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TED2021-131285B-I00

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EVALUACION DE LA DIVERSIDAD GENOMICA DEL TOPILLO NIVAL, CHIONOMYS NIVALIS, Y SU...

EVALUACION DE LA DIVERSIDAD GENOMICA DEL TOPILLO NIVAL, CHIONOMYS NIVALIS, Y SU CAPACIDAD DE ADAPTACION AL CAMBIO CLIMATICO LOS ECOSISTEMAS DE MONTAÑA SON EXTREMADAMENTE SENSIBLES AL CAMBIO CLIMATICO, QUE TIENE UN FUERTE IMPACTO EN LA CRIOSFERA, REDUCIENDO EL VOLUMEN DE GLACIARES Y PERMAFROST Y ELEVANDO EL NIVEL ALTITUDINAL DE LA CAPA DE NIEVE. EL PRIN... ver más

01/01/2021

UGR

139K€

Presupuesto del proyecto: 139K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 5509

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE GRANADA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 5509

Presupuesto del proyecto 139K€

Descripción del proyecto LOS ECOSISTEMAS DE MONTAÑA SON EXTREMADAMENTE SENSIBLES AL CAMBIO CLIMATICO, QUE TIENE UN FUERTE IMPACTO EN LA CRIOSFERA, REDUCIENDO EL VOLUMEN DE GLACIARES Y PERMAFROST Y ELEVANDO EL NIVEL ALTITUDINAL DE LA CAPA DE NIEVE. EL PRINCIPAL EFECTO DEL CAMBIO CLIMATICO SOBRE LAS POBLACIONES DE ESPECIES DE MONTAÑA ES LA CONTRACCION Y FRAGMENTACION DE SUS AREAS DE DISTRIBUCION, LO QUE REDUCE SU TAMAÑO EFECTIVO, ORIGINANDO FENOMENOS COMO LA ENDOGAMIA Y LA DERIVA GENETICA, QUE A SU VEZ REDUCEN LA DIVERSIDAD GENETICA. PROBABLEMENTE ESTA SEA LA SITUACION ACTUAL DE LAS POBLACIONES ESPAÑOLAS DE TOPILLO NIVAL, CHIONOMYS NIVALIS. LOS ESTUDIOS DE VARIABILIDAD GENETICA REALIZADOS HASTA EL MOMENTO EN ESTA ESPECIE SON CLARAMENTE INSUFICIENTES, POR LO QUE ANALIZAR LAS POBLACIONES A NIVEL GENOMICO ES FUNDAMENTAL PARA CONOCER SU GRADO DE DIVERSIDAD GENETICA Y DETERMINAR LAS ACCIONES DE CONSERVACION NECESARIAS. EL EMERGENTE CAMPO DE LA GENOMICA DE LA CONSERVACION PROMUEVE LA IDEA DE QUE DISPONER DE DATOS A ESCALA GENOMICA MEJORA LA CAPACIDAD DE LOS ADMINISTRADORES DE RECURSOS PARA PROTEGER LAS ESPECIES EN PELIGRO DE EXTINCION. HOY EN DIA, LAS TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION NGS PERMITEN IDENTIFICAR Y GENOTIPAR MILES DE SNPS EN EL GENOMA DE MUCHOS INDIVIDUOS, QUE SE PUEDEN UTILIZAR PARA ESTUDIOS EVOLUTIVOS, FILOGENOMICOS Y DE ESTRUCTURA POBLACIONAL. EN ESTA PROPUESTA PRETENDEMOS SECUENCIAR EL GENOMA DEL TOPILLO NIVAL Y REALIZAR UN ABORDAJE GENETICO INVERSO PARA ENCONTRAR GENES Y FACTORES AMBIENTALES INVOLUCRADOS EN LA ADAPTACION LOCAL DE ESTA ESPECIE. PARA ELLO, ANALIZAREMOS INDIVIDUOS DE 10 POBLACIONES QUE VIVEN EN DIFERENTES CONDICIONES AMBIENTALES (POR EJEMPLO, PRECIPITACION, TEMPERATURA, ALTITUD, VEGETACION, ENTRE OTRAS) EN TODA LA PENINSULA IBERICA. USAREMOS LA SECUENCIACION DE ADN ASOCIADA A SITIOS DE RESTRICCION (RAD-SEQ) PARA IDENTIFICAR UNA COLECCION DE SNP QUE SE USARA PARA PROBAR MARCAS DE SELECCION EN LAS POBLACIONES. CON ESTA INFORMACION, PROBAREMOS SI UN SUBCONJUNTO DE VARIACION GENOMICA PUEDE EXPLICARSE POR DIFERENCIAS AMBIENTALES E IDENTIFICAREMOS LA VARIACION GENETICA ASOCIADA AL CLIMA ENTRE LAS POBLACIONES. FINALMENTE, UTILIZAREMOS PROGRAMAS DE PREDICCION PARA INVESTIGAR QUE POBLACIONES PODRIAN SER MAS VULNERABLES AL CAMBIO CLIMATICO FUTURO.ASI, NUESTRO PRIMER OBJETIVO GENERAL ES SECUENCIAR Y ANOTAR EL GENOMA DE C. NIVALIS, CON LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1) SECUENCIACION Y ENSAMBLAJE, 2) ANOTACION, Y 3) ANALISIS EVOLUTIVO DEL GENOMA. EL SEGUNDO OBJETIVO GENERAL ES ESTUDIAR EL ESTADO DE CONSERVACION DE LAS POBLACIONES DE C. NIVALIS, CON LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS: 1) IDENTIFICAR ADAPTACIONES GENETICAS IMPULSADAS POR EL CLIMA, Y 2) ANALISIS DEL TIPO "GENETIC LANDSCAPE" PARA DETERMINAR EL POTENCIAL DE ADAPTACION PRESENTE Y FUTURO DE C. NIVALIS EN ESPAÑA. ESTA PROPUESTA TENDRA UN GRAN IMPACTO CIENTIFICO YA QUE PLANEAMOS GENERAR UN GENOMA DE REFERENCIA DE ALTA CALIDAD PARA C. NIVALIS Y DATOS GENOMICOS DE BIODIVERSIDAD QUE ESTARAN DISPONIBLES PUBLICAMENTE. ESTOS RESULTADOS SUPONDRAN IMPORTANTES APORTACIONES AL PROGRAMA NACIONAL DE INVESTIGACION ORIENTADA A LOS RETOS DE LA SOCIEDAD (RETO 5. CAMBIO CLIMATICO Y USO DE RECURSOS Y MATERIAS PRIMAS - BIODIVERSIDAD), YA QUE DESCUBRIREMOS EL ESTADO REAL DE LA VARIABILIDAD GENOMICA DE VARIAS POBLACIONES DE TOPILLO NIVAL, LO QUE FACILITARA LA TOMA DE DECISIONES SOBRE QUE POBLACIONES REQUIEREN ALGUNA ACTUACION DE CONSERVACION Y COMO HACERLO. OPILLO NIVAL\CAMBIO CLIMATICO\ADAPTACION\BIODIVERSIDAD\RAD-SEQ\SECUENCIACION DEL GENOMA\CHIONOMYS NIVALIS\NEVERON

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