Descripción del proyecto
LOS TELOMEROS GARANTIZAN LA REPLICACION DE LOS EXTREMOS DE LOS CROMOSOMAS, CONTRIBUYEN A MANTENER LA ESTABILIDAD GENOMICA E INFLUYEN EN PROCESOS BIOLOGICOS RELEVANTES COMO EL ENVEJECIMIENTO, EL CANCER O LAS ENFERMEDADES, LA FUNCION DE LOS TELOMEROS REQUIERE LA INTEGRIDAD DE LA HETEROCROMATINA, QUE, EN MUCHOS ORGANISMOS COMO ARABIDOPSIS THALIANA, CONTIENE ELEVADOS NIVELES DE METILACION DE CITOSINA, HEMOS DESCRITO ANTERIORMENTE QUE LAS CITOSINAS DE LOS TELOMEROS DE ARABIDOPSIS NO SE METILAN, NO OBSTANTE, LAS CITOSINAS SUBTELOMERICAS ESTAN MUY METILADAS, ADEMAS, HEMOS DESCUBIERTO QUE CIERTOS MUTANTES DE METILACION DEL ADN TIENEN TELOMEROS CORTOS, EN CONSECUENCIA, EN BASE EN ESTOS RESULTADOS, HEMOS PLANTEADO LA HIPOTESIS DE QUE LA METILACION DEL ADN SUBTELOMERICO JUEGA UN PAPEL IMPORTANTE EN LA FUNCION DE LOS TELOMEROS,ESTE PROYECTO SE CENTRA EN LA CARACTERIZACION DE LA METILACION DEL ADN SUBTELOMERICO DE ARABIDOPSIS Y EN EL ANALISIS DE SU RELEVANCIA FUNCIONAL, SE PRESTARA ESPECIAL ATENCION A LAS FRONTERAS TELOMERO-SUBTELOMERO, QUE, HASTA DONDE SABEMOS, NO HAN SIDO CARACTERIZADAS PREVIAMENTE, NUESTROS RESULTADOS NO PUBLICADOS REVELAN QUE ESTAS FRONTERAS SON REGIONES DE TRANSICION CARACTERIZADAS POR UN CAMBIO EN LA ORGANIZACION GENETICA Y EPIGENETICA Y QUE PODRIAN TENER RELEVANCIA FUNCIONAL, REALIZAREMOS Y ANALIZAREMOS EXPERIMENTOS DE SECUENCIACION CON BISULFITO DEL GENOMA COMPLETO (WGBS) EN LA ESTIRPE SILVESTRE Y EN MUTANTES ALTERADOS EN LOS TRES TIPOS DE METILACION DEL ADN QUE TIENE LUGAR EN ARABIDOPSIS (CG, CHG Y CHH, DONDE H ES A, C O T), APLICANDO TECNICAS BIOINFORMATICAS Y ESTADISTICAS ESTUDIAREMOS LA RELACION ENTRE LOS DISTINTOS TIPOS DE METILACION Y ENTRE ESTOS Y LAS SECUENCIAS DE ADN SUBTELOMERICO, ESTOS ANALISIS DEBERIAN PERMITIRNOS COMPRENDER COMO SE MANTIENE LA METILACION DEL ADN SUBTELOMERICO, ADEMAS, DEBERIAN COMPLEMENTAR Y AMPLIAR LOS ANALISIS DEL GENOMA COMPLETO PUBLICADOS ANTERIORMENTE, QUE NO SE CENTRAN EN LOCI CROMOSOMICOS ESPECIFICOS, ESPERAMOS QUE LOS SUBTELOMEROS DE ARABIDOPSIS SE CONVIERTAN EN UN BUEN SISTEMA MODELO PARA EL ESTUDIO DE LA METILACION HETEROCROMATINICA DEL ADN,ANALIZAREMOS LA FUNCION DE LOS TELOMEROS EN LOS MUTANTES DE METILACION DEL ADN, MAS CONCRETAMENTE, ANALIZAREMOS LA LONGITUD DE LOS TELOMEROS, LAS FRECUENCIAS DE RECOMBINACION Y DE FUSIONES TELOMERICAS Y LA VIABILIDAD DE LAS CELULAS MERISTEMATICAS DE LA RAIZ, DE PARTICULAR INTERES RESULTARA EL ESTUDIO DE MUTANTES GENERADOS MEDIANTE EL USO DE LA TECNOLOGIA CRISPR-CAS9 EN LOS QUE ESTE ALTERADA LA METILACION DE SUBTELOMEROS ESPECIFICOS, ESTOS MUTANTES NOS PERMITIRAN DETERMINAR SI EXISTE UNA RELACION CAUSAL ENTRE LA METILACION DEL ADN SUBTELOMERICO Y LA FUNCION DE LOS TELOMEROS,ESTA PROPUESTA CONTINUA EL PROYECTO QUE ESTAMOS REALIZANDO Y QUE SE CENTRA EN LOS TELOMEROS DE ARABIDOPSIS Y HUMANOS (BIO2016-78955-P: CARACTERIZACION ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DE REGIONES TELOMERICAS DE ARABIDOPSIS THALIANA Y ANALISIS DE CROMATINA TELOMERICA EN OTROS SISTEMAS MODELO), AUNQUE ALGUNOS DE LOS RESULTADOS QUE HEMOS OBTENIDO SOBRE LOS TELOMEROS DE ARABIDOPSIS YA HAN SIDO PUBLICADO (GENOME RESEARCH, 2016, 26: 10471056), MUCHOS OTROS, INCLUIDAS LAS FIGURAS 1 Y 2 DE ESTA PROPUESTA, NO SE HAN PUBLICADO AUN, POR OTRA PARTE, LA MAYORIA DE LOS RESULTADOS QUE HEMOS OBTENIDO SOBRE LOS TELOMEROS HUMANOS YA HAN SIDO PUBLICADOS (NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2018, 46: 2347-2355; TRENDS IN CELL BIOLOGY, 2019, 29: 281-290; CELLS, 2019, 8: 1050), CROMATINA\EPIGENETICA\METILACION DEL DNA\SUBTELOMEROS\TELOMEROS\ARABIDOPSIS THALIANA