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PID2019-108173GA-I00

Financiado

GENOMAS GIGANTES EN PLANTAS TERRESTRES: ESTUDIO DE LOS PROCESOS EVOLUTIVOS RELAC...

GENOMAS GIGANTES EN PLANTAS TERRESTRES: ESTUDIO DE LOS PROCESOS EVOLUTIVOS RELACIONADOS CON LA OBESIDAD GENOMICA EXISTEN EVIDENCIAS FEHACIENTES QUE DEMUESTRAN EL IMPACTO QUE TIENE EL TAMAÑO DEL GENOMA SOBRE MUCHOS DE LOS PROCESOS QUE ACONTECEN A NIVEL GENOMICO Y CELULAR, LLEGANDO A INFLUIR EN EL DESARROLLO, SIN EMBARGO, A PESAR DE LAS IMPLIC... ver más

01/01/2019

CSIC

149K€

Presupuesto del proyecto: 149K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01

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CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 149K€

Descripción del proyecto EXISTEN EVIDENCIAS FEHACIENTES QUE DEMUESTRAN EL IMPACTO QUE TIENE EL TAMAÑO DEL GENOMA SOBRE MUCHOS DE LOS PROCESOS QUE ACONTECEN A NIVEL GENOMICO Y CELULAR, LLEGANDO A INFLUIR EN EL DESARROLLO, SIN EMBARGO, A PESAR DE LAS IMPLICACIONES TAN IMPORTANTES EN LA BIOLOGIA DE LOS ORGANISMOS, EL CONOCIMIENTO SOBRE COMO SE EXPANDEN LOS GENOMAS EN LAS PLANTAS HASTA LLEGAR A PROPORCIONES GIGANTESCAS ESTA TODAVIA EN UN ESTADO EMBRIONARIO, ESTE PROYECTO PRETENDE INVESTIGAR LA OBESIDAD GENOMICA EN PLANTAS TERRESTRES DESDE UN PUNTO DE VISTA COMPARATIVO, ESTUDIANDO LINAJES TAXONOMICOS TAN DIVERGENTES COMO LOS PTERIDOFITOS, LAS MONOCOTILEDONEAS Y LAS DICOTILEDONEAS, LO QUE PLANTEA UNA OPORTUNIDAD SIN PRECEDENTES PARA GENERAR CONOCIMIENTO SOBRE LA DIVERSIDAD DE TAMAÑOS GENOMICOS EN PLANTAS, ASI COMO LA ORGANIZACION DE LOS MISMOS A DIFERENTES NIVELES, EN PRIMER LUGAR, SE COMBINARAN DATOS DISPONIBLES DEL TAMAÑO DEL GENOMA CON NUEVOS DATOS GENERADOS EN EL MARCO DE ESTE PROYECTO, ELABORANDO UN MUESTREO EXHAUSTIVO QUE INCLUYA LA DIVERSIDAD DE LAS FAMILIAS DE ANGIOSPERMAS QUE CONOCEMOS, ESTOS DATOS NOS PERMITIRAN INVESTIGAR LA DINAMICA DE ESTE PARAMETRO, SUS IMPLICACIONES EN CUANTO A LOS PROCESOS DE DIVERSIFICACION, ASI COMO ESTABLECER UN MARCO TEMPORAL ROBUSTO DE LOS EPISODIOS DE EXPANSION GENOMICA, EL SIGUIENTE NIVEL PRETENDE CARACTERIZAR E IDENTIFICAR LAS SECUENCIAS DE ADN CLAVE EN FENOMENOS DE OBESIDAD GENOMICA EN LAS PSILOTACEAE (PTERIDOFITOS), MELANTHIACEAE (MONOCOTILEDONEAS), LORANTHACEAE Y SANTALACEAE (DICOTILEDONEAS), SABEMOS QUE LA DIVERSIDAD DE TAMAÑOS GENOMICOS SE RIGE PRINCIPALMENTE POR LAS DIFERENCIAS EN LA ACUMULACION DE ADN REPETITIVO, INCLUYENDO SECUENCIAS REPETIDAS EN TANDEM Y ELEMENTOS DISPERSOS EN EL GENOMA, QUE ABARCAN LA FRACCION MAYORITARIA DEL CONTENIDO GENOMICO EN LAS PLANTAS, ASI PUES, IDENTIFICAR ESTAS SECUENCIAS Y LOS PROCESOS RESPONSABLES DE LA APARICION DE GENOMAS EXTREMADAMENTE GRANDES ES ESENCIAL PARA ENTENDER COMO SE HAN ORIGINADO LOS GENOMAS GIGANTES, Y COMO SE ORGANIZAN, ESTRATEGICAMENTE, ESTE PROYECTO ESTA DISEÑADO PARA COMPROBAR LA HIPOTESIS GENERAL EN LA QUE SE PLANTEA QUE LOS GENOMAS GIGANTES HAN SURGIDO DEBIDO A LA ACCION COMBINADA DE LA ACUMULACION GRADUAL DE SECUENCIAS DE ADN REPETITIVO DURANTE LARGOS PERIODOS DE TIEMPO, JUNTO A UNA BAJA TASA DE ELIMINACION DE SECUENCIAS DE ADN, PARA ELLO, SE INTEGRARAN ESTRATEGIAS DE SECUENCIACION COMPLEMENTARIAS, PARA PODER ASI COMPARAR Y EVALUAR PATRONES DE REGULACION DE AMPLIFICACION DE ADN (A TRAVES DE SUS NIVELES DE METILACION), ENTRE ESPECIES CON UN TAMAÑO GENOMICO GRANDE, Y SUS CONGENERES QUE PRESENTAN GENOMAS PEQUEÑOS, GENERAREMOS, POR TANTO, LAS PRIMERAS EVIDENCIAS SOBRE LA EFECTIVIDAD DE LOS MECANISMOS REGULADORES DEL TAMAÑO DEL GENOMA EN ESTAS FAMILIAS, POR ULTIMO, SE ESTUDIARA EL EFECTO COMBINADO DE LA OBESIDAD GENOMICA JUNTO A EVENTOS DE POLIPLOIDIA EN CARACTERES DE INTERES EN PLANTAS, UTILIZANDO DEL GENERO TMESIPTERIS (PSILOTACEAE) COMO CASO DE ESTUDIO, SE APLICARAN METODOS DESARROLLADOS RECIENTEMENTE PARA INFERIR NIVELES DE PLOIDIA A TRAVES DE DATOS GENOMICOS, E INVESTIGAREMOS SU INFLUENCIA EN CARACTERES FENOTIPICOS COMBINANDO MUESTRAS DE HERBARIO CON COLECCIONES RECIENTES, TODO ELLO NOS PERMITIRA ESTABLECER UNA PERSPECTIVA SOBRE LOS CAMBIOS ACONTECIDOS A ESCALA TEMPORAL, EN RESUMEN, ESTE PROYECTO CONTRIBUIRA AL CONOCIMIENTO DE LOS GENOMAS EN PLANTAS NO-MODELO, APORTANDO EVIDENCIAS RELEVANTES SOBRE EL ORIGEN Y LAS CONSECUENCIAS DE LA OBESIDAD GENOMICA EN PLANTAS, ADN REPETITIVO\ELEMENTOS TRANSPONIBLES\REPETICION EN TANDEM\EVOLUCION DEL GENOMA\OBESIDAD GENOMICA\TAMAÑO DEL GENOMA\POLIPLOIDIA\DIVERSIDAD DE PLANTAS

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