Descripción del proyecto
LA OBTENCION DE INFORMACION SOBRE LA ESTRUCTURA DE LOS GRANDES COMPLEJOS MACROMOLECULARES ES CLAVE PARA ACCEDER A UN CONOCIMIENTO DETALLADO DE SU FUNCION BIOLOGICA, Y LA MICROSCOPIA ELECTRONICA TRIDIMENSIONAL (3DEM) ES UNA DE LAS TECNICAS QUE PERMITEN OBTENERLA EXPERIMENTALMENTE, LOS ASPECTOS MAS INTERESANTES DE 3DEM SON SU CAPACIDAD PARA ESTUDIAR LAS MUESTRAS EN SOLUCION A PARTIR DE RELATIVAMENTE PEQUEÑAS CANTIDADES DE MUESTRA, ASI COMO LA POSIBILIDAD DE ESTUDIAR DIRECTAMENTE LA FLEXIBILIDAD DE ESTOS COMPLEJOS MACROMOLECULARES, SIN EMBARGO, 3DEM ESTA AUN LEJOS DE LLEGAR A ESTAS METAS DE UNA FORMA COMPLETAMENTE REPRODUCIBLE Y RUTINARIA QUE PERMITA, A SU VEZ, PLANTEAMIENTOS DE TIPO HIGH-THROUGHPUT (HT), EN CONCRETO, 3DEM TODAVIA TIENE QUE AVANZAR MUCHO EN LAS AREAS DE PREPARACION DE MUESTRAS, VISUALIZACION AL MICROSCOPIO ELECTRONICO Y, POR ULTIMO, PROCESAMIENTO DE IMAGEN, EL PRESENTE PROYECTO SE PLANTEA AYUDAR A ESTE DESARROLLO DEL CAMPO EN EL AREA DEL PROCESAMIENTO DE IMAGEN,CONCOMITANTE AL DESARROLLO DE NUEVAS METODOLOGIAS DE PROCESAMIENTO DE IMAGEN EN 3DEM, ESPERAMOS EXPANDIR ESTE TRABAJO AL CAMPO EMERGENTE DE LA TOMOGRAFIA CELULAR DE RAYOS X (TOMOX), JUNTO CON EL SINCROTRON ESPAÑOL ALBA, QUE SE ESTA CONSTRUYENDO Y QUE SERA EL TERCER MICROSCOPIO DEL MUNDO DE ESTE TIPO, LAS SINGULARIDADES DE TOMOX SE INCORPORARAN A NUESTROS DESARROLLOS EN PROCESAMIENTO DE IMAGEN, UTILIZANDO NUESTRO CONOCIMIENTO ACTUAL EN 3DEM,CABE RESALTAR QUE EL GRUPO QUE PROPONE ESTE PROYECTO ACABA DE GANAR LA COMPETICION INTERNACIONAL LANZADA POR LA INICIATIVA ESTRATEGICA EUROPEA EN BIOLOGIA ESTRUCTURAL, CONOCIDA COMO INSTRUCT, PARA SER SU ¿CENTRO¿ DE REFERENCIA EN EL AREA DE PROCESAMIENTO DE IMAGEN EN MICROSCOPIA, COMO CONSECUENCIA DE TODO LO ANTERIOR, NUESTRO OBJETIVO ES REALMENTE EL IMPACTO GLOBAL EN EL AREA, DE FORMA QUE EL PRESENTE PROYECTO SE CONFIGURA COMO UNA DE LAS HERRAMIENTAS CLAVE PARA LOGRAR ESTE OBJETIVO,EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS ATACAR ALGUNOS PROBLEMAS MUY IMPORTANTES EN MICROSCOPIA ELECTRONICA Y MICROSCOPIA DE RAYOS X: 1) MEJORA DE LA ROBUSTEZ DEL PROCESO DE RECONSTRUCCION TRIDIMENSIONAL EN 3DEM RESOLVIENDO EL PROBLEMA DE LA REFERENCIA INICIAL; 2) MANEJO DE LA FLEXIBILIDAD DE LAS MACROMOLECULAS UTILIZANDO TECNICAS DE MAXIMA VEROSIMILITUD; 3) INCORPORACION DEL MODELO DE FORMACION DE IMAGEN DE MICROSCOPIA DE RAYOS X EN EL PROCESO DE RECONSTRUCCION; 4) AUTOMATIZACION DEL PROCESADO DE IMAGENES (FLUJOS DE TRABAJO) PARA LOGRAR UN ALTO RENDIMIENTO EN BIOLOGIA ESTRUCTURAL, TODOS ESTOS DESARROLLOS METODOLOGICOS ESTARAN ACOMPAÑADOS DEL ESTUDIO DE ESPECIMENES BIOLOGICOS QUE SUPONGAN RETOS ESPECIALES A LOS METODOS ACTUALES DE PROCESADO DE IMAGEN, EN PARTICULAR, USAREMOS HELICASAS DE ARQUEOBACTERIAS (DNAB) Y DE EUCARIOTAS (MCM) PARA VALIDAR LOS DESARROLLOS DE 3DEM, Y MITOCONDRIAS PARA LA MICROSCOPIA DE RAYOS X,