MODELADO, DISEÑO DE NOVO E INGENIERIA DE INTERRUPTORES DE RNA QUE RESPONDEN A SE...
MODELADO, DISEÑO DE NOVO E INGENIERIA DE INTERRUPTORES DE RNA QUE RESPONDEN A SEÑALES GENETICAS
EL MATERIAL GENETICO PUEDE SER PROGRAMADO PARA EXPRESAR SISTEMAS QUE DETECTEN, PROCESEN (SIGUIENDO CALCULOS LOGICOS) Y RESPONDAN A (EN FORMA DE EXPRESION GENICA) DIFERENTES SEÑALES MOLECULARES Y GENETICAS; POR LO TANTO, SU USO PAR...
EL MATERIAL GENETICO PUEDE SER PROGRAMADO PARA EXPRESAR SISTEMAS QUE DETECTEN, PROCESEN (SIGUIENDO CALCULOS LOGICOS) Y RESPONDAN A (EN FORMA DE EXPRESION GENICA) DIFERENTES SEÑALES MOLECULARES Y GENETICAS; POR LO TANTO, SU USO PARA ENFOCAR PROBLEMAS BIOTECNOLOGICOS O BIOMEDICOS (EN FORMA DE CELULAS O BIONANOSISTEMAS INGENIERIZADOS) ES INSTRUMENTAL, PARA LOGAR ESTE IMPORTANTE OBJETIVO, NECESITAMOS ESTABLECER BASES FUNDACIONALES SOBRE LA INGENIERIA DE SISTEMAS SINTETICOS, LO QUE IMPLICA UNA DETERMINACION DE CIERTOS PRINCIPIOS DE DISEÑO Y ESTRATEGIAS MODULARES PARA SU APLICACION, TRABAJOS RECIENTES HAN PROPORCIONADO IMPLEMENTACIONES GENETICAS DE PUERTAS LOGICAS, SISTEMAS BIESTABLES Y OSCILADORES A NIVEL TRANSCRIPCIONAL, EN ESTE PROYECTO, APROVECHANDO LA MAYOR DISEÑABILIDAD Y PROGRAMABILIDAD DE LOS ACIDOS NUCLEICOS, VAMOS A UTILIZAR EL CONOCIMIENTO ACTUAL DE LA CIENCIA DE ARN PARA, EN PRIMER LUGAR, DESARROLLAR MODELOS CUANTITATIVOS QUE DESCRIBAN CON PRECISION LAS CARACTERISTICAS FUNDAMENTALES Y EL COMPORTAMIENTO DINAMICO DE CIRCUITOS DE ARNS REGULADORES, Y EN SEGUNDO LUGAR, LLEVAR A CABO LA INGENIERIA DE INTERRUPTORES SINTETICOS DE ARN CON DIVERSAS FUNCIONALIDADES EN CELULAS VIVAS A NIVEL POST-TRANSCRIPCIONAL, APROVECHANDO UNA PLATAFORMA DE CELULA UNICA QUE PERMITE MONITORIZAR LA EXPRESION GENICA CON EL TIEMPO TRAS UNA INDUCCION DINAMICA, OBTENDREMOS VALORES CUANTITATIVOS PARA LAS CONSTANTES CINETICAS DE LAS REACCIONES BIOQUIMICAS DEL SISTEMA, ESTO PERMITIRA DESARROLLAR UN MODELO MATEMATICO PARA CARACTERIZAR EL CONTROL Y LA SENSIBILIDAD DE LA EXPRESION GENICA DE UN INTERRUPTOR SINTETICO DE ARN, ADEMAS, VAMOS A ESTUDIAR TEORICAMENTE LA CAPACIDAD DE LOS PEQUEÑOS ARNS, NO SOLO PARA REGULAR UN GEN DIANA, SINO PARA INTERACTUAR CON FACTORES DE TRANSCRIPCION EN LA CREACION CIRCUITOS DE REGULACION QUE PERMITAN ALCANZAR COMPORTAMIENTOS COMPLEJOS, EN PARTICULAR, VAMOS A EXPLORAR LA INTERACCION CON REGULADORES EPIGENETICOS PARA MODULAR LA DETERMINACION DEL DESTINO CELULAR, EXPERIMENTALMENTE, VAMOS A DISEÑAR Y PONER EN PRACTICA DOS TIPOS DE INTERRUPTORES DE ARN CONTROLANDO UN ELEMENTO REPORTERO FLUORESCENTE, AMBOS DENTRO DE UN CONTEXTO CELULAR, POR UNA PARTE, INTERRUPTORES ENCENDIDOS POR OTRA MOLECULA DE ARN (PEQUEÑO ARN), PARA ELLO, VAMOS A CONSIDERAR UN MARCO DE RIBOREGULACION DONDE EL PEQUEÑO ARN INTERACTUA CON LA REGION 5' NO TRADUCIDA (EL ELEMENTO DE INTERRUPCION) DE UN ARN MENSAJERO PARA REGULAR LA TRADUCCION, VAMOS A DISEÑAR UN ANDAMIO DE ARN BASADO EN LA SECUENCIA DE UN VIROIDE A FIN DE AUMENTAR LA ESTABILIDAD DE LOS RIBOREGULADORESS Y TAMBIEN SU RANGO DINAMICO, POR OTRA PARTE, VAMOS A REUTILIZAR EL MECANISMO CRISPR/DCAS, DESARROLLADO PARA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION, PARA LA DETECCION ESPECIFICA DE SECUENCIAS DE ADN, PARA ELLO, VAMOS A COMBINAR LAS SECUENCIAS GUIA, EL APTAMERO SPINACH Y LA HORQUILLA DE RECONOCIMIENTO DE DCAS9, ESTOS INTERRUPTORES SERAN CAPACES DE INFORMAR SOBRE LA PRESENCIA DE UNA SECUENCIA DE ADN DADA EN LA CELULA A TRAVES DE LA EMISION DE FLUORESCENCIA, EN SUMA, EL IMPACTO EN CIENCIA BASICA DE ARN Y BIOLOGIA SINTETICA, ASI COMO LAS APLICACIONES ACTUALES Y EN PERSPECTIVA, HACEN ESTA INVESTIGACION MULTIDISCIPLINAR OPORTUNA Y PERTINENTE, BIOLOGÍA DE SISTEMAS\BIOLOGÍA SINTÉTICAver más
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