PID2021-124315OB-I00
Financiado
INTEGRACION DE SEÑALES GENETICAS Y EPIGENETICAS ESPECIFICAS E INTERCALADAS COMO...
INTEGRACION DE SEÑALES GENETICAS Y EPIGENETICAS ESPECIFICAS E INTERCALADAS COMO HERRAMIENTA MULTIPLE PARA CARACTERIZAR EL CANCER COLORRECTAL
EL CANCER COLORRECTAL (CCR) ES EL CANCER MAS COMUN EN EUROPA. LAS ESTRATEGIAS MAS AVANZADAS PROPONEN LA COMBINACION DE DIFERENTES BIOMARCADORES EN LA RUTINA DIAGNOSTICA PARA MEJORAR LA DETECCION Y EL MANEJO DE LA ENFERMEDAD. LOS B...
EL CANCER COLORRECTAL (CCR) ES EL CANCER MAS COMUN EN EUROPA. LAS ESTRATEGIAS MAS AVANZADAS PROPONEN LA COMBINACION DE DIFERENTES BIOMARCADORES EN LA RUTINA DIAGNOSTICA PARA MEJORAR LA DETECCION Y EL MANEJO DE LA ENFERMEDAD. LOS BIOMARCADORES ACTUALES Y EMERGENTES INCLUYEN UNA AMPLIA GAMA DE ALTERACIONES COMO MUTACIONES PUNTUALES, AMPLIFICACIONES, FENOTIPOS HIPERMUTADORES, ADEMAS DE SUBTIPOS EPIGENETICOS Y DE EXPRESION GENICA, QUE REFLEJAN LA COMPLEJIDAD GENOMICA DEL CCR. NUESTRO PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO DESARROLLAR Y APLICAR UNA PLATAFORMA TODO EN UNO PARA ANALIZAR TODOS LOS BIOMARCADORES RELEVANTES CON POTENCIAL UTILIDAD CLINICA EN EL MANEJO DEL CCR. EL PROYECTO SE BASA EN DOS PARADIGMAS: (A) LA INTEGRACION DE TODOS LOS DATOS RELEVANTES EN UN PROCEDIMIENTO TODO EN UNO Y (B) EL USO DEL ALUOMA COMO UN BIOMARCADOR MULTIDIMENSIONAL INTEGRATIVO DE LA ESTRUCTURA Y REGULACION DEL GENOMA. ESTA PROPIEDAD DEL ALUOME SE BASA EN SU NATURALEZA INTERCALADA, SU FACIL ACCESO Y SU PAPEL COMO MULTIREPORTERO DE INFORMACION FUNCIONAL, INCLUYENDO CELULA DE ORIGEN, DERIVA EPIGENETICA, CONFORMACION Y REGIONALIZACION DEL GENOMA, Y REGULACION GENICA ESPECIFICA, ENTRE OTROS. OTRA CARACTERISTICA IMPORTANTE DEL ALUOMA ES LA REDUNDANCIA DE SU INFORMATIVIDAD DURANTE LOS PROCESOS BIOLOGICOS, LO QUE PUEDE PROPORCIONAR MARCADORES MAS SOLIDOS.OBJETIVOS: (1) OBTENER PERFILES GENOMICOS Y EPIGENOMICOS UTILIZANDO SEÑALES ALU DE TODO EL GENOMA COMO BIOMARCADORES REPORTEROS DE ALTERACIONES GENETICAS (NUMERO DE COPIAS, COMPLEJIDAD CARIOTIPICA, FIRMA MUTACIONAL) Y EPIGENETICAS (CELULA DE ORIGEN, COMPARTIMENTACION DEL GENOMA, EDAD EPIGENETICA, REGULACION GENICA, ETC.) DE LAS CELULAS CANCEROSAS. (2) DISEÑAR UN SISTEMA QUE MUESTRE EL PERFIL GENETICO Y EPIGENETICO DE FORMA INTEGRADA Y QUE INCLUYA, TANTO BIOMARCADORES ESTABLECIDOS CON PROBADA APLICACION CLINICA, COMO LAS SEÑALES DE ELEMENTOS ALU A PARTIR DE BIOPSIAS DE TEJIDOS Y BIOPSIAS LIQUIDAS DE PACIENTES CON CANCER COLORRECTAL. (3) EVALUAR LA VIABILIDAD Y APLICABILIDAD DE LA HERRAMIENTA INTEGRADA EN SERIES DE PACIENTES CON CANCER COLORRECTAL.METODOLOGIA Y PLAN DE TRABAJO: SE OBTENDRAN MUESTRAS CLINICAS HUMANAS DEL BANCO NACIONAL DE ADN, DEL BIOBANCO IGTP-HUGTP Y DEL BIOBANCO HUB-ICO-IDIBELL. EL PLAN DE TRABAJO INCLUYE: DISEÑO, CONFIGURACION Y VALIDACION DE UN ANALISIS INTEGRADOR BASADO EN NGS DE BIBLIOTECAS GENOMICAS QUE CODIFICAN INFORMACION GENETICA Y EPIGENETICA CON ENRIQUECIMIENTO PARA MARCADORES PRESELECCIONADOS Y REPETICIONES ALU PARA DESCUBRIMIENTO; PROCESAMIENTO DE DATOS, ALMACENAMIENTO Y MODELADO DE INDICES GLOBALES MEDIANTE LA COMPILACION DE PERFILES GENETICOS Y EPIGENETICOS (POR EJEMPLO, NUMERO TOTAL DE MUTACIONES, PERFIL MUTACIONAL, ANEUPLOIDIA, DERIVA EPIGENETICA, HIPO/HIPERMETILACION GLOBAL, ETC. ); DESARROLLO DE APLICACIONES Y ALGORITMOS PARA LA ESTRATIFICACION Y MONITORIZACION DE PACIENTES, DETECCION PRECOZ DEL CANCER Y PERSONALIZACION DEL TRATAMIENTO. ANCER COLORRECTAL\ANALISIS INTEGRATIVO\DNA REPETITIVO\NGS\EPIGENETICA\GENETICA
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
242K€
Líder del proyecto
FUNDACIO INSTITUT D'INVESTIGACIO EN CIENCIES...
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Perfil tecnológico
TRL
4-5
12M
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