Descripción del proyecto
CONOCER LA FUNCION O FUNCIONES QUE REALIZA CADA UNO DE NUESTROS GENES ES EL OBJETIVO PRINCIPAL DE LA BIOLOGIA MOLECULAR, DESPUES DE CONOCER LA SECUENCIA DEL GENOMA, PARA ELLO ES NECESARIO DISPONER DE LAS HERRAMIENTAS ADECUADAS, EL DESCUBRIMIENTO DE LOS RNA DE INTERFERENCIA (IRNA) Y MICRORNAS (MIRNAS) Y DE SU CAPACIDAD DE SUPRIMIR LA EXPRESION GENICA, HA PERMITIDO LA IDENTIFICACION DE NUMEROSOS GENES IMPLICADOS EN DIFERENTES PROCESOS BIOLOGICOS MEDIANTE ESCRUTINIOS GENETICOS FUNCIONALES, SE HAN CONSTRUIDO Y UTILIZADO CON EXITO GENOTECAS DE IRNAS COMPUESTAS POR MAS DE 100,000 CLONES, QUE PODRIAN BLOQUEAR MAS DE 22,000 GENES HUMANOS Y DE RATON, SIN EMBARGO, SU USO ESTA RESTRINGIDO ACTUALMENTE A UN PEQUEÑO NUMERO DE LABORATORIOS DEBIDO A SU ELEVADO PRECIO Y A LA SOFISTICADA INFRAESTRUCTURA NECESARIA PARA MANIPULARLAS, EN ESTE PROYECTO SE PROPONE LA GENERACION DE NUEVAS Y MAS ECONOMICAS GENOTECAS DE SIRNAS, ESTAS GENOTECAS SE GENERAN A PARTIR DE OLIGONUCLEOTICOS ALEATORIOS DE 19 BASES, FLANQUEADOS POR SECUENCIAS CONSTANTES Y ENRIQUECIDOS PARA DETERMINADOS SIRNAS MEDIANTE HIBRIDACION CON CDNAS (1C) DERIVADOS DE TRASCRIPTOMAS ESPECIFICOS, DESPUES DE SER RETROTRANSCRITOS, LOS OLIGONUCLEOTIDOS DE DOBLE CADENA SE CLONAN EN UN VECTOR LENTIVIRAL ENTRE LOS PROMOTORES H1 Y U6 DE RNA POLIMERASA III, LOS LENTIVIRUS SE INTEGRAN EN EL GENOMA DE LAS CELULAS Y SE GENERAN LAS MOLECULAS CORRESPONDIENTES A CADA SIRNA MADURO RESULTANDO LA ACTIVACION DEL COMPLEJO RISC QUE RECLUTA LA CADENA CORRECTA DE SIRNA Y DEGRADA LAS MOLECULAS HOMOLOGAS DE MRNA, MIENTRAS QUE CADA SIRNA BLOQUEA UN UNICO GENE, CUALQUIER MIRNA PUEDE BLOQUEAR NUMEROSOS MRNAS, ESTE HECHO ES DE GRAN INTERES PARA LA BUSQUEDA DE FENOTIPOS QUE SURJAN DEL BLOQUEO SIMULTANEO DE VARIOS GENES, ACTUALMENTE LAS GENOTECAS DE MIRNAS SE HA UTILIZADO EXCLUSIVAMENTE PARA LA IDENTIFICACION DE MIRNAS Y ANALIZAR SU PATRON DE EXPRESION Y, POR TANTO, NO SON VIABLES PARA ENSAYOS FUNCIONALES, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS TAMBIEN EL DESARROLLO DE ESCRUTINIOS GENETICOS FUNCIONALES UTILIZANDO NUEVAS GENOTECAS LENTIVIRALES DE MIRNAS, UTILIZANDO PROCEDIMIENTOS ESTANDARIZADOS PARA CLONAR MIRNAS Y UNA ESTRATEGIA SIMILAR A LA DESCRITA PARA LAS GENOTECAS DE SIRNAS, PARA VALIDAR LA UTILIDAD DE ESTAS GENOTECAS EN ESCRUTINIOS GENETICOS FUNCIONALES, SE HAN DISEÑADO TRES ANALISIS DIFERENTES PARA IDENTIFICAR RESPECTIVAMENTE GENES IMPLICADOS EN LA SEÑALIZACION DEL CHECKPOINT DEL HUSO MITOTICO, EN LA MUERTE CELULAR POR PERDIDA DE INTERACCION CON LA MATRIZ CELULAR (ANOIKIS) Y EN METASTASIS,CREEMOS QUE ESTAS NUEVAS GENOTECAS SERAN UNA HERRAMIENTA DE GRAN UTILIDAD EN LOS ESCRUTINIOS DE PERDIDA DE FUNCION EN CELULAS DE MAMIFERO, siRNAs\miRNAs\lentivirus\checkpoints\anoikis\metastasis