Descripción del proyecto
EL PRESENTE PROYECTO DE INVESTIGACION ABORDA EL ESTUDIO DEL PARTICIPANTE BACTERIANO DE UNA SIMBIOSIS RECIENTEMENTE DESCRITA Y UNICA ENTRE LEGUMINOSA Y RIZOBIO, LA DE L. MARIAE-JOSEPHI Y SU MICROSIMBIONTE BACTERIANO. ESTA NUEVA ESPECIE DE LUPINO ES ENDEMICA DE UNA PEQUEÑA AREA GEOGRAFICA, CARACTERIZADA POR SUELOS BASICOS Y RICOS EN CALIZA EN LA PROVINCIA DE VALENCIA. NUESTRAS INVESTIGACIONES PREVIAS HAN DEMOSTRADO QUE ESTA SIMBIOSIS ES ALTAMENTE ESPECIFICA, Y QUE LOS RIZOBIOS QUE NODULAN L. MARIAE-JOSEPHI SON MUY DIVERSOS. ESTOS RESULTADOS, JUNTO CON LAS LIMITACIONES GEOGRAFICAS DE LA ESPECIE, PROPORCIONAN LA RARA OPORTUNIDAD DE INVESTIGAR LA DIVERSIDAD, FILOGENIA Y EVOLUCION DEL SIMBIONTE RIZOBIANO, ASI COMO LOS DETERMINANTES GENETICOS Y FUNCIONALES ESPECIFICOS DE LA SIMBIOSIS CON L. MARIAE-JOSEPHI. ESTA INVESTIGACION CONSTITUYE EL OBJETIVO CENTRAL DEL PROYECTO, Y HARA UN USO REPETIDO DE TECNOLOGIAS MASIVAS DE SECUENCIACION DE GENOMAS QUE PREVIAMENTE NO ESTABAN DISPONIBLES DE FORMA ASEQUIBLE. ENTRE LAS PREGUNTAS ESPECIFICAS QUE SE PLANTEARAN ESTAN: A) ¿QUE FILOGENIAS Y RELACIONES EVOLUTIVAS EXISTEN LOS SIMBIONTES DE L. MARIAE-JOSEPHI, Y ENTRE ELLOS MISMOS COMO CONJUNTO Y OTROS SIMBIONTES DE LEGUMINOSAS; B) ¿CUALES SON LOS DETERMINANTES GENETICOS /GENOMICOS DE SU ADAPTACION HACIA LA ESPECIFICIDAD EN LA SIMBIOSIS CON L. MARIAE-JOSEPHI EN SU HABITAT CARACTERISTICO?; C) ¿SON CUALITATIVA O CUANTITATIVAMENTE DISTINTOS ESOS DETERMINANTES (Y DE QUE MODO) DE LOS DE LOS RIZOBIOS QUE ESTABLECEN SIMBIOSIS CON OTROS LUPINOS?ESTE OBJETIVO GENERAL SE DIVIDE Y SISTEMATIZA EN LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS:1. SECUENCIACION GENOMICA Y ANOTACION DE BRADIRIZOBIOS DE L. MARIAE-JOSEPHI Y BACTERIAS RELACIONADAS.2. CARACTERIZACION DE LA DIVERSIDAD FILOGENETICA Y GENOMICA DENTRO DE LOS BRADIRIZOBIOS QUE NODULAN L. MARIAE-JOSEPHI, EN COMPARACION CON LOS QUE NODULAN OTROS LUPINOS DE LA PENINSULA IBERICA, Y CON OTROS AISLAMIENTOS RELACIONADOS.3. DEFINICION DEL GENOMA SIMBIOTICO EN AISLAMIENTOS DE L. MARIAE-JOSEPHI, EN AISLAMIENTOS DE LUPINUS SPP. DE LA PENINSULA IBERICA, Y EN AISLAMIENTOS RELACIONADOS, POR MEDIO DE RNASEQ Y GENOMICA COMPARADA.4. CARACTERIZACION DEL PAPEL DE ADAPTACIONES GENETICAS / GENOMICAS ESPECIFICAS EN EL ESTABLECIMIENTO, MANTENIMIENTO Y FUNCION DE LAS SIMBIOSIS DIAZOTROFICAS CON L. MARIAE-JOSEPHI Y LUPINUS SPP. DE LA PENINSULA IBERICA: SISTEMAS DE SECRECION DE MACROMOLECULAS.COMO RESULTADO DEL PROYECTO, SE CARACTERIZARA A NIVEL GENOMICO UN RANGO RELEVANTE DE GENOTIPOS DE SIMBIONTES DE L. MARIAE-JOSEPHI. ESTO PERMITIRA LA CARACTERIZACION Y DESCRIPCION FORMA DE LA BIODIVERSIDAD DE LOS GENOMAS BASICO Y SIMBIOTICO, Y PERMITIRA EL ESTABLECIMIENTO DE FILOGENIAS MOLECULARES PARA GENOMAS, SUBSISTEMAS ESPECIFICOS (GENOMA SIMBIOTICO, SISTEMAS DE SECRECION DE MACROMOLECULAS), Y GENES DE INTERES. DE TENER EXITO EL PROYECTO, LA SIMBIOSIS DIAZOTROFICA NODULAR DE L. MARIAE-JOSEPHI SE CONVERTIRA EN EL SISTEMA MODELO PARA EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS DE ESPECIACION Y DE ADQUISICION DE CAPACIDADES SIMBIOTICAS ESPECIFICAS POR PARTE DE UN GRUPO DE BACTERIAS, DE OTRO MODO DIVERSAS, CON IMPLICACIONES NO SOLO EN RIZOBIOLOGIA, SINO EN LA MICROBIOLOGIA EN GENERAL. UPINUS MARIAE-JOSEPHI\SISTEMAS DE SECRECION DE MACROMOLECULAS\GENOMA SIMBIOTICO\SECUENCIACION MASIVA\ESPECIFICIDAD\ENDEMISMO\SIMBIOSIS\LUPINOS\BRADYRHIZOBIUM