Descripción del proyecto
EL PRESENTE PROYECTO SE CENTRA EN LA LEGUMINOSA LOTUS JAPONICUS, UNA PLANTA QUE SE UTILIZA COMO MODELO PARA EL ESTUDIO DE ESPECIES CULTIVADAS DE LOTUS DE GRAN INTERES AGRONOMICO Y OTRAS LEGUMINOSAS, EN NUESTRO LABORATORIO LLEVAMOS TRABAJANDO 20 AÑOS CON ESTA PLANTA Y HEMOS PUBLICADO RECIENTEMENTE VARIOS TRABAJOS SOBRE SU RESPUESTA TRANSCRIPTOMICA Y METABOLOMICA A CONDICIONES DE ESTRES ABIOTICO, EN EL PRESENTE PROYECTO QUEREMOS ABORDAR EN PRIMER LUGAR UNO DE LOS PRINCIPALES PROBLEMAS PARA EL USO DE TECNICAS OMICAS EN EL ESTUDIO DE ESTA ESPECIE, QUE ES LA FALTA DE HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA EL ANALISIS CONJUNTO DE GRANDES CANTIDADES DE DATOS CON EL FIN DE PODER IDENTIFICAR NUEVOS GENES QUE PARTICIPEN O CONTROLEN UNA DETERMINADA RUTA METABOLICA, UNA VEZ DESARROLLADAS ESTAS HERRAMIENTAS, SE VAN A UTILIZAR PARA LA BUSQUEDA DE NUEVOS GENES IMPLICADOS EN LA FOTORRESPIRACION Y LA BIOSINTESIS DE FLAVONOIDES E ISOFLAVONOIDES, ESTAS DOS RUTAS SON DE CRUCIAL IMPORTANCIA PARA EL METABOLISMO Y LA PRODUCTIVIDAD DE LAS LEGUMINOSAS: POR UN LADO SON RUTAS CON UN ALTO FLUJO METABOLICO, Y POR OTRO ESTAN IMPLICADAS EN LA RESPUESTA DE LA PLANTA A DISTINTAS CONDICIONES DE ESTRES ABIOTICO, UNO DE LOS FACTORES QUE MAS LIMITA LA PRODUCTIVIDAD DE LAS ESPECIES CULTIVADAS DE LOTUS ASI COMO DE OTRAS LEGUMINOSAS, EN EL CASO DE LA FOTORRESPIRACION, SE PRETENDE IDENTIFICAR NUEVOS GENES INVOLUCRADOS EN LOS PROCESOS DE TRANSPORTE DE METABOLITOS ENTRE DISTINTOS ORGANULOS Y EN LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL DE ESTA RUTA, DOS TOPICOS QUE HAN SIDO POCO ESTUDIADOS HASTA AHORA, UNA VEZ IDENTIFICADOS LOS GENES DE INTERES, SE OBTENDRAN LINEAS MUTANTES DE L, JAPONICUS DESDE LAS DISTINTAS COLECCIONES QUE ESTAN AHORA YA DISPONIBLES PARA GENETICA INVERSA (TILLING Y MUTANTES DE INSERCION DE TRANSPOSON LORE1), Y SE LLEVARA A CABO SU CARACTERIZACION FENOTIPICA ASI COMO NUEVOS ESTUDIOS DE TRANSCRIPTOMICA Y METABOLOMICA, SE VA TAMBIEN A PROFUNDIZAR EL ESTUDIO DE LA RESPUESTA TRANSCRIPCIONAL DE LOS GENES FOTORRESPIRATORIOS A SITUACIONES DE ESTRES ABIOTICO PARECIDAS A LAS QUE SE SUELEN DAR ACTUALMENTE EN LOS CAMPOS DONDE SE CULTIVA LOTUS, UTILIZANDO PLANTAS SILVESTRES Y MUTANTES FOTORRESPIRATORIOS PREVIAMENTE AISLADOS EN NUESTRO LABORATORIO, OTRO OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES LA OBTENCION DE LOS PERFILES DE METABOLITOS SECUNDARIOS PRODUCIDOS POR PLANTAS SILVESTRES Y MUTANTES SOMETIDAS A DISTINTOS TIPOS DE ESTRES ABIOTICO, CON UN PARTICULAR INTERES EN LOS FLAVONOIDES E ISOFLAVONOIDES, ADEMAS DE PODER COMPARAR LA RESPUESTA DEL METABOLISMO SECUNDARIO EN DISTINTAS CONDICIONES, SE ESPERA PODER IDENTIFICAR NUEVOS METABOLITOS PRODUCIDOS POR L, JAPONICUS EN RESPUESTA A ESTRES, UTILIZANDO LAS HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS DESARROLLADAS, SE PRETENDE TAMBIEN IDENTIFICAR LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION QUE ESTAN INVOLUCRADOS EN LA REGULACION DE LA BIOSINTESIS DE ESTOS COMPUESTOS EN LEGUMINOSAS, YA QUE ESTOS FACTORES SIGUEN SIN IDENTIFICAR, FINALMENTE, LA BIOSINTESIS DE FLAVONOIDES/ISOFLAVONOIDES Y LA FOTORRESPIRACION SON PROCESOS QUE ESTAN MUY RELACIONADOS CON LA FORMACION DE LOS NODULOS EN LEGUMINOSAS, OTRO DE LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO ES PROFUNDIZAR EL ESTUDIO DE ESTA RELACION, LOS RESULTADOS QUE SE PREVE OBTENER, ADEMAS DE ACLARAR ALGUNOS DE LOS MECANISMOS REGULATORIOS DE ESTAS RUTAS, PUEDEN RESULTAR DE PARTICULAR INTERES PARA COMPRENDER LA RESPUESTA DE LAS LEGUMINOSAS A CONDICIONES DE ESTRES ABIOTICO, UN TEMA DE CRUCIAL ACTUALIDAD EN LA AGRICULTURA SOSTENIBLE, LOTUS JAPONICUS\FOTORRESPIRACIÓN\METABOLISMO DEL NITRÓGENO\METABOLISMO SECUNDARIO\LEGUMINOSAS