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CGL2013-47755-P

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GENOMICA DE LA CONSERVACION DE LINCES: EVALUACION DE LA VARIACION FUNCIONAL Y DE...

GENOMICA DE LA CONSERVACION DE LINCES: EVALUACION DE LA VARIACION FUNCIONAL Y DEL PAPEL DE LA SELECCION EN POBLACIONES EN DECLIVE DURANTE LAS ULTIMAS DOS DECADAS LOS ESTUDIOS DE GENETICA DE CONSERVACION HAN MOSTRADO COMO LAS POBLACIONES EN DECLIVE Y AISLADAS PIERDEN LA DIVERSIDAD GENETICA, ACUMULAN CONSANGUINIDAD Y SE DIFERENCIAN DE OTRAS POBLACIONES, Y EN A... ver más

01/01/2013

CSIC

145K€

Presupuesto del proyecto: 145K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 145K€

Descripción del proyecto DURANTE LAS ULTIMAS DOS DECADAS LOS ESTUDIOS DE GENETICA DE CONSERVACION HAN MOSTRADO COMO LAS POBLACIONES EN DECLIVE Y AISLADAS PIERDEN LA DIVERSIDAD GENETICA, ACUMULAN CONSANGUINIDAD Y SE DIFERENCIAN DE OTRAS POBLACIONES, Y EN ALGUNOS CASOS RESULTAN EN REDUCCIONES DE FITNESS, ADEMAS, SE ASUME QUE UNA DIVERSIDAD GENETICA REDUCIDA SE TRADUCE EN UNA MENOR CAPACIDAD DE LAS POBLACIONES PARA ADAPTARSE A LOS CAMBIOS AMBIENTALES, SIN EMBARGO, ESTOS ESTUDIOS SE HAN BASADO CASI EXCLUSIVAMENTE EN EL USO DE UNOS POCOS MARCADORES MOLECULARES NEUTRALES Y SECUENCIAS MITOCONDRIALES, QUEDA PUES LA DUDA DE EN QUE MEDIDA ESTOS PATRONES REFLEJAN LA VARIACION GENOMICA GLOBAL Y, LO QUE ES MAS IMPORTANTE, EL COMPONENTE FUNCIONAL DEL QUE TANTO EL POTENCIAL DE ADAPTACION COMO EL FITNESS DEPENDEN,EL LINCE IBERICO (LYNX PARDINUS) OFRECE UN MODELO UNICO PARA EL ESTUDIO DE LA VARIACION GENOMICA FUNCIONAL EN POBLACIONES EN DECLIVE, YA QUE I) HA SUFRIDO UN DECLIVE BIEN DOCUMENTADO QUE HA AFECTADO A SU VARIACION GENETICA Y, EN ULTIMA INSTANCIA, AL FITNESS, II) TENEMOS DISPONIBLE UNA AMPLIA COLECCION DE MAS DE 500 MUESTRAS, INCLUYENDO CA , 200 MUESTRAS HISTORICAS, QUE PROPORCIONAN UNA BUENA COBERTURA GEOGRAFICA Y TEMPORAL , III) SE HA ACUMULADO UNA ABUNDANTE INFORMACION FENOTIPICA Y GENEALOGICA, GENERADA POR LOS PROGRAMAS DE INVESTIGACION Y DE GESTION ACTUALES Y PASADOS, Y IV) UN RECIENTE PROYECTO LIDERADO POR EL IP HA GENERADO LOS RECURSOS GENOMICOS NECESARIOS, INCLUYENDO UN GENOMA ANOTADO DE REFERENCIA, ADEMAS, SU ESPECIE HERMANA, EL LINCE BOREAL (LYNX LYNX), TAMBIEN HA PASADO POR UN PROCESO DE CONTRACCION Y FRAGMENTACION EN EUROPA OCCIDENTAL QUE HA GENERADO UNA SERIE DE POBLACIONES QUE EXTENDERAN Y REPLICARAN EL RANGO DE ESCENARIOS DEMOGRAFICOS Y GENETICOS CUBIERTOS POR EL LINCE IBERICO,EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES POR TANTO EVALUAR LAS CONSECUENCIAS DE LA RECIENTE DISMINUCION Y FRAGMENTACION DE LAS POBLACIONES DE LINCE EN LA VARIACION GENOMICA FUNCIONAL Y EL PAPEL DE LA SELECCION NATURAL EN EL MANTENIMIENTO DE LA DIVERSIDAD ADAPTATIVA Y EN LA ACUMULACION DE ALELOS DELETEREOS (I,E, LA CARGA GENETICA), PARA ELLO OBTENDREMOS SECUENCIAS GENOMICAS CORRESPONDIENTES A EXONES Y REGIONES INTERGENICAS A TRAVES DE LA SECUENCIACION NGS DE LIBRERIAS ENRIQUECIDAS, COMPARAREMOS LOS PATRONES DE VARIACION EN LOCI SUPUESTAMENTE NEUTRALES (REGIONES INTERGENICAS) Y FUNCIONALES (EXONES) EN POBLACIONES CON DISTINTA HISTORIA DEMOGRAFICA Y EDADES, BUSCAREMOS SEÑALES DE SELECCION BALANCEADORA Y PURIFICADORA EN LAS DISTINTOS LOCI SECUENCIADOS, Y ESTIMAREMOS LA CARGA GENETICA MEDIANTE LA IDENTIFICACION DE ALELOS POTENCIALMENTE DELETEREOS, LOS LOCI IDENTIFICADOS COMO CANDIDATOS DE ESTAR SOMETIDOS A LA ACCION RECIENTE DE LA SELECCION BALANCEADORA Y LOS QUE SE IDENTIFIQUEN COMO PORTADORES DE VARIANTES PERJUDICIALES SERAN ESTUDIADOS SOBRE MUESTRAS POBLACIONALES AMPLIADAS Y SOBRE GENEALOGIAS CONOCIDAS PARA PONER A PRUEBA ESTAS HIPOTESIS,LA PRESENTE PROPUESTA SE CONVERTIRA EN UNO DE LOS PRIMEROS ESTUDIOS GENOMICOS EN ESPECIES EN PELIGRO DE EXTINCION HASTA LA FECHA, E INTENTARA RESPONDER A DOS PREGUNTAS BASICAS DEL PARADIGMA DE LA GENETICA DE LA CONSERVACION, I,E,: I ) ¿HASTA QUE PUNTO SE VE AFECTADA LA VARIACION GENETICA ADAPTATIVA EN POBLACIONES PEQUEÑAS Y AISLADAS? , Y II ) ¿CUALES SON LOS MECANISMOS QUE CONECTAN LOS PATRONES Y LA DINAMICA DE LA VARIACION GENETICA CON EL FITNESS Y LA ADAPTACION? LINCE IBÉRICO\ LINCE BOREAL\ GENÓMICA CONSERVACIÓN\ SELECCIÓN BALANCEADORA\ SELECCIÓN PURIFICADORA\ CARGA GENÉTICA\ CUELLO DE BOTELLA\ EROSIÓN GENÉTICA

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