Hola,
¿eres nuevo aquí?

Regístrate gratis y conecta tu empresa con financiación pública, partners y proyectos.

Tengo cuenta

Regístrate

Ver video

REACTOMEgsa

Financiado

Cerrado

Extending the REACTOME Pathway Database for multi omics biomedical data analysis

The increasing availability of high-throughput ‘omics technologies results in unprecedented opportunities for precision medicine and biomedical research. With the increasing availability of large amounts of data (‘big data’), data... ver más

31/07/2019

EMBL

98K€

Presupuesto del proyecto: 98K€

Líder del proyecto

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2019-07-31

MSCA-IF-2017: Individual Fellowships

I+D

Cerrada hace 7 años

0% 100% 100%

Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

Información adicional privada

No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

1 Participantes

EMBL

97.73K€ | Lider

Proyectos interesantes

INTERCROSSING

Data Science

Medical Technol...

4M€ Cerrado

DIN2019-010848

Data Science

Medical Technol...

69K€ Cerrado

CAUSALPATH

Data Science

Medical Technol...

2M€ Cerrado

PTQ-10-04257

Data Science

Medical Technol...

61K€ Cerrado

BIO2015-71658-R

Data Science

Medical Technol...

Cerrado

STATegra

Data Science

Medical Technol...

8M€ Cerrado

Conecta tu I+D

¿Tienes un proyecto y buscas un partner? Gracias a nuestro motor inteligente podemos recomendarte los mejores socios y ponerte en contacto con ellos. Te lo explicamos en este video

Duración del proyecto: 15 meses Fecha Inicio: 2018-04-03
Fecha Fin: 2019-07-31

Líder del proyecto

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Presupuesto del proyecto 98K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto The increasing availability of high-throughput ‘omics technologies results in unprecedented opportunities for precision medicine and biomedical research. With the increasing availability of large amounts of data (‘big data’), data analysis and interpretation have become a major bottleneck. Pathway analysis techniques are used to incorporate existing biological knowledge into the data analysis and allow researchers to focus on the interpretation of regulated biological processes. Despite the existence of many advanced pathway analysis algorithms, most leading pathway analysis resources still rely on simplistic ‘gene set over representation’ analyses (ORA) and cannot integrate data from different ‘omics approaches. Reactome is one of the most popular resources for pathway information. Its open-access data model, powerful web interface, and stringent manual curation and peer-review provide an ideal foundation for this project’s developments. In this project, I will extend Reactome towards an analysis platform for multi-omics biomedical studies. I will replace its current ORA approach with more sophisticated pathway algorithms supporting transcriptomics, microarray, proteomics, and metabolomics data. Next, I will extend Reactome to analyse datasets of samples that cannot be attributed to a phenotype. The extended version of Reactome will be able to derive one expression value per pathway which can then be correlated with clinical parameters to identify clinical relevant biological processes. This will make Reactome a prime resource for multi-omics biomedical studies. I anticipate that the successful completion of this project will allow me to integrate and extend my current skills as a medical doctor and a bioinformatician towards systems biology studies. The additional gained experience in project management and communication of scientific results will form the basis for my envisaged career to start my own interdisciplinary biomedical research group.

Conecta tu I+D

Entra hoy

¿Olvidé mi contraseña?

Financiación

Empresas

CTIs/Universidades

Proyectos

Investigadores