Descripción del proyecto
GRAN PARTE DEL ESFUERZO ACTUAL EN SALUD PUBLICA, AGRICULTURA Y BIOTECNOLOGIA ESTA DIRIGIDO A ENCONTRAR FORMAS DE DETENER O CONTROLAR LA EVOLUCION RAPIDA DE DIFERENTES ORGANISMOS, EL EJEMPLO MAS DRAMATICO LO ENCONTRAMOS EN CANCER Y ENFERMEDADES INFECCIOSAS, EN LOS CUALES LA EVOLUCION DE LA RESISTENCIA A LOS TRATAMIENTOS REPRESENTA CADA AÑO MILLONES DE MUERTES EN TODO EL MUNDO, EN LA BASE DE ESTOS ESFUERZOS DE INVESTIGACION ESTA LA ASUNCION DE QUE LA EVOLUCION ES PREDECIBLE O, AL MENOS, REPRODUCIBLE, SIN EMBARGO, QUE LA EVOLUCION SEA PREDECIBLE O NO HA INTRIGADO A LOS BIOLOGOS EVOLUTIVOS DURANTE DECADAS, Y SOLO MUY RECIENTEMENTE LA TECNOLOGIA HA BRINDADO LOS MEDIOS PARA EXPLORAR RIGUROSAMENTE ESTE TEMA, EN ESTE PROYECTO, PROPONEMOS COMBINAR LA INGENIERIA GENETICA MASIVA, LA EVOLUCION EXPERIMENTAL Y LA SECUENCIACION DE PROXIMA GENERACION PARA RESPONDER UNA SERIE DE PREGUNTAS CLASICAS ACERCA DE COMO LA VARIACION GENETICA SE TRADUCE EN FENOTIPOS ADAPTATIVOS, LA AMBICION GENERAL ES DESARROLLAR UNA COMPRENSION MULTINIVEL DE LA ADAPTACION, UTILIZANDO COMO MODELO EL ESCENARIO ALTAMENTE RELEVANTE DE LA EVOLUCION DE PATOGENOS MICROBIANO, EL PLANTEAMIENTO ES SEGUIR UN ENFOQUE TRIPLE, CORRESPONDIENTE A LOS ANALISIS A NIVEL MOLECULAR, FUNCIONAL Y POBLACIONAL, PRIMERO, REALIZANDO EXPERIMENTOS DE ACUMULACION DE MUTACIONES, EXPLORAREMOS LAS PROPIEDADES DE LOS DIFERENTES SESGOS MUTACIONALES EXHIBIDOS POR LA MAQUINARIA DE REPLICACION Y REPARACION DE ADN, EN SEGUNDO LUGAR, COMBINANDO EL ESCRUTINIO DE LIBRERIAS DE MUTANTES DE INSERCION CON LA SECUENCIACION DE PROXIMA GENERACION, INVESTIGAREMOS SISTEMATICAMENTE LOS DETERMINANTES DE LOS EFECTOS DE LAS MUTACIONES EN LA APTITUD DARWINIANA, BUSCANDO DESCUBRIR PATRONES GENERALES SOBRE COMO LAS MUTACIONES INTERACTUAN CON EL ENTORNO GENETICO Y EL MEDIO AMBIENTE, FINALMENTE, ESTUDIAREMOS COMO LOS FACTORES GENETICOS Y AMBIENTALES ESPECIFICOS ESTUDIADOS EN LAS SECCIONES ANTERIORES DETERMINAN LA REPRODUCIBILIDAD DE LA ADAPTACION DE PATOGENOS A LA RESISTENCIA A LOS ANTIBIOTICOS, PARA LO CUAL REALIZAREMOS EXPERIMENTOS DE EVOLUCION DE LABORATORIO CON ALTO NUMERO DE REPLICAS EN VARIAS CONDICIONES AMBIENTALES BIEN DEFINIDAS, LA AMBICION GENERAL ES CONTRIBUIR A UNA TEORIA INTEGRAL Y CUANTITATIVA DE LA ADAPTACION, UNA TEORIA QUE PERMITA ABORDAR LOS DESAFIOS QUE SURGEN DE LA EVOLUCION RAPIDA Y NO DESEADA DE ORGANISMOS CLINICA Y ECONOMICAMENTE RELEVANTES, SESGOS EN MUTACION\EPISTASIS\INTERACCION GENOTIPO-AMBIENTE\EVOLUCION EXPERIMENTAL\RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS\MUTADOR\TNSEQ\SECUENCIACION DE GENOMA COMPLETO