Descripción del proyecto
LA RESPUESTA A LA LUZ EN M, XANTHUS DEPENDE DE UN COMPLEJO ENTRAMADO DE ACCIONES REGULADORAS QUE SE CONECTA A SU VEZ CON OTRAS REDES DE CONTROL, MEDIANTE ELEMENTOS COMUNES (REGULADORES GLOBALES), O ELEMENTOS QUE GUARDAN PARECIDO ENTRE SI PERO PARTICIPAN EN OTROS PROCESOS, ESTE PROYECTO MULTIDISCIPLINAR TIENE COMO OBJETIVO GLOBAL EL ANALISIS FINO DE ALGUNAS DE ESAS ACCIONES REGULADORAS DE ESPECIAL INTERES, COMBINANDO UN ABORDAJE GENETICO-MOLECULAR CON ESTUDIOS ESTRUCTURALES Y FISICO-QUIMICOS DE ALGUNOS FACTORES IMPLICADOS, UN OBJETIVO ESPECIFICO SE REFIERE AL PRIMER PASO DE LA RESPUESTA A LA LUZ, TAMBIEN EL MENOS ESTUDIADO, EL ELEMENTO MAS TEMPRANO CONOCIDO, CARF, MEDIA LA INACTIVACION POR LA LUZ DEL FACTOR ANTI-SIGMA CARR, QUE REGULA NEGATIVAMENTE DICHA RESPUESTA SECUESTRANDO A UN FACTOR SIGMA-ECF, EXISTE INTERACCION FISICA ENTRE CARF Y CARR PERO IGNORAMOS SU RELEVANCIA FUNCIONAL, Y SI CARF ACTUA COMO RECEPTOR O COMO TRANSDUCTOR DE LA SEÑAL LUMINOSA, CUESTIONES QUE SE ABORDARAN EN ESTE PROYECTO,OTRO APARTADO DEL PROYECTO ATAÑE AL MODO DE ACCION DE CARH, EL PRIMER FACTOR TRANSCRIPCIONAL DESCRITO CUYA FUNCION REGULADORA DEPENDE DE VITAMINA B12, COMO CARA, CON QUIEN COMPARTE LA MISMA ARQUITECTURA DE DOMINIOS, CARH REPRIME EN LA OSCURIDAD LA EXPRESION DE UN OPERON QUE AGRUPA LA MAYORIA DE LOS GENES ESTRUCTURALES IMPLICADOS EN LA RESPUESTA A LA LUZ, TAMBIEN COMO CARA, CARH INTERACCIONA CON EL ANTIREPRESOR CARS (PRODUCIDO EN LA LUZ) A TRAVES DE SU DOMINIO DE UNION AL DNA, Y TAL INTERACCION DESMANTELA LOS COMPLEJOS CARH-DNA, SIN EMBARGO, A PESAR DE QUE AMBOS REPRESORES PRESENTAN UN DOMINIO DE UNION A B12, SOLO CARH, Y NO CARA, DEPENDE DE LA VITAMINA PARA EJERCER SU ACCION REPRESORA, COMPRENDER LAS BASES MOLECULARES/ESTRUCTURALES DE TALES DIFERENCIAS, AVERIGUAR COMO B12 PROMUEVE LA ACCION REPRESORA DE CARH, Y ABORDAR LA POSIBLE EXISTENCIA DE OTRA VIA A LA INACTIVACION DE CARH POR LA LUZ, INDEPENDIENTE DE CARS Y MEDIADA POR B12, SON OBJETIVOS ESPECIFICOS DE ESTE PROYECTO,ADEMAS, ESTE PROYECTO PRETENDE PROFUNDIZAR EN EL MODO DE ACCION DE CARD/CARG, UN SINGULAR COMPLEJO REGULADOR DE ACCION GLOBAL, CARD ES LA UNICA PROTEINA PROCARIOTICA CONOCIDA CON UN DOMINIO DE UNION AL DNA SIMILAR A LAS PROTEINAS HMGA EUCARIOTICAS, A PESAR DE SU CAPACIDAD INTRINSECA DE UNION AL DNA, TODAS LAS ACCIONES REGULADORAS DE CARD DEPENDEN DE LA INTERACCION FISICA DE SU DOMINIO N-TERMINAL (CARDNTER) CON CARG, UNA PROTEINA QUE NO SE UNE DIRECTAMENTE AL DNA, SE ESTUDIARA SI CARG FUNCIONA COMO ¿PUENTE¿ ENTRE CARD Y LA MAQUINARIA DE TRANSCRIPCION, Y SI LA FUNCION REGULADORA GLOBAL DE CARD/CARG SE DEBE A SU REQUERIMIENTO OBLIGADO EN LA ACTUACION DE OTROS FACTORES SIGMA DE LA FAMILIA ECF, DADO QUE LA ESPECIFICIDAD EN LA INTERACCION CARD-CARG ES CRUCIAL PARA LA FUNCION DEL COMPLEJO, SE ABORDARA LA DESCRIPCION ESTRUCTURAL DETALLADA DE DICHA INTERACCION, LA PROTEINA CDNL, SIMILAR EN TAMAÑO Y SECUENCIA A CARDNTER, PERTENECE A UNA AMPLIA FAMILIA DE PROTEINAS HUERFANAS DE FUNCION, A PESAR DE SU PARECIDO, CDNL Y CARDNTER NO SON FUNCIONALMENTE EQUIVALENTES, CDNL, INCAPAZ DE UNIRSE DIRECTAMENTE AL DNA, APARECE ASOCIADA AL NUCLEOIDE Y CUMPLE UNA FUNCION ESENCIAL RELACIONADA CON EL PROCESO DE DIVISION CELULAR, PARA PROFUNDIZAR EN EL MODO DE ACCION DE CDNL Y EVALUAR SU CONSERVACION EVOLUTIVA, PRETENDEMOS IDENTIFICAR POSIBLES FACTORES QUE RECLUTEN A CDNL AL NUCLEOIDE, ESTUDIAR SU FUNCION EN OTRA BACTERIA, Y ANALIZAR SU ESTRUCTURA Y LA DE OTRO MIEMBRO DE LA FAMILIA, TRANSCRIPCION\REGULADORES GLOBALES\RESPUESTA A LA LUZ\MYXOCOCCUS XANTHUS\RMN\ESTRUCTURA\VITAMINA B12\HMGA\ADAPTADOR TRANSCRIPCIONAL\METALOPROTEINAS