Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO CUBRE EL ESTUDIO DE PROCESOS BIOMOLECULARES, CELULARES, Y SUPRACELULARES DESDE UNA PERSPECTIVA INTEGRADA DE LA FISICA ESTADISTICA, JUNTAMENTE CON EL DESARROLLO DE LA METODOLOGIA NECESARIA PARA LLEVARLO A CABO, SE CENTRA EN EL ENSAMBLADO DE COMPLEJOS MACROMOLECULARES DE PROTEINAS Y ADN EN REDES CELULARES, DEBIDO A SU IMPORTANCIA FUNDAMENTAL Y A SUS IMPLICACIONES BIOMEDICAS, ESTOS COMPLEJOS CONTROLAN PROCESOS CELULARES ESENCIALES, TALES COMO LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION, LA REPLICACION, LA RECOMBINACION, EL SILENCIAMIENTO DE LA CROMATINA, Y EL MANTENIMIENTO DE LOS TELOMEROS, QUE A MENUDO SON ALTERADOS EN ENFERMEDADES HUMANAS Y TRASTORNOS DEL DESARROLLO, QUE INCLUYEN EL CANCER COMO EL EJEMPLO MAS DESTACADO, LA COMPLEJIDAD INHERENTE DE LOS COMPLEJOS DE ADN-PROTEINA, ESPECIALMENTE DE AQUELLOS CON LAZOS, PRESENTA UN GRAN DESAFIO PARA LOS METODOS TRADICIONALES DE BIOQUIMICA EXPERIMENTAL Y COMPUTACIONAL, HASTA EL PUNTO DE QUE ACTUALMENTE SOLO HAY UN CONOCIMIENTO MUY LIMITADO DE LOS FACTORES QUE DETERMINAN EL ENSAMBLADO MACROMOLECULAR DENTRO LA CELULA, LA FINALIDAD DE ESTE PROYECTO ES DESARROLLAR LA INTUICION NECESARIA SOBRE LAS BASES FISICO-ESTADISTICAS DE LOS ENSAMBLADOS MACROMOLECULARES Y DE UTILIZARLA PARA PONER EN PRACTICA METODOS PRECISOS DE ANALISIS Y PREDICCION DEL COMPORTAMIENTO CELULAR QUE TENGAN EN CUENTA LAS PROPIEDADES FISICAS DE LAS INTERACCIONES MOLECULARES, ESTE PASO ES UN PRERREQUISITO PARA LA IDENTIFICACION DE DIANAS MOLECULARES QUE MODIFIQUEN EL COMPORTAMIENTO CELULAR DE UNA MANERA PREDETERMINADA Y TIENE COMO OBJETIVO A LARGO PLAZO CONECTAR LA PREDICCION DE RESULTADOS CLINICOS CON PROPIEDADES MOLECULARES Y FISICAS, VAMOS A UTILIZAR NUEVOS METODOS BASADOS EN LA FISICA ESTADISTICA, DESARROLLADOS POR EL IP DE ESTA PROPUESTA Y COLABORADORES, PARA EL ESTUDIO DE ENSAMBLADOS MACROMOLECULARES, ESTOS NUEVOS ENFOQUES PERMITEN ESTIMAR LOS RITMOS DE REACCION AL IGUAL QUE INCORPORAR LA DINAMICA DE ENSAMBLADO RESULTANTE EN LA DINAMICA ESTOCASTICA DE LAS REDES CELULARES, LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS DE ESTE PROYECTO SON: 1) INCORPORAR PROPIEDADES MOLECULARES EN LA DESCRIPCION DE LOS COMPLEJOS DE PROTEINA-ADN Y SUS EFECTOS EN LA REGULACION GENETICA, 2) INTEGRAR LOS COMPLEJOS PROTEINA-ADN CON EL COMPORTAMIENTO CELULAR, 3) UNIFICAR DATOS COMPUTACIONALES, MOLECULARES, BIOQUIMICOS, Y FISIOLOGICOS EN DESCRIPCIONES FISICAS QUE SEAN MECANISTICAMENTE PREDICTIVAS, SE ESPERA QUE LOS RESULTADOS DE FISICA ESTADISTICA OBTENIDOS, QUE CUBRIRAN MULTIPLES ESCALAS A TRAVES DE DIVERSOS NIVELES DE ORGANIZACION BIOLOGICA, OFREZCAN UN PUNTO DE PARTIDA EFICAZ MUY NECESARIO PARA AVANZAR MAS ALLA DE LOS ESQUEMAS TIPICOS DE LOS LIBROS DE TEXTO DE BIOLOGIA CELULAR HASTA LA DINAMICA ESTOCASTICA REAL DE LOS PROCESOS CELULARES, BIOFISICA\FISICA ESTADISTICA\FISICA DE LA MATERIA CONDENSADA\BIOLOGIA DE SISTEMAS\BIOLOGIA COMPUTACIONAL