Descripción del proyecto
LA GENOMICA FUNCIONAL APLICADA A LA ECOLOGIA Y A LA BIOLOGIA EVOLUTIVA TIENE COMO OBJETIVO EL ESTUDIO DE LA VARIACION GENOMICA (EN REFERENCIA AL GENOMA COMPLETO DE UN ORGANISMO) Y GENETICA (EN REFERENCIA A TODAS LAS CARACTERISTICAS GENETICAS QUE DETERMINAN LA COMPOSICION GENETICA DE UNA ESPECIE) Y SUS IMPLICACIONES FUNCIONALES PARA ORGANISMOS Y POBLACIONES EN AMBIENTES NATURALES, ESTA RECIENTE DISCIPLINA PRETENDE TAMBIEN ENTENDER LOS PROCESOS EVOLUTIVOS QUE CREAN Y/O MANTIENEN DICHA VARIACION, ESTE PROYECTO TIENE COMO PRINCIPAL OBJETIVO DESARROLLAR UN ESTUDIO DE GENOMICA FUNCIONAL ECOLOGICA Y EVOLUTIVA USANDO LA PLANTA ANUAL ARABIDOPSIS THALIANA COMO SISTEMA DE ESTUDIO, EL CARACTER CON IMPORTANCIA ECOLOGICA Y EVOLUTIVA ES LA DORMICION DE SEMILLAS POR DIVERSAS RAZONES QUE SE PUEDEN JUSTIFICAR SOLIDAMENTE, PRIMERO, LOS TRABAJOS DE CAMPO QUE SE ESTAN DESARROLLANDO HAN IDENTIFICADO A LA DORMICION DE SEMILLAS COMO UN ATRIBUTO DEMOGRAFICO CLAVE PARA ENTENDER LA DINAMICA DE POBLACIONES DE LA ESPECIE, SEGUNDO, LA VARIACION EN DORMICION DE SEMILLAS PODRIA EXPLICAR LA EVOLUCION DEL CICLO VITAL EN POBLACIONES NATURALES DE A, THALIANA A DIFERENTES ESCALAS ESPACIOTEMPORALES YA QUE LAS POBLACIONES DE A, THALIANA ESTAN FORMADAS POR DIFERENTES TIPOS DE INDIVIDUOS QUE DIFIEREN EN EL GRADO DE DORMICION DE SUS SEMILLAS Y POR ENDE EN SU CICLO VITAL (LO QUE SE DENOMINA ANUALES DE PRIMAVERA Y DE INVIERNO), TERCERO, EL GEN DOG1 HA SIDO RECIENTEMENTE IDENTIFICADO COMO UNO DE LOS GENES MAS IMPORTANTES QUE DETERMINAN DE UNA MANERA MUY ESPECIFICA LA DORMICION DE SEMILLAS EN A, THALIANA, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO CONSISTE EN ESTUDIAR EL PESO QUE TIENE LOS FACTORES ECOLOGICOS (P,EJ,: LA VARIACION AMBIENTAL) Y GENETICOS (P,EJ,: LA VARIACION NUCLEOTIDICA EN DOG1) A LA HORA DE EXPLICAR LA VARIACION CUANTITATIVA DE LA DORMICION DE SEMILLAS Y SUS IMPLICACIONES PARA LA EVOLUCION DE ESTE CARACTER EN POBLACIONES NATURALES DE A, THALIANA, LAS TAREAS CONCRETAS QUE SE LLEVARAN A CABO PARA CONSEGUIR DICHO OBJETIVO SON: (1) CUANTIFICAR LA CANTIDAD DE VARIACION EN LA DORMICION DE SEMILLAS EN POBLACIONES DE A, THALIANA A UNA ESCALA REGIONAL (100 POBLACIONES POR TODA LA PENINSULA IBERICA) Y OTRA LOCAL (DENTRO DE UNAS DETERMINADAS POBLACIONES PREVIAMENTE SELECCIONADAS) MEDIANTE EXPERIMENTOS DE GERMINACION EN CONDICIONES DE LABORATORIO PARA TESTAR DISTINTAS CONDICIONES QUE PROMUEVEN O ROMPEN LA DORMICION DE SEMILLAS, (2) SECUENCIAR EN SU TOTALIDAD EL GEN DOG1 (5,2 KB) Y ANALIZAR LA CANTIDAD DE VARIACION NUCLEOTIDICA EN POBLACIONES DE A, THALIANA A UNA ESCALA REGIONAL Y OTRA MAS LOCAL, (3) ANALIZAR LA ASOCIACION ENTRE LA VARIACION GENETICA EN EL LOCUS DOG1 Y LA VARIACION CUANTITATIVA EN LA DORMICION DE SEMILLAS PARA DETECTAR VARIANTES GENETICAS CON UN SIGNIFICADO FUNCIONAL, (4) LLEVAR A CABO EXPERIMENTOS DE CAMPO AL AIRE LIBRE EN DIFERENTES AMBIENTES PARA EVALUAR LA RESPUESTA DE DISTINTOS GENOTIPOS DE A, THALIANA A AMBIENTES CONTRASTADOS (LO QUE SE ENTIENDE COMO LA INTERACCION G × E), (5) DESARROLLAR UN SISTEMA DE INFORMACION GEOGRAFICO (SIG) PARA TODA LA PENINSULA IBERICA PARA INTEGRAR LA VARIACION AMBIENTAL (P,EJ, ALTITUD, TIPO DE HABITAT), GENETICA (P,EJ,: VARIACION NUCLEOTIDICA EN DOG1, VARIACION GENETICA NEUTRA) Y CUANTITATIVA (P,EJ, VARIACION EN LA DORMICION DE SEMILLAS), EL SIG SE USARA COMO HERRAMIENTA PARA ESTUDIAR LAS CAUSAS ECOLOGICAS Y EVOLUTIVAS DE LA DORMICION DE SEMILLAS A UNA ESCALA ESPACIAL AMPLIA INCLUYENDO FACTORES AMBIENTALES Y GENETICOS FUNCIONALES, ARABIDOPSIS THALIANA\ANALISIS DE ASOCIACION\BIOLOGIA DE POBLACIONES\DORMICION DE SEMILLAS\ECOLOGIA EXPERIMENTAL\GENOMICA FUNCIONAL\INTERACCION GENOTIPO AMBIENTE\SISTEMA DE INFORMACION GEOGRAFICO