Descripción del proyecto
LAS ENFERMEDADES VIRICAS SON UNA DE LAS PRINCIPALES CAUSAS DE MORTALIDAD A NIVEL MUNDIAL E IMPLICAN ENORMES COSTES SOCIALES Y ECONOMICOS. PARA LA MAYORIA DE ELLAS SE CARECE DE VACUNAS O TRATAMIENTOS EFECTIVOS, POR LO QUE EL DESARROLLO DE NUEVOS ANTIVIRALES ES UNA PRIORIDAD. DE ESPECIAL URGENCIA ES LA ADQUISICION DE HERRAMIENTAS PARA LA INTERVENCION TEMPRANA FRENTE A EPIDEMIAS CAUSADAS POR PATOGENOS EMERGENTES ESPECIALMENTE VIRULENTOS Y CONTAGIOSOS. A LARGO PLAZO, NUESTRO OBJETIVO ES EL DESARROLLO DE ANTIVIRALES DE AMPLIO ESPECTRO DIRIGIDOS CONTRA MECANISMOS DE GEMACION COMUNES A NUMEROSOS VIRUS. EN LOS CUATRO AÑOS DE ESTE PROYECTO, PRETENDEMOS AVANZAR EN EL ESTUDIO DE LAS INTERACCIONES ENTRE LOS DOMINIOS L VIRICOS Y SUS DIANAS CELULARES NEDD4-WW3, TSG101-UEV Y ALIX-V, EXPLORANDO LA POSIBILIDAD DE UNION A LIGANDOS CON BUENOS NIVELES DE AFINIDAD, ESPECIFICIDAD, TOXICIDAD Y EFECTOS SECUNDARIOS. CON ESTE FIN, PLANTEAMOS UNA METODOLOGIA MULTIDISCIPLINAR QUE COMBINA APROXIMACIONES BIOQUIMICAS, BIOFISICAS, PROTEOMICAS Y COMPUTACIONALES PARA A) REALIZAR UN ESTUDIO BIOFISICO DETALLADO DE LAS INTERACCIONES DE DOMINIOS L VIRICOS CON SUS DIANAS CELULARES, COMO BASE SOLIDA PARA LA IDENTIFICACION DE INHIBIDORES EFICACES; B) IDENTIFICAR LIGANDOS PEPTIDICOS DE ALTA AFINIDAD PARA LOS DOMINIOS TSG101-UEV Y ALIX-V MEDIANTE PHAGE DISPLAY, QUE PROPORCIONEN INFORMACION SOBRE LOS DETERMINANTES DE ALTA AFINIDAD EN ESTOS SISTEMAS; C) EVALUAR LAS POSIBILIDADES DE ESTOS DOMINIOS COMO DIANAS PARA EL DESARROLLO DE FARMACOS TRATANDO DE IDENTIFICAR LIGANDOS NO PEPTIDICOS MEDIANTE EL CRIBADO EXPERIMENTAL Y COMPUTACIONAL DE ALTO RENDIMIENTO (HTS) DE LIBRERIAS DE COMPUESTOS PUROS Y EXTRACTOS MICROBIANOS; D) EVALUAR EL NIVEL DE ESPECIFICIDAD ALCANZABLE PARA NEDD4-WW3 Y TSG101-UEV EN EL CONTEXTO DEL PROTEOMA COMPLETO DE DOMINIOS WW Y UEV HUMANOS. ESTO PERMITIRIA, JUNTO CON ENSAYOS DE TOXICIDAD Y PERTURBACION DE LAS FUNCIONES ESCRT NORMALES, IDENTIFICAR LAS MEJORES CARACTERISTICAS PARA LA ESPECIFICIDAD DE UNION EN ESTOS SISTEMAS, DE APLICACION GENERAL A OTROS DOMINIOS WW Y UEV; E) ESTUDIAR LA COOPERATIVIDAD Y ESPECIFICIDAD CONTEXTUAL EN NEDD4, ANALIZANDO EL EFECTO DEL DOMINIO C2 EN LAS INTERACCIONES ENTRE DOMINIOS WW EN TANDEM, DE INTERES PARA COMPRENDER LA FUNCION Y REGULACION DE NEDD4 E IDENTIFICAR INHIBIDORES ACTIVOS EN EL CONTEXTO DE LA PROTEINA COMPLETA. PARA ALCANZAR ESTOS OBJETIVOS, PRESENTAMOS UN PROYECTO COORDINADO ENTRE DOS EQUIPOS CON AMPLIA EXPERIENCIA EN BIOFISICA DE PROTEINAS, CRIBADO DE ALTO RENDIMIENTO DE BIBLIOTECAS DE COMPUESTOS NATURALES Y METODOLOGIAS DE CRIBADO VIRTUAL, PLASMADO EN UNA PROPUESTA AMBICIOSA, AUNQUE REALISTA Y CUIDADOSAMENTE PLANIFICADA, QUE GENERARA UNA SOLIDA BASE PARA EL DESARROLLO DE ANTIVIRALES DE AMPLIO ESPECTRO. ASIMISMO, LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO SE MATERIALIZARAN EN ENSAYOS Y METODOLOGIAS APLICABLES DE FORMA GENERAL PARA LA IDENTIFICACION DE INHIBIDORES NO PEPTIDICOS PARA OTROS DOMINIOS WW Y UEV, IMPLICADOS EN NUMEROSAS ENFERMEDADES HUMANAS DE PRIMERA MAGNITUD, COMO EL CANCER. POR ULTIMO, LOS RESULTADOS DE NUESTRO TRABAJO SERAN MUY RELEVANTES PARA COMPRENDER LOS MECANISMOS MOLECULARES DE RECONOCIMIENTO DE SUSTRATOS Y REGULACION EN NEDD4. ES MAS, LAS MOLECULAS QUE PUDIERAN INDENTIFICARSE SERAN ASIMISMO DE UTILIDAD COMO HERRAMIENTAS PARA EL ESTUDIO DE LAS FUNCIONES CELULARES DE NEDD4, TSG101 Y ALIX EN LAS RUTAS ESCRT Y DE UBIQUITINACION, OBJETO ACTUALMENTE DE GRAN INTERES CIENTIFICO Y BIOMEDICO. NTIVIRALES\BIOCOMPUTACIÓN\COMPUESTOS NATURALES\CRIBADO DE ALTO RENDIMIENTO\ALIX\NEDD4\TSG101\LIGANDOS POLIPROLINA