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PID2019-111676GB-I00

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LA EVOLUCION DE NUEVOS ARN QUE INTERACTUAN CON PIWI EN MAMIFEROS

ANTECEDENTES: LOS RETROTRANSPOSONES Y OTRAS REPETICIONES CONTRIBUYEN SUSTANCIALMENTE A LA DIVERSIDAD GENETICA EN UNA ESPECIE, A MUTACIONES ESPONTANEAS E INNOVACIONES REGULADORAS, LOS ARN QUE INTERACTUAN CON PIWI (PIRNA) UNIDOS A L... ver más

01/01/2019

FUNDACIO INSTITUT...

145K€

Presupuesto del proyecto: 145K€

Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA CONTRA LA LEUCEM... Actividades de investigación asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA CONTRA LA LEUCEM... Actividades de investigación asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 145K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto ANTECEDENTES: LOS RETROTRANSPOSONES Y OTRAS REPETICIONES CONTRIBUYEN SUSTANCIALMENTE A LA DIVERSIDAD GENETICA EN UNA ESPECIE, A MUTACIONES ESPONTANEAS E INNOVACIONES REGULADORAS, LOS ARN QUE INTERACTUAN CON PIWI (PIRNA) UNIDOS A LAS PROTEINAS PIWI REPRIMEN LA ACTIVIDAD DE LOS RETROTRANSPOSONES EN LA LINEA GERMINAL, LA REPRESION DE TRANSPOSONES ES ESENCIAL PARA UNA CORRECTA PROGRESION DE LA ESPERMATOGENESIS EM MAMIFEROS, LOS RETROTRANSPOSONES ESTAN ALTAMENTE ENRIQUECIDOS ENTRE LOS LOCI PRODUCTORES DE PIRNA Y ESTAN REPRIMIDOS TRANSCRIPCIONAL Y POSTRANSCRIPCIONALMENTE POR LOS PIRNA, CASI LA MITAD DE TODOS LOS LOCI PRODUCTORES DE PIRNA SON GENES CODIFICADORES DE PROTEINAS, PERO, HASTA LA FECHA, SE DESCONOCE POR QUE Y COMO SE SELECCIONAN CIERTOS GENES CODIFICANTES DE PROTEINAS PARA LA PRODUCCION DE PIRNA DURANTE LA GAMETOGENESIS, EL PAISAJE DINAMICO DE LAS INSERCIONES DE RETROTRANSPOSONES DE MAMIFEROS EN LOS GENES Y LA FUERTE ASOCIACION ENTRE LOS PIRNA Y LOS RETROTRANSPOSONES PLANTEAN LA CUESTION DE SI LAS INSERCIONES DE RETROTRANSPOSONES EN LOS GENES HAN DESENCADENADO LA PRODUCCION DE PIRNA A PARTIR DE ESTOS GENES,OBJETIVOS GENERALES Y ESPECIFICOS: EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES COMPRENDER EL EFECTO DE LAS INSERCIONES DE RETROTRANSPOSONES EN LA FUNCION GENETICA EN LA LINEA GERMINAL MASCULINA DE MAMIFEROS, LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS SON (1) COMPRENDER EL ALCANCE Y LAS CAUSAS GENETICAS DE LA VARIACION INTERINDIVIDUAL EN LA EXPRESION DE PIRNA EN EL RATON (2) PARA OBTENER UNA VISION MECANICISTA DE LA PRODUCCION DE PIRNA A PARTIR DE GENES QUE CODIFICAN PROTEINAS EN EL RATON (3) PARA COMPRENDER EL IMPACTO POTENCIAL DE INSERCIONES DE RETROTRANSPOSONES EN GENES EXPRESADOS EN LA LINEA GERMINAL MASCULINA,METODOLOGIA Y VIABILIDAD: DURANTE LOS ULTIMOS 2 AÑOS, MI LABORATORIO HA GENERADO UNA COLECCION DE 36 MUESTRAS DE SECUENCIAS DE RNAS PEQUEÑOS DE TESTICULOS Y ESPERMATOGONIAS DE 6 CEPAS DE RATONES AMPLIAMENTE UTILIZADAS, ESTA ES ACTUALMENTE LA MAYOR COLECCION DE DATOS DE ARN PEQUEÑO DE LINEA GERMINAL DE INDIVIDUOS GENETICAMENTE DIVERSOS DE CUALQUIER ESPECIE, EL ANALISIS PRELIMINAR DE ESTOS DATOS POR PARTE DE MI LABORATORIO HA LLEVADO AL DESCUBRIMIENTO DE UNA INSERCION RECIENTE DE RETROTRANSPOSON EN UN GEN CODIFICANTE DE RATON QUE EXPLICA PERFECTAMENTE LA APARICION DE UN NUEVO LOCUS PRODUCTOR DE PIRNA EN ESTA ESPECIE (DATOS NO PUBLICADOS DESCRITOS EN LA PROPUESTA), ESTE ES EL PRIMER EJEMPLO DE UN LOCUS POLIMORFICO PRODUCTOR DE PIRNA EN CUALQUIER VERTEBRADO, EN ESTE PROYECTO, DESCRIBO LOS ANALISIS BIOINFORMATICOS DE LOS DATOS EXISTENTES GENERADOS INTERNAMENTE JUNTO CON LOS DATOS DISPONIBLES A NIVEL PUBLICO PARA COMPRENDER MEJOR LA BASE GENETICA DE LA VARIACION INTERINDIVIDUAL EN LA PRODUCCION DE PIRNA EN UN MAMIFERO, PARA OBTENER UNA NUEVA VISION MECANICISTA DE LA PRODUCCION DE PIRNA Y COMPRENDER EL IMPACTO DE LAS INSERCIONES DE RETROTRANSPOSONES EN LOS GENES EXPRESADOS EN ESPERMATOGENESIS, PIRNA\PIWI\PEQUEÑOS RNAS NO CODIFICANTES\CELULAS GERMINALES\MPRONTA GENOMICA\TRANSPOSONES\RETROVIRUSES ENDOGENOS\RATON\BIOLOGIA COMPUTACIONAL\BIOINFORMATICA

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