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BFU2015-68351-P

Financiado

LOS DETERMINANTES MOLECULARES Y LAS CONSECUENCIAS EVOLUTIVAS DE LA VARIABILIDAD...

LOS DETERMINANTES MOLECULARES Y LAS CONSECUENCIAS EVOLUTIVAS DE LA VARIABILIDAD NO GENETICA EN EL FITNESS EN ORGANISMOS UNICELULARES O EN CANCER EL FITNESS SE CARACTERIZA COMO EL NUMERO DE DESCENDENCIA QUE UNA CELULA PUEDE PRODUCIR EN UN TIEMPO DETERMINADO, Y NORMALMENTE SE ASUME EL VALOR MEDIO DE POBLACION, SIN EMBARGO, EL CRECIMIENT... ver más

01/01/2015

UPF

166K€

Presupuesto del proyecto: 166K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Ver Participantes

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01

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Participantes

UPF

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA

Total investigadores 321

Presupuesto del proyecto 166K€

Descripción del proyecto EN ORGANISMOS UNICELULARES O EN CANCER EL FITNESS SE CARACTERIZA COMO EL NUMERO DE DESCENDENCIA QUE UNA CELULA PUEDE PRODUCIR EN UN TIEMPO DETERMINADO, Y NORMALMENTE SE ASUME EL VALOR MEDIO DE POBLACION, SIN EMBARGO, EL CRECIMIENTO CELULAR ES MUY VARIABLE Y TODA CELULA INDIVIDUAL DIFIERE DE LA MEDIA, ESTA VARIABILIDAD DE FITNESS TIENE CONSECUENCIAS MUY IMPORTANTES EN RESISTENCIA ANTIBIOTICA DE BACTERIAS O EN TUMORES RESISTENTES A QUIMIOTERAPIA, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES CARACTERIZAR LOS ACONTECIMIENTOS MOLECULARES QUE CONDUCEN A VARIABILIDAD EN EL CRECIMIENTO CELULAR DENTRO DE UNA POBLACION ISOGENICA, Y ENTENDER QUE EFECTO TIENE A LO LARGO DEL PROCESO EVOLUTIVO, DE MANERA PRELIMINAR, HEMOS MEDIDO LAS DISTRIBUCIONES DE FITNESS DE 1,600 CEPAS MUTANTES DE LEVADURA, EL PRIMER OBJETIVO DEL PROYECTO CONSISTE EN MEDIR LAS DISTRIBUCIONES DE CRECIMIENTO DE 90 MUTANTES RELACIONADOS CON LA RESPUESTA A ESTRES Y MODIFICACION DE LA CROMATINA, MAS 36 CEPAS NATURALES DISTINTAS GENETICAMENTE, TODAS EN 10 CONDICIONES AMBIENTALES DIFERENTES (1260 DISTRIBUCIONES), DE ESTA MANERA PODEMOS SER CAPACES DE IDENTIFICAR COMO EL GENOTIPO, Y SU INTERACCION CON EL AMBIENTE, PUEDEN AFECTAR LAS DISTRIBUCIONES DE CRECIMIENTO DE CELULAS A NIVEL INDIVIDUAL, NUESTROS DATOS PRELIMINARES SUGIEREN QUE POR CADA GENOTIPO, LA POBLACION DE CELULAS PUEDE DIVIDIRSE DOS SUBPOBLACIONES, DE CRECIMIENTO LENTO O RAPIDO, AUN ASI, LAS CELULAS PUEDEN SUFRIR UNA TRANSICION DE UN ESTADO A OTRO SEGUN SU GENOTIPO Y EL AMBIENTE, UTILIZAREMOS NUESTROS DATOS YA EXISTENTES Y LOS GENERADOS DE NUEVO PARA DESARROLLAR UN MODELO MATEMATICO QUE PUEDA PREDECIR LA VARIABILIDAD EN EL FITNESS TENIENDO EN CUENTA LA HABILIDAD DE LAS CELULAS PARA REVERSIBLEMENTE CAMBIAR DE ESTADO DE CRECIMIENTO, QUEREMOS UTILIZAR ESTE MODELO PARA PODER OBTENER ENTENDER MEJOR LOS MOTIVOS MECANISTICOS QUE A TRAVES DEL GENOTIPO Y EL AMBIENTE SON CAPACES DE ALTERAR EL CRECIMIENTO CELULAR,AUNQUE LAS TRANSICIONES ENTRE ESTADOS DE CRECIMIENTO PUEDEN SER MODELADAS COMO PROCESOS ESTOCASTICOS, LAS TRANSICIONES NO SON REALMENTE ESTOCASTICAS, SINO CAUSADAS POR EVENTOS MOLECULARES DESCONOCIDOS Y NO OBSERVADOS, QUEREMOS DETERMINAR LOS EVENTOS MOLECULARES PRECISOS QUE DETERMINAN LAS CELULAS A TRANSITAR ENTRE LOS DISTINTOS ESTADOS DE CRECIMIENTO, DATOS PRELIMINARES SUGIEREN QUE LA HERENCIA ESTOCASTICA DE LAS ORGANELAS ES UN FACTOR IMPORTANTE EN LA DETERMINACION DE ESTE ESTADO DE CRECIMIENTO, ASI OBTENDREMOS UNA EXPLICACION MECANISTICA PARA LAS DISTRIBUCIONES DE FITNESS MEDIDAS,LA RELACION ENTRE LA EFICIENCIA POR SELECCIONAR UN GENOTIPO Y EL RUIDO EXISTENTE ENTRE EL MAPA GENOTIPO-FENOTIPO ES UNA CUESTION DE MUCHO DEBATE PERO A LA VEZ, SE HAN GENERADO MUY POCOS DATOS EXPERIMENTALES, LA VARIABILIDAD NO GENETICA PUEDE ACELERAR LA SELECCION NATURAL PERMITIENDO A UN SOLO GENOTIPO EXPLORAR MULTIPLES GENOTIPOS, DE TODAS FORMAS, EL RUIDO REDUCE LA CAPACIDAD DE LA EVOLUCION PARA SELECCIONAR EL MEJOR FENOTIPO, LA VARIABILIDAD ISOGENICA EN EL FITNESS PUEDE FAVORECER O RETRASAR DICHA SELECCION, VAMOS A COMPARAR GRUPOS DE CEPAS MUTANTES CON UNA MISMA MEDIA DE FITNESS POBLACIONAL PERO DISTINTAS DISTRIBUCIONES DE FITNESS A NIVEL UNICELULAR,LAS ACTIVIDADES MAS FUNDAMENTALES PARA LA CELULA SON EL CRECIMIENTO Y LA DIVISION, COMBINANDO DATOS CUANTITATIVOS DE FITNESS DE ALTO RENDIMIENTO CON MODELOS MATEMATICOS, ESTE PROYECTO PROPORCIONARA UN MAYOR ENTENDIMIENTO DE LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE DETERMINAN EL FITNESS DE UNA CELULA, ESTOCASTICO\FITNESS\EXPRESION GENICA\BIOLOGIA COMPUTACIONAL\BIOLOGIA DE SISTEMAS\LEVEDURAS\VARIABILIDAD NO GENÉTICA\MODELOS MATEMÁTICOS

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