Descripción del proyecto
LA FINALIDAD DE ESTE PROYECTO ES ESCLARECER LAS REDES REGULADORAS QUE CONTROLAN LA BIOSINTESIS DE MACROLIDOS POLIENOS, EL ESTUDIO SE CENTRA EN LOS ANTIFUNGICOS FILIPINA Y PIMARICINA, PRODUCIDOS POR STREPTOMYCES AVERMITILIS (UN ACTINOMICETO MODELO CUYO GENOMA ESTA TOTALMENTE SECUENCIADO) Y S,NATALENSIS (UN ACTINOMICETO DE CLARA APLICACION INDUSTRIAL), RESPECTIVAMENTE, Y SE EXTENDERA A OTROS PRODUCTORES DE POLIENOS COMO S,NODOSUS (ANFOTERICINA) O S,NOURSEI (NISTATINA), CUYOS PRODUCTOS SON UTILIZADOS EN CLINICA, LAS AGRUPACIONES GENICAS RESPONSABLES DE LA BIOSINTESIS DE ESTOS POLIENOS PRESENTAN GENES REGULADORES CON UN ALTO GRADO DE IDENTIDAD, CUYA IMPLICACION EN LA BIOSINTESIS HA SIDO DEMOSTRADA EN ALGUNOS CASOS, PERO TENEMOS EVIDENCIAS DE QUE ESTOS REGULADORES NO SOLO SE COMPORTAN COMO REGULADORES ESPECIFICOS DE RUTA, SINO QUE AFECTAN A OTROS PROCESOS AJENOS AL CLUSTER DE BIOSINTESIS, EL ESTUDIO PRETENDE DESVELAR NO SOLO QUE PROCESOS SON AFECTADOS SINO COMO LO SON, PARALELAMENTE, EL TRABAJO ABORDA EL ESTUDIO DE VARIOS REGULADORES GLOBALES CON LA IDEA DE DESCIFRAR LA CASCADA DE REGULACION EN LA QUE ESTAN IMPLICADOS Y SU EFECTO SOBRE LA PRODUCCION DE POLIENOS, EL CONOCIMIENTO DE LOS ELEMENTOS REGULADORES, Y DE SUS MECANISMOS DE CONTROL SOBRE LA PRODUCCION DE ESTOS ANTIFUNGICOS PERMITIRA ELIMINAR LAS ETAPAS LIMITANTES EN LA BIOSINTESIS DE ESTOS COMPUESTOS (CUELLOS DE BOTELLA) PARA AUMENTAR SU PRODUCCION,LOS OBJETIVOS PARTICULARES SE DIVIDEN EN DOS GRUPOS, EL PRIMERO CENTRADO EN LA CARACTERIZACION DE LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL LLEVADA A CABO POR REGULADORES ESPECIFICOS DE RUTA, QUE INCLUYE: EL ESTUDIO TRANSCRIPTOMICO GLOBAL DE MUTANTES EN ESTOS REGULADORES DE S,NATALENSIS PARA LA IDENTIFICACION DE LOS PROCESOS AFECTADOS POR LOS MISMOS; LA IDENTIFICACION DE LOS SITIOS DE UNION DE PIMM A SUS PROMOTORES DIANA; EL ESTUDIO DEL EFECTO DE PIMM DE S,NATALENSIS SOBRE LA EXPRESION DE LAS AGRUPACIONES GENICAS DE LA NISTATINA EN S,NOURSEI, Y DE LA ANFOTERICINA EN S,NODOSUS; EL ESTUDIO DE LA FUNCIONALIDAD DE LOS DOMINIOS PAS Y DBD DE PIMM MEDIANTE LA CONSTRUCCION DE REGULADORES QUIMERA; EL ANALISIS TRANSCRIPTOMICO DE LA FIDELIDAD DE LOS REGULADORES PARTICULARES DE LA PRODUCCION DE FILIPINA EN S,AVERMITILIS; EL EFECTO GLOBAL DE LA COMPLEMENTACION DE LOS MUTANTES EN LOS REGULADORES DE FILIPINA POR REGULADORES ORTOLOGOS; Y LA IDENTIFICACION DE PROMOTORES DIANA DEL REGULADOR PIMR IN VIVO MEDIANTE ESTUDIOS DE CHIP-ON-CHIP, Y EL SEGUNDO CENTRADO EN EL ESTUDIO DE LA IMPLICACION DE REGULADORES PLEIOTROPICOS EN LA CASCADA DE TRANSDUCCION DE SEÑALES QUE CONDUCE A LA BIOSINTESIS DE ESTOS MACROLIDOS POLIENICOS, MEDIANTE: EL ESTUDIO TRANSCRIPTOMICO GLOBAL DE MUTANTES EN EL REGULADOR GLOBAL PHOP DE S,NATALENSIS PARA LA IDENTIFICACION DE LOS PROCESOS AFECTADOS POR EL MISMO; Y EL ESTUDIO DEL EFECTO DE LA INACTIVACION DEL REGULADOR LAL 7090 DE S,AVERMITILIS EN LA EXPRESION GENICA Y EN LA PRODUCCION DE FILIPINA,