SAF2013-47939-R
Financiado
IDENTIFICACION DE GENES IMPLICADOS EN ENFERMEDAD DE PARKINSON Y TEMBLOR ESENCIAL...
IDENTIFICACION DE GENES IMPLICADOS EN ENFERMEDAD DE PARKINSON Y TEMBLOR ESENCIAL MEDIANTE SECUENCIACION DE NUEVA GENERACION Y ANALISIS DE HAPLOTIPOS
LA ENFERMEDAD DE PARKINSON (EP) Y EL TEMBLOR ESENCIAL (TE) SON ENFERMEDADES NEUROLOGICAS FRECUENTES E INVALIDANTES CON AGREGACION FAMILIAR EN EL 30% Y 70%, RESPECTIVAMENTE QUE COMPARTEN FACTORES FENOTIPICOS Y ETIOLOGICOS, AUNQUE S...
LA ENFERMEDAD DE PARKINSON (EP) Y EL TEMBLOR ESENCIAL (TE) SON ENFERMEDADES NEUROLOGICAS FRECUENTES E INVALIDANTES CON AGREGACION FAMILIAR EN EL 30% Y 70%, RESPECTIVAMENTE QUE COMPARTEN FACTORES FENOTIPICOS Y ETIOLOGICOS, AUNQUE SE HAN IDENTIFICADO GENES IMPLICADOS EN EP Y ET FAMILIAR, LA MAYORIA DE LOS CASOS FAMILIARES NO TIENEN CAUSA CONOCIDA, NUESTRA HIPOTESIS SE BASA EN QUE EXISTEN GENES DESCONOCIDOS RESPONSABLES DE ET Y PD, GRACIAS A LA FINANCIACION PREVIA DEL MINECO (SAF-2006-10126 Y SAF-2010-22329-C02-01) HEMOS REALIZADO UNA INVESTIGACION EXHAUSTIVA DE MANERA QUE, APARTE DE UNA PRODUCCION CIENTIFICA APRECIABLE (DESDE 2010, 20 ARTICULOS EN REVISTAS INTERNACIONALES) HEMOS REALIZADO LA SECUENCIACION DE 112 EXOMAS DE LOS CUALES HEMOS IDENTIFICADO 35 VARIANTES EN DISTINTOS GENES DE ENTRE LOS CUALES ALGUNOS PUEDEN CAUSAR EP Y/O ET FAMILIAR, MEDIANTE EL USO DE SECUENCIACION DE NUEVA GENERACION (NGS) QUEREMOS CONTINUAR ANALIZANDO DICHOS GENES EN ET, EP Y CONTROLES E INCREMENTAR EL NUMERO DE FAMILIAS SIN GENES CONOCIDOS DE EP O ET, PARA REALIZAR SECUENCIACION DEL EXOMA (WES), ESTUDIO DE LA FRECUENCIA EN CASOS Y CONTROLES MEDIANTE GENOTIPADO DIRECTO DE VARIANTES NUEVAS Y POOL DNA SEQUENCING PARA VARIANTES RARAS CON EL OBJETIVO DE IDENTIFICAR LOS GENES RESPONSABLES DE DICHAS PATOLOGIAS, PRIMERO ANALIZAREMOS LAS MUTACIONES MAS FRECUENTES DE EP Y ET FAMILIAR, EN LAS FAMILIAS EN LAS QUE NO ENCONTREMOS MUTACIONES, REALIZAREMOS WES EN DOS AFECTOS Y UN SANO POR FAMILIA, ADEMAS, UTILIZAREMOS EL HUMANCOREEXOME ARRAY QUE PERMITE EL ANALISIS DE LOS HAPLOTIPOS COMPARTIDOS POR LOS AFECTOS Y PREFERIBLEMENTE AUSENTES EN LOS INDIVIDUOS SANOS PARA IDENTIFICAR REGIONES CANDIDATAS, ESTA ESTRATEGIA COMPLEMENTARA EL ANALISIS DEL WES PARA LA IDENTIFICACION DEL GENE RESPONSABLE, LOS CRITERIOS PARA SELECCIONAR LAS VARIANTES CANDIDATAS SERAN: VARIANTES PRESENTES EN AFECTOS Y AUSENTES EN FAMILIARES SANOS, LOCALIZACION EN HAPLOTIPOS ASOCIADOS A LA ENFERMEDAD, FRECUENCIA DEL ALELO MENOS FRECUENTE (MAF) PARA EP <0,01 (EN HERENCIA AUTOSOMICA DOMINANTE) Y MAF<0,01 (EN RECESIVA) Y PARA TE <0,01, QUE PREDIGAN UN EFECTO FUNCIONAL A NIVEL DE PROTEINA (SPLICING, MISSENSE O FRAMESHIFT) Y EXPRESION EN CEREBRO, SEGUIDAMENTE, GENOTIPAREMOS LAS VARIANTES NUEVAS EN CASOS Y CONTROLES Y SECUENCIAREMOS MEDIANTE NGS DNA POOL SEQUENCING LOS GENES EN LOS QUE ENCONTREMOS VARIANTES CANDIDATAS NUEVAS DE BAJA FRECUENCIA INCLUYENDO LAS YA IDENTIFICADAS PREVIAMENTE EN NUESTRO LABORATORIO, INTERPRETAREMOS QUE LOS NUEVOS GENES DE EP O ET SERAN AQUELLOS QUE CONCENTREN VARIANTES PATOGENICAS EN CASOS Y NO EN CONTROLES, EN CASO DE EXPRESION DEL GEN CANDIDATO PERITERICA, ANALIZAREMOS LA EXPRESION DE GENES MUTADOS EN ARNM DE LEUCOCITOS COMPARANDOLO CON EL WILD TYPE, ASIMISMO, REALIZAREMOS ESTUDIOS FUNCIONALES PARA INVESTIGAR LOS EFECTOS BIOLOGICOS DE LAS PROTEINAS MUTADAS, EN CASO DE NO ENCONTRAR GENES CANDIDATOS, REALIZAREMOS ANALISIS DE CNVS PARA IDENTIFICAR DUPLICACIONES Y DELECIONES GENICAS EN REGIONES ASOCIADAS A LA ENFERMEDAD, ADICIONALMENTE, REALIZAREMOS, EN FAMILIAS CON ANTICIPACION GENETICA FENOMENO QUE ES MAS FRECUENTE EN TE, EL ANALISIS DE SHORT TANDEM REPEATS (STRS) Y EN CASO DE CODOMINANCIA ANALISIS DE METILACION DE SITIOS SUSCEPTIBLES DE LA MISMA, CON ESTE PROYECTO PRETENDEMOS OBTENER NUEVOS MARCADORES DIAGNOSTICOS PARA EP Y TE QUE PERMITA SUBCLASIFICAR FENOTIPICAMENTE ESTOS TRASTORNOS Y DISEÑAR DE DIANAS TERAPEUTICAS MEJOR ORIENTADAS, ENFERMEDAD DE PARKINSON\ TEMBLOR ESENCIAL\ GENÉTICA\ MARCADORES DIAGNÓSTICOS\ SECUENCIACIÓN DE NUEVA GENERACIÓN
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01
Líder del proyecto
FUNDACIO MUTUA DE TERRASSA PER A LA DOCENCIA...
Otras actividades asociativas n.c.o.p. asociacion
Perfil tecnológico
TRL
4-5
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