Descripción del proyecto
EN NUESTRA PROPUESTA EL PRINCIPAL OBJETIVO ES EL USO DE METODOS Y HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES PARA MODELAR PROCESOS EMERGENTES DINAMICOS, FOCALIZAREMOS NUESTROS OBJETIVOS Y PROPUESTAS EN DOS PROBLEMAS BIOLOGICOS DIFERENTES CON LOS QUE ESTAMOS INVESTIGANDO: EL PROBLEMA DEL PLEGADO TEMPORAL DE PROTEINAS Y ESPECIALMENTE LA MODELIZACION DEL CRECIMIENTO TUMORAL, LOS PROBLEMAS CORRESPONDEN A DIFERENTES APLICACIONES, PERO TIENEN EN COMUN EL COMPORTAMIENTO EMERGENTE QUE LOS CARACTERIZA, POR LO QUE PUEDEN MODELARSE CON ESQUEMAS COMO AUTOMATAS CELULARES (AC), QUE PROVEEN Y MODELAN SU NATURALEZA DINAMICA Y EMERGENTE, ESTE MODELADO ES DIFERENTE A LA MAYORIA DE LA INVESTIGACION PREVIA,EN EL PRIMER CASO, AL CONTRARIO QUE LA INTENSA INVESTIGACION EN LA PREDICCION DIRECTA DE LAS ESTRUCTURAS SECUNDARIA Y TERCIARIA DE LAS CONFORMACIONES FINALES PLEGADAS, NUESTRO INTERES ES DIFERENTE, YA QUE MODELAREMOS EL PROCESO DE PLEGADO TEMPORAL Y DINAMICO, LOS ESQUEMAS DE AC DEFINIRAN COMO LOS AMINOACIDOS INTERACCIONAN A LO LARGO DEL TIEMPO PARA OBTENER UNA CONFORMACION PROTEICA PLEGADA, LOS OBJETIVOS PRINCIPALES SON: GENERALIZAR Y EXTENDER LOS MODELOS CLASICOS DE AC PARA ESTA APLICACION, INTEGRAR INFORMACION DE LA ESTRUCTURA SECUNDARIA EN EL MODELADO DEL PLEGADO Y USO DE COMPUTACION EVOLUTIVA PARA OBTENER DE MODO AUTOMATICO LOS MODELOS,EL SEGUNDO PROBLEMA ES EL CRECIMIENTO TUMORAL, COMO CONSECUENCIA EMERGENTE DE LAS INTERACCIONES ENTRE LAS CELULAS Y SU ENTORNO, EL ESTADO DE UNA CELULA DEPENDERA DE UNA SERIE DE RASGOS CARACTERISTICOS DEL CANCER Y DE SU ENTORNO INMEDIATO, QUE DEFINEN EL ESTADO DE UNA CELULA Y SU COMPORTAMIENTO MITOTICO, EN CONTRASTE A LA INVESTIGACION PREVIA: 1, MINIMIZAREMOS EL PROCESO DE DISEÑO PARA OBTENER UN MODELADO REALISTICO DEL SISTEMA MULTICELULAR CON LA INTEGRACION DE DIFERENTES METODOLOGIAS DE COMPUTACION NATURAL, 2, EL MODELADO NOS PERMITIRA UN ESTUDIO DETALLADO DEL PROCESO DINAMICO EN LAS CONDICIONES FRONTERA QUE CONDUCEN AL DESARROLLO DE CANCER, HAY UNA FALTA DE TRABAJOS PREVIOS SOBRE UN ESTUDIO TEORICO DEL COMPORTAMIENTO DEL SISTEMA CELULAR EN TERMINOS DE TEORIA DE LA INFORMACION, REALIZAREMOS TAL ANALISIS CON UN ESTUDIO CUALITATIVO Y CUANTITATIVO, Y ESPECIALMENTE EN ESAS CONDICIONES FRONTERA, 3, COMPARAREMOS Y VALIDAREMOS LOS RESULTADOS DE NUESTRA MODELIZACION CON LOS RESULTADOS EXPERIMENTALES EN DOS ASPECTOS CRUCIALES: 3,1, VALIDACION EN CULTIVOS CELULARES "IN VITRO" DE LOS ESCENARIOS DETERMINADOS CON LA MODELIZACION "IN SILICO" Y QUE ESTAN EN LAS CONDICIONES FRONTERA, Y 3,2, ESTABLECIENDO LOS PROTOCOLOS ADECUADOS DE APLICACION DE TRATAMIENTO DE CANCER EN ESCENARIOS ESPECIFICOS, ESPECIALMENTE CONSIDERANDO LA IMPLICACION DE CELULAS MADRE DE CANCER EN EL ORIGEN DE LAS RECAIDAS DE CRECIMIENTO TUMORAL, ESTAS VALIDACIONES SE HARAN EN COLABORACION CON EL CENTRO ONCOLOGICO GALLEGO,EN AMBOS CASOS, ESTOS ESQUEMAS PERMITIRAN CARACTERIZAR LOS PROCESOS INVOLUCRADOS, USANDO MEDIDAS COMO ENTROPIA E INFORMACION MUTUA, ASI, LA INTEGRACION DE DIFERENTES METODOLOGIAS DE COMPUTACION NATURAL NOS PERMITIRA OBTENER AMBOS PROPOSITOS: EL MODELADO DE LOS PROCESOS Y SU ANALISIS DESDE EL PUNTO DE VISTA DE TEORIA DE LA INFORMACION,NUESTRA INVESTIGACION Y METODOS Y OBJETIVOS ALTERNATIVOS EN AMBAS APLICACIONES LLEVARAN A TRANSFERENCIA DE CONOCIMIENTO RELEVANTE PARA EL DISEÑO DE PROTEINAS O DROGAS PARA PROPOSITOS ESPECIFICOS Y PARA UN MEJOR CONOCIMIENTO DEL PROCESO DE CRECIMIENTO TUMORAL PARA ESTABLECER PROTOCOLOS DE TRATAMIENTO ADECUADOS, COMPORTAMIENTO EMERGENTE\ VIDA ARTIFICIAL\ COMPUTACIÓN NATURAL\ BIOLOGÍA DE SISTEMAS\ PREDICCIÓN DE ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS\ MODELADO DE CRECIMIENTO DE CÁNCER.