Descripción del proyecto
EL INCREMENTO DE LA RESISTENCIA BACTERIANA A ANTIBIOTICOS ESTA PROMOVIENDO EL ESTUDIO DE MECANISMOS ANTIBACTERIANOS ALTERNATIVOS. ESTO INCLUYE EL USO DE VIRUS QUE INFECTAN A BACTERIAS, DENOMINADOS BACTERIOFAGOS O FAGOS. ESTOS ESTAN CONSIDERADOS COMO LAS ENTIDADES BIOLOGICAS MAS ABUNDANTES EJERCIENDO UNA ENORME PRESION SELECTIVA SOBRE LAS BACTERIAS. EN RESPUESTA A ESTA PRESION, LAS BACTERIAS HAN DESARROLLADO MECANISMOS DE DEFENSA, DE LOS CUALES SOLO LOS SISTEMAS CRISPR-CAS CONFIEREN RESISTENCIA ADAPTATIVA. POR SU PARTE, LOS FAGOS HAN DESARROLLADO MECANISMOS DE ESCAPE, EN LO QUE SE HA DENOMINADO COMO UNA CARRERA ARMAMENTISTICA. LA BACTERIA MARINA MARINOMONAS MEDITERRANEA, CEPA MMB-1, TIENE DOS SISTEMAS CRISPR-CAS DE TIPOS I-F Y III-B, RESPECTIVAMENTE. ESTOS SISTEMAS CONFIEREN RESISTENCIA A PODOVIRUS. EL SISTEMA I-F POSEE ESPACIADORES QUE RECONOCEN ESOS FAGOS. ADEMAS, ESOS ESPACIADORES PUEDEN SER USADOS POR EL SISTEMA III-B LO QUE IMPIDE LOS MECANISMOS VIRALES PARA EVADIR EL SISTEMA I-F. SE HAN AISLADO DOS CEPAS ADICIONALES DE M. MEDITERRANEA. LAS TRES CEPAS POSEEN UN SISTEMA DE TIPO I-F. SIN EMBARGO, LA CEPA MMB-2 NO POSEE SISTEMA III-B Y EN LA CEPA MMB-3 ES DIFERENTE AL DE LA CEPA MMB-1. LAS CEPAS MMB-2 Y MMB-3 SON RESISTENTES A ALGUNOS PODOVIRUS PESE A NO POSEER ESPACIADORES QUE LOS RECONOZCAN EN SU LOCUS CRISPR. ESTO SUGIERE QUE LA RESISTENCIA ES DEBIDA A UN SISTEMA DE DEFENSA ALTERNATIVO A CRISPR-CAS. ANALISIS GENOMICOS HAN REVELADO LA PRESENCIA DE DIFERENTES SISTEMAS DE DEFENSA EN LAS TRES CEPAS DE M. MEDITERRANEA. NUESTRA HIPOTESIS ES QUE LA RESISTENCIA A ALGUNOS PODOVIRUS EN LAS CEPAS MMB-2 Y MMB-3 ES DEBIDA A ALGUNOS DE ESTOS SISTEMAS NOVEDOSOS. RESULTADOS PRELIMINARES AVALAN ESTA HIPOTESIS. POR EJEMPLO, HEMOS OBSERVADO QUE LOS FAGOS SON CAPACES DE INTRODUCIR EL ADN EN LAS CELULAS INICIANDO EL CICLO REPLICATIVO. ADEMAS, SE HAN AISLADO MUTANTES QUE ESCAPAN LOS MECANISMOS DE DEFENSA Y SON CAPACES DE INFECTAR A LA CEPA MMB-2 O A LA MMB-3. EL QUE NO SEAN CAPACES DE INFECTAR A LAS DOS INDICA QUE LOS MECANISMOS DE DEFENSA SON DIFERENTES ENTRE ELLAS. EL OBJETIVO DEL PROYECTO ES ESTUDIAR LA REGULACION DE LA RESPUESTA A FAGOS EN M. MEDITERRANEA Y CARACTERIZAR EL MECANISMO DE RESISTENCIA DE LAS CEPAS MMB-2 AND MMB-3. ANALISIS TRANSCRIPTOMICOS PERMITIRAN IDENTIFICAR LOS SISTEMAS INDUCIDOS EN ESTAS CEPAS QUE SERAN ESTUDIADOS EN PRIMER LUGAR COMO CANDIDATOS A SER RESPONSABLES DE LA RESISTENCIA A FAGOS EN ESTAS CEPAS. LOS SISTEMAS SERAN CLONADOS EN PLASMIDOS Y MOVILIZADOS A M. MEDITERRANEA MMB-1 CON DELECION DE LOS SISTEMAS CRISPR-CAS PARA DETERMINAR SI LE CONFIEREN RESISTENCIA. ADEMAS, SE CONSTRUIRAN MUTANTES DE MMB-2 Y MMB-3 CON DELECION DE LOS SISTEMAS ESTUDIADOS PARA DETERMINAR SU SENSIBILIDAD A FAGOS EN COMPARACION CON LAS CEPAS SILVESTRES,. SE CARACTERIZARA A NIVEL MOLECULAR EL MECANISMO DE ACCION DE LOS SISTEMAS DE DEFENSA DETECTADOS. LOS MUTANTES CON DELECION GENERADOS PODRIAN SERVIRAN TAMBIEN PARA EL AISLAMIENTO DE FAGOS NOVEDOSOS. EL PROYECTO PRESENTADO PROVEERA INFORMACION RELEVANTE PARA COMPRENDER LA INTERACCION ENTRE BACTERIAS Y FAGOS USANDO COMO MICROORGANISMO MODELO UNA BACTERIA MARINA. UN POTENCIAL INTERES ADICIONAL DE ESTOS ESTUDIOS ES QUE ALGUNOS SISTEMAS DE DEFENSA, DE FORMA DESTACADA LOS SISTEMAS CRISPR-CAS Y LAS ENZIMAS DE RESTRICCION, SE HAN CONVERTIDO EN IMPORTANTES HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS. ESTE PODRIA SER TAMBIEN EL CASO DE OTROS SISTEMAS DE DEFENSA QUE ESTAN POR CARACTERIZAR. ACTERIAS MARINAS\MECANISMOS DE DEFENSA\CRISPR-CAS\FAGOS