Descripción del proyecto
LAS PROTEINAS SON MOLECULAS BIOLOGICAS DE ENORME VALOR ECONOMICO Y SOCIAL GENERALMENTE PRODUCIDAS MEDIANTE TECNOLOGIA RECOMBINANTE. EL MERCADO MUNDIAL DE PROTEINAS RECOMBINANTES ASCIENDE EN 2021 A 1000 M$ Y ESTA CRECIENDO. LAS PROTEINAS RECOMBINANTES LAS FABRICAN PRINCIPALMENTE EMPRESAS BIOTECNOLOGICAS Y BIOFARMACEUTICAS E INSTITUTOS DE INVESTIGACION Y SE UTILIZAN EN UNA GAMA CADA VEZ MAS AMPLIA DE APLICACIONES MEDICAS E INDUSTRIALES: COMPONENTES DE BIOSENSORES, INGREDIENTES ACTIVOS DE FORMULACIONES FARMACEUTICAS O BIOCATALIZADORES EN QUIMICA VERDE. EL USO DE PROTEINAS ESTA CRECIENDO PERO SU IMPACTO SOCIAL Y ECONOMICO SE VE LIMITADO POR SU INSUFICIENTEMENTE ESTABILIDAD PARA LAS APLICACIONES REQUERIDAS. ESTE PROYECTO ABORDA EL DESAFIO DE OBTENER PROTEINAS MAS ESTABLES DE MANERA VALIDADA Y FACIL PARA POTENCIAR SU USO BIOTECNOLOGICO Y BIOMEDICO COMO HERRAMIENTAS SINTETICAS, ANALITICAS O TERAPEUTICAS. A PESAR DE LOS GRANDES ESFUERZOS REALIZADOS, LAS HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS ACTUALMENTE UTILIZADAS PARA DISEÑAR MUTACIONES ESTABILIZADORAS DE PROTEINAS NO SON TAN FIABLES COMO RESULTA NECESARIO PARA QUE LOS FABRICANTES ABORDEN LA ESTABILIZACION EFICAZ DE SUS PRODUCTOS PROTEICOS. A PARTIR DE NUESTRO AMPLIO CONOCIMIENTO Y EXPERIENCIA EN ESTABILIZACION DE PROTEINAS, Y ESTIMULADOS POR LA NECESIDAD IDENTIFICADA EN DEL MERCADO, HEMOS DESARROLLADO UN PROTOTIPO AVANZADO DE HERRAMIENTA BIOINFORMATICA DISRUPTIVA QUE PROPONE DIRECTAMENTE AL USUARIO UNA LISTA DE MUTACIONES PARA LA PROTEINA INDICADA. ESTA NUEVA HERRAMIENTA, PROTPOSER, APROVECHA LAS POSIBILIDADES ESTABILIZADORAS QUE OFRECEN ALGUNAS DE LAS ESTRATEGIAS EXPERIMENTALES MAS EXITOSAS Y OPERA COMO UN EQUIPO DE EXPERTOS QUE ANALIZAN CONJUNTAMENTE LA SECUENCIA Y ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS BUSCANDO OPORTUNIDADES DE ESTABILIZACION. EN VEZ DE DATOS DE ENERGIA PARA QUE EL USUARIO LOS INTERPRETE, PROTPOSER DEVUELVE AL USUARIO UNA LISTA CONCRETA CLASIFICADA Y ANOTADA DE LAS MEJORES MUTACIONES ESTABILIZADORAS POSIBLES. NO CONOCEMOS NINGUNA OTRA HERRAMIENTA BIOINFORMATICA QUE PUEDA HACER LO QUE HACE EL PROTOTIPO DE PROTPOSER EN LA ACTUALIDAD, I.E. ANALIZAR LA ESTRUCTURA DE UNA PROTEINA Y DEVOLVER AL USUARIO (EXPERTO O NOVATO) UNA LISTA DE MUTACIONES PUNTUALES CON ALTA PROBABILIDAD (> 60%) DE AUMENTAR SIGNIFICATIVAMENTE LA ESTABILIDAD DE LA PROTEINA EN AL MENOS 0,5 KCAL/MOL. CABE DESTACAR QUE UNA VEZ IDENTIFICADAS LAS MUTACIONES APROPIADAS Y REVELADAS AL USUARIO, SU IMPLEMENTACION EXPERIMENTAL EN EL GEN CODIFICANTE, UNA A UNA O EN COMBINACIONES, ES TRIVIAL PORQUE LA TECNOLOGIA REQUERIDA (MUTAGENESIS DIRIGIDA O SINTESIS DE ADN) ESTA DISPONIBLE EN TODO EL MUNDO CON UN COSTE MUY MODESTO. ESTA PROPUESTA ESTA BASTANTE MADURA Y HA SIDO PROBADA INTERNAMENTE A BAJA ESCALA. ANTES DE ESTAR LISTA PARA SU COMERCIALIZACION, NECESITA PRUEBAS EN UN CONJUNTO MAYOR DE PROTEINAS MUTANTES YA CARACTERIZADAS Y TAMBIEN PRUEBAS DIRECTAS MEDIANTE EL DISEÑO Y ANALISIS EN PROTEINAS DE ALTO VALOR COMERCIAL DE NUEVAS MUTACIONES NO PREVIAMENTE REPORTADAS. PROTPOSER ESTARA DISPONIBLE LIBREMENTE PARA USUARIOS ACADEMICOS A TRAVES DE UN SERVIDOR. LOS USUARIOS NO ACADEMICOS, E.G. PYMES Y GRANDES EMPRESAS, TENDRAN ACCESO AL MISMO SERVIDOR ONLINE MEDIANTE CONVENIOS DE LICENCIA CON LA UNIVERSIDAD DE ZARAGOZA. EL CODIGO DE PROTPOSER SE ADAPTARA PARA MOSTRAR ESTRATEGIAS DE ESTABILIZACION COMPLEMENTARIAS Y DAR UN SOPORTE DE USUARIO EXTENDIDO. LA VERSION PREMIUM SE COMERCIALIZARA COMO UNA APLICACION INDEPENDIENTE, TAMBIEN BAJO LICENCIA. ROTEINAS RECOMBINANTES\QUIMICA VERDE\MEDICAMENTOS BIOLOGICOS\HERRAMIENTA BIOINFORMATICA\ESTABILIZACION DE PROTEINAS