ENFOQUES SISTEMICOS A LOS MECANISMOS DE DEFENSA DEL HOSPEDADOR ANTE ENFERMEDAD E...
ENFOQUES SISTEMICOS A LOS MECANISMOS DE DEFENSA DEL HOSPEDADOR ANTE ENFERMEDAD E INFECCION EN M. TUBERCULOSIS: CAUSAS GENETICAS Y EVALUACION DE IMPACTO EN NUEVAS VACUNAS
EN TUBERCULOSIS, LA HETEROGENEIDAD EN LOS NIVELES DE SUSCEPTIBILIDAD FRENTE AL PATOGENO JUEGA UN PAPEL FUNDAMENTAL, Y OCURRE A DOS NIVELES, DENOMINADOS RESISTENCIA Y TOLERANCIA, MIENTRAS QUE LA RESISTENCIA CONSISTE EN LA HABILIDAD...
EN TUBERCULOSIS, LA HETEROGENEIDAD EN LOS NIVELES DE SUSCEPTIBILIDAD FRENTE AL PATOGENO JUEGA UN PAPEL FUNDAMENTAL, Y OCURRE A DOS NIVELES, DENOMINADOS RESISTENCIA Y TOLERANCIA, MIENTRAS QUE LA RESISTENCIA CONSISTE EN LA HABILIDAD DEL SISTEMA INMUNE INNATO DE ELIMINAR EL PATOGENO SIN LA PARTICIPACION DE AGENTES IMMUNES ADAPTATIVOS; LA TOLERANCIA SE REFIERE A LA CAPACIDAD DEL SISTEMA IMMUNE EN SU CONJUNTO DE CONTENER AL PATOGENO, EN CASO DE QUE LA INFECCION NO HAYA SIDO ELIMINADA ANTES, EN UN ESTADO LATENTE Y ASINTOMATICO, EN LO QUE RESPECTA A LAS CAUSAS DE ESTOS EFECTOS, VARIOS ESTUDIOS APUNTAN A LA PRESENCIA DE FUERTES FACTORES GENETICOS, CUYOS MECANISMOS ESPECIFICOS SON AUN POBREMENTE COMPRENDIDOS, POR OTRA PARTE, POTENCIAR LA RESISTENCIA, Y/O LA TOLERANCIA AL PATOGENO RESULTA, EN EL CASO DE LA TB, EL FIN ULTIMO DE CUALQUIER VACUNA, LA ESTIMACION DEL IMPACTO RELATIVO QUE PUEDE ESPERARSE DE UNA VACUNA FRENTE A LA TB CAPAZ DE AUMENTAR LOS NIVELES DE RESISTENCIA O TOLERANCIA EN LA POBLACION CONSTITUYE UNA CUESTION AUN ABIERTA EN LA LITERATURA,EN ESTE PROYECTO, NOS PROPONEMOS IMPLEMENTAR UN PROGRAMA DE ANALISIS COMPUTACIONALES QUE COMBINA CONCEPTOS, HERRAMIENTAS Y EXPERIENCIA EN BIO-INFORMATICA, GENOMICA DE SISTEMAS, TEORIA DE REDES Y EPIDEMIOLOGIA MATEMATICA, EL PROYECTO CONSTA DE DOS OBJETIVOS PRINCIPALES,EN UNA PRIMERA MITAD DEL PROYECTO, ANALIZAREMOS UN DATASET GENOMICO RECIENTEMENTE COMPILADO POR EL EQUIPO INVESTIGADOR, CORRESPONDIENTE A UN EXPERIMENTO IN-VITRO EN EL QUE MACROFAGOS PROCEDENTES DE MUESTRAS DE SANGRE DE UN PANEL DE 100 VOLUNTARIOS SON INFECTADOS CON LA MISMA CEPA VIRULENTA MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (M,TB,), EL AGENTE CAUSANTE DE LA TB, EN ESTE EXPERIMENTO SE SECUENCIARON LOS GENOMAS DE LOS 100 VOLUNTARIOS, Y SE EXTRAJO EL RNA DE LOS MACROFAGOS, -INFECTADOS Y SIN-INFECTAR-, ASI COMO DEL PATOGENO, PARA MEDIR LOS NIVELES DE EXPRESION GENETICA DE AMBOS, EN EL CONTEXTO DE ESTE PROYECTO, COMBINAREMOS TODOS ESTOS DATOS PARA IDENTIFICAR LAS VARIANTES GENETICAS DEL HUESPED CAPACES DE MODIFICAR LOS PERFILES TRANSCRIPTOMICOS DEL PROPIO HUESPED Y SU PATOGENO POR IGUAL, FINALMENTE, USAREMOS LOS RESULTADOS DE DICHOS ANALISIS, EN COMPARACION CON ESTUDIOS DE ASOCIACION PANGENOMICA PUBLICADOS CON ANTERIORIDAD (GWAS), A FIN DE IDENTIFICAR NUEVAS VARIANTES ASOCIADAS CON VARIACIONES EN LOS NIVELES DE RESISTENCIA Y TOLERANCIA A LA ENFERMEDAD, Y LOS MECANISMOS A TRAVES DE LOS CUALES ESTAS TIENEN LUGAR,EN LA SEGUNDA PARTE DEL PROYECTO, APLICAREMOS MODELOS MATEMATICOS DE TRANSMISION DE LA TB A LA EVALUACION DEL IMPACTO RELATIVO DE NUEVAS VACUNAS DISEÑADAS PARA POTENCIAR LOS MECANISMOS DE RESISTENCIA Y TOLERANCIA A LA TB EN EL HUESPED, PRIMERO, EXTENDEREMOS UN MODELO COMPARTIMENTAL DESARROLLADO PREVIAMENTE POR EL EQUIPO INVESTIGADOR A LA DESCRIPCION DE DISTINTOS TIPOS DE VACUNAS, BAJO UNA SERIE DE ESCENARIOS ALTERNATIVOS, SEGUNDO, UTILIZAREMOS DICHO MODELO PARA COMPARAR LOS IMPACTOS CAUSADOS POR VACUNAS QUE POTENCIAN LA RESISTENCIA, O LA TOLERANCIA, EN LA POBLACION VACUNADA, FINALMENTE, EXPLORAREMOS NUEVOS PARADIGMAS DE MODELIZACION DIFERENTES A LOS MODELOS COMPARTIMENTALES A FIN DE DESCRIBIR FENOMENOS EPIDEMIOLOGICOS RELEVANTES, E INCOMPATIBLES CON LOS MISMOS, COMO LA HETEROGENEIDAD EN LA DISTRIBUCION DEL POTENCIAL INFECCIOSO DE LOS ENFERMOS, O LA PRESENCIA DE TB SUB-CLINICA, TUBERCULOSIS\VACUNAS\MODELOS DE PROPAGACION DE ENFERMEDADES\EQTLS\GENOMICAver más
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