Descripción del proyecto
LOS RUMIANTES DOMESTICOS DEL OESTE DE AFRICA CONSTITUYEN UN MODELO UNICO PARA EL ESTUDIO DE LAS BASES GENETICAS DE LA ADAPTACION AL AMBIENTE. SON EL RESULTADO DE UN PROCESO UNICO DE SELECCION NATURAL PARA ADAPTACION A UN AMBIENTE DESFAVORABLE DONDE SON CAPACES DE SOBREVIVIR Y PRODUCIR. AUNQUE SE TRATA DE ESPECIES SEPARADAS POR UN TIEMPO EVOLUTIVO RELATIVAMENTE CORTO (≈20 MILLONES DE AÑOS; PARMA ET AL. 2004) Y QUE HAN SIDO SOMETIDAS A LAS MISMAS PRESIONES AMBIENTALES DE SELECCION, HAN DESARROLLADO RESPUESTAS DE ADAPTACION, PARTICULARMENTE LA RESPUESTA TRIPANOTOLERANTE, COMO RESULTADO DE PROCESOS DE SELECCION NATURAL DIFERENTES, SEPARADOS POR VARIOS MILES DE AÑOS (GIFFORD-GONZALEZ 2000). EL GANADO BOVINO Y OVINO PRESENTA RESPUESTAS TRIPANOTOLERANTES DIFERENTES (GEERTS ET AL. 2009): MIENTRAS QUE EL BOVINO ES RESISTENTE A LA TRIPANOSOMIASIS, YA QUE INICIA Y MANTIENE RESPUESTAS INMUNES CONTRA LA INFESTACION, LLEGANDO A LA AUTOCURACION, LA OVEJA DJALLONKE SE CONSIDERA RESILIENTE YA QUE MANTIENE SU APTITUD PRODUCTIVA INCLUSO CON PARASITEMIA PERSISTENTE. LA RESPUESTA ADAPTATIVA DE LOS RUMIANTES DOMESTICOS DEL OESTE DE AFRICA ES DE GRAN COMPLEJIDAD YA QUE EXISTEN EVIDENCIAS DE QUE LOS MECANISMOS LIGADOS LA RESISTENCIA A LAS PARASITOSIS GASTROINTESTINALES ESTAN ASOCIADOS A LA TRIPANOSUSCEPTIBILIDAD (WOOLASTON Y BAKER 1996; FALL ET AL. 1999).LA PRESENTA PROPUESTA PRETENDE APROVECHAR LA EXPERIENCIA ADQUIRIDA DURANTE EL DESARROLLO DEL PROYECTO CORAF-WORLD BANK 03/GRN/16 Y LA EJECUCION DEL PROYECTO AGL2011-27585 EN EL QUE SE HA LLEVADO A CABO LA SECUENCIACION DE LAS ZONAS CODIFICANTES DE LOS GENES CANDIDATOS MAS IMPORTANTES PARA LA RESPUESTA TRIPANOTOLERANTE: CXCR4, ARHGAP15, INHBA Y TICAM1 (ALVAREZ ET AL. 2016A,B,C). SE HA ENCONTRADO UNA VARIABILIDAD GENETICA MUY BAJA ENTRE GRUPOS BOVINOS DISTANTES Y EN DIFERENTES ESPECIES DE LA TRIBU BOVINI COMO LA CABRA, OVEJA, BISONTE EUROPEO Y AMERICANO, BUFALO AFRICANO O ÑU. ESTO SUGIERE QUE LA ANATOMIA MOLECULAR DE LA TRIPANOTOLERANCIA ESTA POR IDENTIFICAR.PARTIENDO DE ESTE CONOCIMIENTO PREVIO, LA PRESENTE PROPUESTA PRETENDE APLICAR ESTRATEGIAS DE GENOMICA COMPARATIVA PARA CONTRIBUIR AL CONOCIMIENTO DE LA ARQUITECTURA GENETICA RESPONSABLE DE LA RESPUESTA ADAPTATIVA EN RUMIANTES DOMESTICOS. LA GENOMICA COMPARATIVA PUEDE PROPORCIONAR CONOCIMIENTO SOBRE LAS BASES GENETICAS SUBYACENTES EN RESPUESTAS FENOTIPICAS SIMILARES RESULTADO DE UNA PRESION ADAPTATIVA COMUN (NIELSEN ET AL. 2005; KIM ET AL. 2012).EL GENOTIPADO CON CHIPS DE SNPS DE ALTA DENSIDAD UNA MUESTRA DE BOVINOS Y OVINOS TRIPANOTOLERANTES Y TRIPANOSUSCEPTIBLES PERMITIRA IDENTIFICAR AREAS GENOMICAS CON SEÑALES DE SELECCION POR BARRIDO GENOMICO EN LAS DOS ESPECIES. TRAS ACOTAR LAS AREAS GENOMICAS DE INTERES DENTRO DE ESPECIE MEDIANTE ANALISIS DE ASOCIACION CON CARACTERES DE RESPUESTA TRIPANOTOLERANTE SE CONSTRUIRA UN MAPA SINTENICO ENTRE ESAS AREAS GENOMICAS HETEROLOGAS (BOVINO Y OVINO) QUE PERMITA LA IDENTIFICACION DE GENES CANDIDATOS. SE PREVE LA COMPROBACION DE LOS RESULTADOS OBTENIDOS EN UNA POBLACION BIEN CARACTERIZADA DE GANADO FRISON EUROPEO, SOMETIDA A PRESIONES DE SELECCION DIFERENTES, PARA DISCERNIR SI LAS AREAS HETEROLOGAS PARA ADAPTACION AL MEDIO Y RESISTENCIA A ENFERMEDADES IDENTIFICADAS EN EL MODELO DE GENOMICA COMPARATIVA PROPUESTO RESPONDEN AL SIMPLE EFECTO DE UN PROCESO LOCAL O SON ZONAS GENOMICAS DE IMPORTANCIA GENERAL EN LA ARQUITECTURA GENETICA DE ESOS CARACTERES EN LOS RUMIANTES DOMESTICOS. ENÓMICA COMPARATIVA\BARRIDO SELECTIVO\SINTENIA\RESPUESTA TRIPANOTOLERANTE\GANADO OVINO\GANADO BOVINO