Descripción del proyecto
EL TEMA GENERAL DE ESTE PROYECTO ES EL ESTUDIO DE PROCESOS BIOMOLECULARES Y CELULARES DESDE UNA PERSPECTIVA DE FISICA ESTADISTICA. EL OBJETIVO SE CENTRA EN DESCUBRIR Y ANALIZAR LOS MECANISMOS DE INFERENCIA, PRONOSTICO Y CAPACIDAD DE ACCION QUE ESTAN PRESENTES EN LAS REDES DE ENSAMBLAJE MACROMOLECULAR EN LA CELULA. ESTOS SISTEMAS CONTROLAN PROCESOS CELULARES ESENCIALES, COMO LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION Y LA TRANSDUCCION DE SEÑALES, QUE REALIZAN DE MANERA FIABLE FUNCIONES EXTREMADAMENTE COMPLEJAS BAJO UNA AMPLIA GAMA DE CONDICIONES FLUCTUANTES. LA PREGUNTA EXPLICITA ES COMO LAS CELULAS PUEDEN IDENTIFICAR CONDICIONES CAMBIANTES COMPLEJAS (INFERENCIA), ANTICIPAR NUEVOS CAMBIOS (PREVISION) Y RESPONDER EN CONSECUENCIA (CAPACIDAD DE ACCION). TAL RENDIMIENTO DESAFIA LOS ENFOQUES BIOQUIMICOS TRADICIONALES CUANDO SE TIENEN EN CUENTA FLUCTUACIONES REALISTAS Y OTRAS LIMITACIONES MICROSCOPICAS. LOS DESAFIOS SE ORIGINAN NO SOLO POR LA FALTA DE INFORMACION EXPERIMENTAL SINO, LO QUE ES MAS IMPORTANTE, POR LA LIMITADA COMPRENSION DE COMO LOS FACTORES QUE IMPULSAN EL ENSAMBLAJE MACROMOLECULAR EN LA CELULA Y LOS PROCESOS INHERENTEMENTE DE NO EQUILIBRIO, COMO LA FOSFORILACION, EL TRAFICO INTRACELULAR Y LA DIFUSION DETERMINAN LAS CAPACIDADES DE INFERENCIA, PRONOSTICO Y ACCION EN SISTEMAS BIOFISICOS COMPLEJOS. PARA ABORDAR ESTAS CUESTIONES, HEMOS CENTRADO EL PROYECTO EN TORNO A CUATRO OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1) CARACTERIZAR LOS MECANISMOS DE INFERENCIA EN REDES NATURALES DE PROTEINA-ADN DESDE UNA PERSPECTIVA DE FISICA ESTADISTICA; 2) CARACTERIZAR LOS MECANISMOS DE INFERENCIA EN REDES NATURALES DE LIGANDO-RECEPTOR DESDE UNA PERSPECTIVA DE FISICA ESTADISTICA; 3) INTEGRAR LA INFERENCIA CON LOS MECANISMOS DE PRONOSTICO Y SUS RESPUESTAS; 4) IMPLEMENTAR ENFOQUES PARA DISEÑAR DE MANERA CONFIABLE REDES DE INTERACCIONES PARA INFERENCIA Y PRONOSTICO CON CAPACIDAD DE ACCION A NIVEL MOLECULAR. SE ESPERA QUE LOS RESULTADOS DE ESTE ESFUERZO DE FISICA ESTADISTICA A TRAVES DE DIFERENTES TIPOS DE SISTEMAS BIOFISICOS OFREZCAN UN PUNTO DE PARTIDA EFECTIVO UNIFICADOR MUY NECESARIO PARA AVANZAR DESDE LOS TIPICOS DIBUJOS DE LIBROS DE TEXTO DE BIOLOGIA CELULAR A LA DINAMICA ESTOCASTICA REAL DE PROCESOS CELULARES COMPLEJOS. ISICA ESTADISTICA\CAPACIDAD DE ACCION\PREVISION\INFERENCIA\REDES CELULARES