFICAS Y RESALTARIAN LA COMPLEJIDAD DE LAS DINAMICAS EVOLUTIVAS QUE INFLUYEN EN LA DUPLICABILIDAD, ADEMAS DE LA DUPLICACION, OTRAS FUENTES GENOMICAS POTENCIALES MENOS EXPLORADAS DE NUEVOS GENES SON I) LA "DOMESTICACION" DE SECUENCIAS DE ADN ANCESTRALMENTE NO GENICAS, INCLUIDOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES, II) EVENTOS DE TRANSFERENCIA GENICA HORIZONTAL Y III) LA TRANSFERENCIA DE ADN Y GENES DE PLASTIDOS Y MITOCONDRIAS AL GENOMA NUCLEAR, REMINISCENTE DE LOS EVENTOS ENDOSIMBIOTICOS QUE DIERON LUGAR A LOS DISTINTOS ORGANULOS SUBCELULARES EN LA CELULA EUCARIOTA VEGETAL ANCESTRAL, AUNQUE EN LA MAYORIA DE LAS ESPECIES DE PLANTAS EL ADN DE LOS ORGANULOS REPRESENTA SOLO UNA PEQUEÑA FRACCION DE MENOS DEL 0,1% DEL GENOMA NUCLEAR, Y MUY POCAS MUESTRAN MAS DEL 1%, HEMOS REPORTADO RECIENTEMENTE UN FUERTE ENRIQUECIMIENTO DE ADN PLASTIDICO EN EL GENOMA NUCLEAR DEL CULTIVO HUERFANO MORINGA OLEIFERA, QUE REPRESENTA EL 4,71%, EL MAYOR REGISTRADO HASTA AHORA PARA UN GENOMA VEGETAL, ESTA OBSERVACION PLANTEA LA CUESTION DE QUE FUERZAS SELECTIVAS PUEDEN HABER OPERADO EN LINAJES ESPECIFICOS DE PLANTAS PARA PROMOVER LA TRANSFERENCIA REPETIDA DE CANTIDADES MASIVAS DE ADN DE LOS ORGANULOS AL NUCLEO, AUNQUE SE ESPERA QUE LA MAYORIA DE LOS GENES DE ORGANULOS TRANSFERIDOS ESTEN INACTIVOS AL LLEGAR AL NUCLEO, EVOLUCIONANDO COMO PSEUDOGENES O SECUENCIAS NO CODIFICANTES, EN CIERTAS OCASIONES SE HA REPORTADO QUE LOS GENES DE ORGANULOS RECIEN LLEGADOS ADQUIEREN LA CAPACIDAD DE EXPRESARSE EN EL NUCLEO O REMODELAN GENES NUCLEARES AGREGANDO SECUENCIAS CODIFICANTES (EXONES) O REGULADORAS ADICIONALES, SIN EMBARGO, SU IMPACTO EN LA EVOLUCION DE LA ARQUITECTURA Y FUNCION DEL GENOMA NUCLEAR Y, ESPECIALMENTE, SU CONTRIBUCION REAL A LA APARICION DE GENES Y FUNCIONES GENICAS NUEVAS AUN NO SE HA ACLARADO, CON EL FIN DE DESENTRAÑAR LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE IMPULSAN LA EVOLUCION DE NUEVOS GENES Y FUNCIONES GENICAS NOVEDOSAS EN PLANTAS, EVALUANDO LA CONTRIBUCION RELATIVA DE LAS DIFERENTES FUENTES GENOMICAS DE DIVERSIDAD GENETICA, PROPONGO AQUI UN PROGRAMA DE INVESTIGACION INTERDISCIPLINAR QUE INTEGRA LA GENOMICA EVOLUTIVA Y LA BIOINFORMATICA DENTRO DE UN MARCO ESTADISTICO Y DE APRENDIZAJE AUTOMATICO ROBUSTO, GENOMICA EVOLUTIVA\BIOLOGIA VEGETAL\BIOLOGIA DE SISTEMAS\BIOINFORMATICA\BIG DATA\ESTADISTICA\APRENDIZAJE AUTOMATICO\DUPLICACION GENICA\DUPLICACION GENOMICA\ADN ORGANELAR