Descripción del proyecto
LOS MODELOS MATEMATICOS SON ESENCIALES EN BIOLOGIA DE SISTEMAS Y PROPORCIONAN NUEVOS MODOS DE ENTENDER LA FUNCION DE LOS SISTEMAS BIOLOGICOS, AYUDANDO EN LA GENERACION DE NUEVAS HIPOTESIS VERIFICABLES, Y DANDO APOYO A UN MARCO RACIONAL PARA POSIBLES VIAS DE INTERVENCION, COMO POR EJEMPLO EN INGENIERIA GENETICA PARA LA MEJORA DE LA PRODUCCION INDUSTRIAL EN BIOTECNOLOGIA, EN DESARROLLO DE MEDICAMENTOS O EN TRATAMIENTO DE ENFERMEDADES, DADO QUE LA CANTIDAD Y CALIDAD DE LOS DATOS EXPERIMENTALES PROVENIENTES DE LAS ¿OMICS¿ CONTINUAN AUMENTANDO RAPIDAMENTE, HAY UNA GRAN NECESIDAD DE DISPONER DE METODOS PARA ANALIZAR Y CONSTRUIR ADECUADAMENTE MODELOS QUE PUEDAN MANEJAR DICHA COMPLEJIDAD,EN ESTE PROYECTO, NOS CENTRAMOS EN EL MODELADO MULTI-ESCALA DE SISTEMAS BIOLOGICOS, ES DECIR, MODELOS QUE INCLUYEN DIVERSAS ESCALAS DESDE EL MICRO (POR EJEMPLO, MODELOS DE REDES METABOLICAS) AL MACRO (POR EJEMPLO, MODELOS DE BIOPROCESOS UTILIZADOS EN EL CONTEXTO DE LA ¿PROCESS ANALYTICAL TECHNOLOGY¿ (PAT) PARA ¿SCREENING¿, MONITORIZACION ESTADISTICA Y CONTROL), EL PROYECTO PRETENDE DESARROLLAR Y APLICAR NUEVOS METODOS Y HERRAMIENTAS PARA CONSTRUIR Y ANALIZAR MODELOS MULTI-ESCALA A PARTIR DE DATOS INCIERTOS, TIPICAMENTE ESCASOS AUNQUE CON UNA INFORMACION RICA O BIEN ABUNDANTES PERO CON ESCASA INFORMACION, CENTRANDOSE EN LOS SIGUIENTES EJES O LINEAS PRINCIPALES DE INVESTIGACION:I, HERRAMIENTAS Y METODOS PARA LA CONSTRUCCION DE MODELOS, INCLUYENDO ANALISIS DE IDENTIFICABILIDAD, ESTIMACION DE PARAMETROS (CALIBRACION DE MODELOS), MODELADO DE LA INCERTIDUMBRE Y DISEÑO OPTIMO DE EXPERIMENTOS, ANALISIS SOBRE COMO CONECTAR APROXIMACIONES ¿BOTTOM-UP¿ CON ¿TOP-DOWN¿, CONOCIMIENTO BASADO EN DATOS CONTRA CONOCIMIENTO BASADO EN MODELOS, Y COMPATIBILIDAD ENTRE MODELOS EN DIFERENTES NIVELES DE ABSTRACCION,II, HERRAMIENTAS Y METODOS DE ANALISIS DE MODELOS, INCLUYENDO ANALISIS DE SENSIBILIDAD GLOBAL, ANALISIS DE BIFURCACIONES, ANALISIS DE BALANCE DE FLUJOS DINAMICO, ANALISIS DE MODOS DE FLUJOS ELEMENTALES, Y TECNICAS DE REDUCCION DE MODELOS,III, APLICACION A LA PRODUCCION INDUSTRIAL BIOTECNOLOGICA, CON ESPECIAL ENFASIS EN COMO INFORMACION BIOLOGICA DE BAJO NIVEL OBTENIDA EN LOS EJES ANTERIORES PUEDE PROPORCIONAR INFORMACION VALIOSA AL NIVEL DEL BIORREACTOR, EN ESTE PUNTO, UNA PREOCUPACION IMPORTANTE SERA COMO INTEGRAR DATOS PROVENIENTES DE TODAS LAS ESCALAS EN EL MARCO PAT PROMOVIDO POR LA FDA ESTADOUNIDENSE, CONCRETAMENTE EN MONITORIZACION ESTADISTICA Y ACCIONES DE CONTROL,ESTOS NUEVOS METODOS Y HERRAMIENTAS SERAN VALIDADOS SOBRE UNA APLICACION INDUSTRIAL REAL, A ESTE FIN, LA COMPAÑIA BIOPOLIS S,L,, COMO ENTIDAD PROMOTORA ACTIVAMENTE PARTICIPE EN EL PROYECTO, PROVEERA ACCESO Y DEDICARA RECURSOS A EQUIPOS DE FERMENTACION Y BIOPROCESO DE ULTIMA GENERACION, EQUIPO ANALITICO, KOWN-HOW Y PERSONAL, EN CONCRETO, LAS METODOLOGIAS Y HERRAMIENTAS DESARROLLADAS EN EL PROYECTO SERAN APLICADAS AL ANALISIS Y CONTROL DE PRODUCCION DE PROTEINAS RECOMBINANTES EN LOS SISTEMAS INDUCIBLES BACTERIANO (E, COLI) Y EUCARIOTA (P, PASTORIS), ESTO PERMITIRA LA VALIDACION DE LOS DOS PRIMEROS EJES DE LA INVESTIGACION, PERMITIENDO UN CAMBIO DESDE LAS TRADICIONALES APROXIMACIONES AL DESARROLLO Y OPERACION BASADAS EN PRUEBA-Y-ERROR, HACIA APROXIMACIONES MAS SISTEMICAS Y RACIONALES, Ingeniería de Sistemas\Biología de Sistemas\Modelos multiescala\Identificación\Monitorización\Control no lineal