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BFU2009-13409-C02-02

Financiado

IDENTIFICACION DE NOVEDADES EVOLUTIVAS Y ADAPTACION EN REGIONES DUPLICADAS DEL G...

IDENTIFICACION DE NOVEDADES EVOLUTIVAS Y ADAPTACION EN REGIONES DUPLICADAS DEL GENOMA DE LOS PRIMATES LA SECUENCIACION DE GENOMAS COMPLETOS HA REVELADO UNA GRAN CANTIDAD DE VARIACION GENETICA, CONSIDERANDO SOLO LAS MUTACIONES PUNTUALES, SUELE DECIRSE QUE LOS HUMANOS DIFERIMOS UNOS DE OTROS EN UN 0,1% DEL GENOMA, MIENTRAS QUE DIVER... ver más

01/01/2009

UPF

265K€

Presupuesto del proyecto: 265K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01

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Participantes

UPF

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA

Total investigadores 321

Presupuesto del proyecto 265K€

Descripción del proyecto LA SECUENCIACION DE GENOMAS COMPLETOS HA REVELADO UNA GRAN CANTIDAD DE VARIACION GENETICA, CONSIDERANDO SOLO LAS MUTACIONES PUNTUALES, SUELE DECIRSE QUE LOS HUMANOS DIFERIMOS UNOS DE OTROS EN UN 0,1% DEL GENOMA, MIENTRAS QUE DIVERGIMOS DE LOS CHIMPANCES EN UN 1,24%, SIN EMBARGO, ESAS CIFRAS SON ERRONEAS, ESTUDIOS RECIENTES HAN IDENTIFICADO UNA GRAN CANTIDAD DE DUPLICACIONES SEGMENTALES (SDS), BLOQUES DE ENTRE 1 Y 400KB CON COPIAS EN MULTIPLES POSICIONES Y CON ALTA SIMILITUD (>90%), CUANDO SE CONSIDERAN LAS SDS, LAS DIFERENCIAS ENTRE DOS GENOMAS HUMANOS CRECEN HASTA UN 0,5-1% Y LAS DIFERENCIAS ENTRE HUMANOS Y CHIMPANCES PUEDEN LLEGAR HASTA 8-10%, PERO NO SE TRATA SOLO DE QUE HAY MAS DIFERENCIAS, SINO QUE ESTAS REPRESENTAN CAMBIOS CUALITATIVOS, LAS SDS CONTIENEN GENES COMPLETOS, VERDADERAS NOVEDADES EVOLUTIVAS QUE PUEDEN HABER SIDO UNA IMPORTANTE FUENTE DE ADAPTACION,TODA ESTA ENORME CANTIDAD DE VARIABILIDAD TENDRA UN FUERTE IMPACTO EN EL PROGRAMA DE INVESTIGACION QUE PRETENDE IDENTIFICAR LA HUELLA MOLECULAR DE LA ADAPTACION, ALGUNAS DE SUS PREGUNTAS SE RELACIONAN CON AQUELLO QUE NOS HACE HUMANOS (Y QUE HACE RATONES A LOS RATONES Y MOSCAS A LAS MOSCAS), LA BASE GENETICA DE LOS CARACTERES FISICOS, ETOLOGICOS Y COGNITIVOS QUE NOS SEPARAN DEL RESTO DE LOS GRANDES SIMIOS DEBE ENCONTRARSE EN LAS DIFERENCIAS GENOMICAS QUE, PROBABLEMENTE FIJADAS POR SELECCION, NOS SEPARAN DE LOS CHIMPANCES, DETERMINAR CUALES SON LOS GENES QUE HAN EXPERIMENTADO SELECCION POSITIVA EN NUESTROS GENOMAS ES UN RETO QUE NO PUEDE RESOLVERSE SI SE IGNORAN LAS SDS (QUE, COMO HEMOS VISTO, SON LA FUENTE MAS IMPORTANTE DE DIFERENCIAS), SIN EMBARGO, TODOS LOS ANALISIS DE SELECCION POSITIVA A NIVEL DE GENOMA COMPLETO PUBLICADOS HASTA LA FECHA IGNORAN LAS SDS, ESTO ES LOGICO, YA QUE HASTA HACE POCO NO SE DISPONIA DE DATOS PARA ABORDAR LA CUESTION Y, DE HECHO, NO SE DISPONE AUN DE LOS METODOS APROPIADOS, ESTE PROBLEMA PUEDE SER LA CLAVE DE LA FALTA DE PROPORCION ENTRE LAS POCAS DIFERENCIAS GENOMICAS OBSERVABLES ENTRE ESPECIES Y LAS NORMALMENTE MUCHO MAYORES DIFERENCIAS FENOTIPICAS QUE ESTAS PRESENTAN, ESTO ES ESPECIALMENTE CIERTO EN EL CASO DE LOS PRIMATES: LAS GRANDES DIFERENCIAS FENOTIPICAS ENTRE HUMANOS Y GRANDES SIMIOS SON DISONANTES CON SUS TASAS DE EVOLUCION MOLECULAR, ENTRE ESOS GRUPOS LAS PROTEINAS SON VIRTUALMENTE IDENTICAS Y, DE HECHO, LAS TASAS DE CAMBIOS NUCLEOTIDICOS HAN DISMINUIDO CUANDO SE LAS COMPARA CON LAS DE ROEDORES O MONOS, LO QUE ES MAS, EL CRECIENTE, AUNQUE AUN RELATIVAMENTE PEQUEÑO, NUMERO DE EJEMPLOS DOCUMENTADOS DE SELECCION POSITIVA NO PUEDE EXPLICAR LAS ADAPTACIONES QUE HAN CONDUCIDO A ORGANISMOS TAN DISTINTOS,EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES CONTRIBUIR A UNA VISION COMPLETA DE LA ADAPTACION A NIVEL MOLECULAR EN PRIMATES, PARA CONSEGUIRLO, PRETENDEMOS (1) DESARROLLAR METODOS INNOVADORES, ADECUADOS A SDS, PARA DETECTAR SELECCION, EN ESTE APARTADO, DISPONEMOS YA DE RESULTADOS PRELIMINARES, (2) APLICAR ESTOS METODOS MEDIANTE DIVERSOS ESTUDIOS DE GENOMA COMPLETO EN LOS GENOMAS DE PRIMATES DISPONIBLES, (3) ESTUDIAR LOS PATRONES Y NIVELES DE EXPRESION GENICA EN GENES INCLUIDOS EN SDS Y CLASIFICADOS COMO DIANAS DE SELECCION POSITIVA PARA VER SI SE DESVIAN DE LAS PREDICCIONES DE LA TEORIA NEUTRAL DE LA EVOLUCION DE LA EXPRESION GENICA, (4) LLEVAR A CABO ESTUDIOS FUNCIONALES DE LAS CAUSAS MOLECULARES DE LA ADAPTACION, (5) IMPLEMENTAR NUESTROS METODOS EN HERRAMIENTAS WEB GRATUITAS QUE PODREMOS A DISPOSICION DE LA COMUNIDAD CIENTIFICA, GENOMA\DUPLICACIONES SEGMENTALES\EVOLUCION\GENES\SELECION NATURAL\EXPRESION GENICA\ENSAYOS FUNCIONALES\EVOLUCION MOLECULAR

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