Descripción del proyecto
El proyecto ONCOINMUNOBIOME está centrado en desarrollar una plataforma para el estudio integral del tumor y del microambiente tumoral realizando una caracterización molecular avanzada in situ, una caracterización genómica y transcriptómica del tumor mediante secuenciación masiva (NGS), un análisis del microbioma de hongos y bacterias y un análisis inmmunogenómico con la identificación de neoantígenos para posible desarrollo de vacunas personalizadas y la identificación de repertorios de linfocitos T específicos de dicho neoantígenos para su utilización en terapias celulares adoptivas, Todo ello dirigido a posibilitar una Medicina de Precisión y personalizada del cáncer,El consorcio de este proyecto ha sido diseñado de forma que se garantice el éxito del mismo debido a la complementariedad del conjunto y aportaciones de cada miembro:- LABORATORIOS LARRASA (EMPRESA COORDINADORA) es una pieza esencial del proyecto pues dada la magnitud y la escala de los trabajos a realizar no se podría realizar el proyecto sin un miembro que aportare una gran escalabilidad en NGS,- ERA7 (EMPRESA PARTICIPANTE) aporta un amplio conocimiento y experiencia en NGS ya que está haciendo investigaciones y prestando servicios de NGS desde hace más de 10 años, Era7 aporta asimismo la integración de procesos desde el laboratorio a los algoritmos de análisis de datos y por supuesto una gran capacidad y experiencia en desarrollo de software, computación en la nube y análisis de Big Data Genómico,- FIMA (GRUPO DE INVESTIGACIÓN PARTICIPANTE) aporta una gran experiencia en laboratorio de primera línea de inmunología básica y clínica y su aplicación en la reciente revolución de la Inmunoterapia del cáncer, En este sentido, el contar en el consorcio con este miembro nos permite contar con el líder de la inmunoterapia de cáncer en España en el momento actual, Como prueba de concepto para el proyecto se ha elegido el cáncer de colon, Se trata de una neoplasia altamente prevalente y mórbida, sobre la que se han realizado muchos esfuerzos, Se conoce mucho de su biología y muchos ensayos clínicos han puesto luz para mejorar su tratamiento, Sin embargo, sigue siendo una enfermedad con grandes retos por resolver, Así, un 20% de los pacientes con enfermedad sólo localmente avanzada no responden al tratamiento quirúrgico con quimioterapia sin que se disponga de marcadores para identificarlos al diagnóstico, Por otro lado, se trata de un tumor dónde la el microambiente juega un papel oncogénico y modulador del efecto de la terapia, Un 5% presentan inestabilidad de microsatélites, hecho que condiciona una particular relación entre neoantígenos y respuesta inmune específica, que debiera ser una ventaja terapéutica, El microbioma del tumor y del microambiente, igualmente intervienen en el desarrollo y progresión de la enfermedad, Todos estos aspectos nos han inclinado a elegir el cáncer de colon como core de este estudio,La idea de fondo de este proyecto es diseñar y desarrollar un sistema lo más completo posible de caracterizar un tumor sólido de forma integral tratando de abarcar su heterogeneidad (ecosistema del tumor) y su microambiente centrados especialmente en el microambiente inmunológico y en el microambiente microbiano del tumor,Para estudiar el ecosistema del tumor se incluye un muestreo muy completo de diversas localizaciones de los distintos tipos de tejido tanto del tumor como de los ganglios para reforzar la vertiente de exploración de repertorios de respuesta inmune,