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PID2021-124297NB-C31

Financiado

FISICA ESTADISTICA PARA MATERIA BLANDA BIO-NANO

ESTUDIAREMOS LAS INTERACCIONES ENTRE MEMBRANAS BIOLOGICAS Y MOLECULAS PEQUEÑAS, COMO PEPTIDOS Y ATP, CALCULANDO LAS BARRERAS DE ENERGIA LIBRE PARA EL CRUCE DE MEMBRANAS Y EVALUANDO EL POTENCIAL DE FUERZAS MEDIAS CON MODELOS ATOMIS... ver más

01/01/2021

79K€

Presupuesto del proyecto: 79K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 327

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 327

Presupuesto del proyecto 79K€

Descripción del proyecto ESTUDIAREMOS LAS INTERACCIONES ENTRE MEMBRANAS BIOLOGICAS Y MOLECULAS PEQUEÑAS, COMO PEPTIDOS Y ATP, CALCULANDO LAS BARRERAS DE ENERGIA LIBRE PARA EL CRUCE DE MEMBRANAS Y EVALUANDO EL POTENCIAL DE FUERZAS MEDIAS CON MODELOS ATOMISTICOS. LAS PROPIEDADES GENERALES DEL DISEÑO DE PROTEINAS SERAN EL OBJETIVO DE NUESTRO ESTUDIO SOBRE COMO LA DIMENSIONALIDAD CAMBIA EL BALANCE ENTRE EL APORTE ENTROPICO Y LAS OTRAS CONTRIBUCIONES A LA ENERGIA LIBRE DE GIBBS DURANTE EL PLEGAMIENTO. NUESTRO OBJETIVO ES ESTABLECER UN MARCO TEORICO PARA ESTUDIAR DIFERENTES CATEGORIAS DE PROTEINAS QUE VAN DESDE PROTEINAS ORDENADAS ESTRUCTURALMENTE A PROTEINAS INTRINSECAMENTE DESORDENADAS (IDPS), EVALUANDO EN CADA CASO LA ENERGIA LIBRE DE SOLVATACION. ADEMAS, LA TRANSLACION DE LOS DETALLES ATOMISTICOS DE LA INTERACCION PROTEINA-AGUA Y PROTEINA-PROTEINA A MODELOS DE PROTEINA DE GRANO GRUESO EN SOLVENTE EXPLICITO NOS PERMITIRA DESARROLLAR UN ENFOQUE DE FISICA ESTADISTICA PARA LAS FLUCTUACIONES ESTRUCTURALES DE LAS IDPS CERCA DE UA SEPARACION DE FASE LIQUIDO-LIQUIDO. LAS INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA SON FUNDAMENTALES TAMBIEN PARA COMPRENDER COMO SE AGREGAN ENTRE ELLAS Y COMO LOS NANOMATERIALES AFECTAN ESTA AGREGACION. USANDO MACHINE LEARNING SUPERVISADO Y EN COLABORACION CON GRUPOS EXPERIMENTALES EN DUBLIN Y TRIESTE, INCLUIREMOS EN NUESTRO ESTUDIO GLICOPROTEINAS, COMO LAS QUE SE USAN COMO RECUBRIMIENTO DE NANOMATERIALES PARA LA ADMINISTRACION DE FARMACOS A LOS TEJIDOS CANCEROSOS CON DIFERENTES EFECTOS SOBRE LA AUTOFAGIA CELULAR O EL CRUCE DE LA BARRERA HEMATOENCEFALICA. A PARTIR DE CONFIGURACIONES GENERADAS POR SIMULACIONES ATOMISTICAS, CALCULAREMOS EL POTENCIAL DE FUERZA MEDIA (PMF) ENTRE PROTEINAS Y NANOPARTICULAS PARA ESTUDIAR SU ADSORCION Y FORMACION DE CORONA CON MODELOS DE GRANO GRUESO. NUESTRO OBJETIVO ES DESARROLLAR UN ENFOQUE GENERAL PARA APLICAR EN BIOMEDICINA O EN CONDICIONES ALEJADAS DEL AMBIENTE, POR EJEMPLO, ESTADOS INFLAMATORIOS. USAREMOS MODELOS DE GRANO GRUESO TAMBIEN PARA ESTUDIAR EL AUTOENSAMBLAJE DE LAS CELULAS ROJAS DE LAS SANGRE. NUESTRO OBJETIVO ES DISEÑAR EXPERIMENTOS QUE PUEDAN PROBAR NUESTRAS PREDICCIONES SOBRE QUE RANGO DE PARAMETROS CORRESPONDE A MECANISMOS ESPECIFICOS DE AUTOENSAMBLAJE. TAMBIEN INVESTIGAREMOS EL COMPORTAMIENTO DE ADELGAZAMIENTO POR CIZALLAMIENTO OBSERVADO EN EL EXPERIMENTO CON NUESTROS COLABORADORES EXPERIMENTALES. TAMBIEN SE PROPONDRAN EXPERIMENTOS EN RELACION CON LAS HELICES AUTOTERMOFORETICAS A NANOESCALA. NUESTRO OBJETIVO ES DEMOSTRAR LA PROPULSION POR AUTOTERMOFORESIS INDUCIDA POR RADIACION EN MOLECULAS REALISTAS MEDIANTE SIMULACIONES ATOMISTICAS, Y COMO ESTE FENOMENO SE RELACIONA CON EXPERIMENTOS RECIENTES EN SISTEMAS SUPRAMOLECULARES BAJO LUZ. ADEMAS, NOS ENFOCAMOS EN EL TRATAMIENTO DEL AGUA Y LA SUSTENTABILIDAD. LOS NANOMATERIALES, CON SU RELACION INTRINSECAMENTE ALTA ENTRE SUPERFICIE Y VOLUMEN Y LA ABUNDANCIA DE SITIOS QUIMICAMENTE ACTIVOS, SON EXCELENTES PARA APLICACIONES COMO EL SANEAMIENTO DEL AGUA. NUESTRO OBJETIVO GENERAL ES COMPRENDER LOS MECANISMOS Y REQUISITOS PREVIOS DEL PROCESO DE DEGRADACION A NIVEL ATOMICO PARA MATERIALES CANDIDATOS PARA EL TRATAMIENTO DE AGUA CONTAMINADA Y AGUAS RESIDUALES ANTES DE QUE INGRESEN AL MEDIO AMBIENTE. PARA LIQUIDOS MUY MISCIBLES CON AGUA, COMO EL METANOL, O UNA MEZCLA CON DIOXIDO DE CARBONO, EXPLORAREMOS COMO LOS NANOPOROS PUEDEN AYUDARNOS A SEPARARLOS. INAMICA MOLECULAR\MATERIA ACTIVA\SMALL MOLECULES\PROTEINAS\NANOPARTICULAS\DISOLUCIONES\BIOMEMBRANAS\AGUA\MULTIESCALA

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