EUIN2013-51160
Financiado
NEW BIOINFORMATICS TOOL TO INTEGRATE, UNDERSTAND AND EXPLOIT BIOMEDICAL CLINICAL...
NEW BIOINFORMATICS TOOL TO INTEGRATE, UNDERSTAND AND EXPLOIT BIOMEDICAL CLINICAL DATA STORED IN NETWORKED BIOBANKS
EL OBJETIVO DEL PROYECTO ES DESARROLLAR UNA HERRAMIENTA BIOINFORMATICA QUE PERMITA SOLUCIONAR EL CUELLO DE BOTELLA, RELACIONADO CON EL USO DE LAS IMAGENES Y OTRO TIPO DE DATOS QUE SE OBTIENEN DE LAS MUESTRAS ALMACENADAS EN LOS BI...
EL OBJETIVO DEL PROYECTO ES DESARROLLAR UNA HERRAMIENTA BIOINFORMATICA QUE PERMITA SOLUCIONAR EL CUELLO DE BOTELLA, RELACIONADO CON EL USO DE LAS IMAGENES Y OTRO TIPO DE DATOS QUE SE OBTIENEN DE LAS MUESTRAS ALMACENADAS EN LOS BIOBANCOS, LOS BIOBANCOS SON LAS ENTIDADES QUE ALMACENAN Y SUMINISTRAN MUESTRAS BIOLOGICAS, COMO POR EJEMPLO, TEJIDOS TUMORALES, PARA REALIZAR SUS PROYECTOS, LOS INVESTIGADORES NECESITAN MUESTRAS DE CARACTERISTICAS ESPECIFICAS Y/O EN GRAN NUMERO, LOS BIOBANCOS DE TUMORES O TEJIDOS SE CARACTERIZAN POR GUARDAR LAS MUESTRAS EN DIFFERENTES CONDICIONES, PRINCIPALMENTE CONGELADAS O INCLUIDAS EN PARAFINA O OCT (OPTIMUN CUTTING TEMPERATURE), LA DIGITALIZACION DE LAS MUESTRAS IMPLICA EL ALMACENAMIENTO MASIVO DE MILES DE GB DE DATOS INCLUYENDO IMAGENES HISTOLOGICAS E INFORMACION ADICIONAL (INFORME ANATOMOPATOLOGICO, PROCEDIMIENTOS PROPIOS DEL BIOBANCO, RESULTADOS DE ENSAYOS ADICIONALES
), LA NATURALEZA DE LAS IMAGENES HISTOLOGICAS ES MUY HETEROGENA, TANTO A NIVEL DE PATOLOGIAS COMO DE EQUIPOS QUE TOMAN LAS IMAGENES DE LAS MISMAS (APERIO, HAMMAMATSU, OLYPMPUSBX61,,), ASI COMO DE LOS METODOS DE TINCION UTILIZADOS PARA LA CARACTERIZACION/DIAGNOSTICO DE CADA UNA DE LAS MUESTRAS (HEMATOXILINA-EOSINA, INMUNOHISTOQUIMICA, INMUNOFLUORESCENCIA,,), LOS BIOBANCOS SUPONEN UNA BASE DE DATOS CON UN ENORME POTENCIAL A LA HORA DE AVANZAR EN EL DESARROLLO DE NUEVAS TERAPIAS Y EN EL DESARROLLO DE LA MEDICINA PERSONALIZADA, A LA VEZ QUE PUEDEN TENER UN PAPEL FUNDAMENTAL EN LA FORMACION TANTO DE INVESTIGADORES COMO DE MEDICOS PARA EL DIAGNOSTICO Y CONOCIMIENTO CELULAR DE DIFERENTES PATOLOGIAS, PERO EL ACCESO A ESTA INFORMACION ESTA EN LA ACTUALIDAD MUY LIMITADO POR LA IMPOSIBILDAD DE COMPARTIR Y COMPARAR LAS IMAGENES OBTENIDAS DE DIFERENTES BIOBANCOS NO SOLO EN DISTINTOS PAISES SINO EN UN MISMO PAIS O INCLUSO EN UNA MISMA REGION, EL POTENCIAL IMPACTO DEL USO DE ESTE TIPO DE DATOS AUN ES MAS EVIDENTE EN EL CASO DE LAS ENFERMEDADES RARAS DE LAS QUE SOLO EXISTEN UNAS POCAS MUESTRAS DISTRIBUIDAS EN DIFERENTES BIOBANCOS A NIVEL MUNDIAL, EL DESARROLLO DE UNA HERRAMIENTA TIPO GOOGLE, PERMITIRA QUE SE PUEDA LLEVA A CABO UN INTERCAMBIO Y UN FLUJO EFICIENTE Y CONTINUO DE DATOS ENTRE LOS SOCIOS DEL PROYECTO, NO SOLO DE LAS IMAGENES HISTOLOGICAS SINO DE OTRO TIPO DE DATOS ASOCIADOS, ADEMAS, SE PODRA MEJORAR LA CAPTURA, ORGANIZACION Y ALMACENAMIENTO DE LOS DATOS, ASI COMO LA INTEROPERABILIDAD ENTRE LOS DISTINTOS BIOBANCOS, ADEMAS, EL PROYECTO PERMITIRA DESARROLLAR NUEVOS ENFOQUES PARA LA NORMALIZACION DE LOS DATOS Y PARA EL DESARROLLO DE LOS PROCEDIMIENTOS NORMALIZADOS DE GESTION DE MUESTRAS, GRACIAS AL DESARROLLO DEL PROYECTO SE PODRA MEJORAR LA ACCESIBILIDAD Y LA FACILIDAD DE USO DE LOS DATOS BIOMEDICOS RELACIONADOS CON LAS MUESTRAS ALMACENDAS DE FORMA SEGURA, Y TENIENDO EN CUENTA LA LOPD PROPIA DE CADA PAIS,ESTE OBJETIVO SE ENCUENTRA PERFECTAMENTE ALINEADO CON EL OBJETIVO GENERAL NUMERO 4 DE LA ESTRATEGIA ESPAÑOLA DE CIENCIA, TECNOLOGIA E INNOVACION: EL FOMENTO DE ACTIVIDADES DE I+D+I ORIENTADAS A LOS RETOS GLOBALES DE LA SOCIEDAD, Y EN ESPECIAL A AQUELLOS QUE AFECTAN A LA SOCIEDAD ESPAÑOLA Y EN CONCRETO AL OBJETIVO ESPECIFICO NUMERO 11: SALUD, CAMBIO DEMOGRAFICO Y BIENESTAR, EL PROYECTO SE ENCUENTRA PEFECTAMENTE ALINEADO ADEMAS CON LOS OBJETIVOS INCLUIDOS EN HORIZONTE 2020 (H2020) EL PROGRAMA DE TRABAJO 2014-2015 DEL RESTO SOCIAL 1: SALUD, CAMBIO DEMOGRAFICO Y BIENESTAR, BIOBANCO\ PATOLOGÍA DIGITAL\ IMÁGENES HISTOLÓGICAS\ INVESTIGACION TRASLACIONAL\ BIOINFORMATICA\ DATOS\ INTEROPERABILIDAD\ ALMACENAMIENTO\ LENGUAGE NATURAL
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
25K€
Líder del proyecto
FUNDACION VASCA DE INNOVACION E INVESTIG
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Perfil tecnológico
TRL
4-5
1M
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