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EUR2023-143461

Financiado

Biotecnología

LA RESTAURACION DE LA DISBIOSIS DEL MICROBIOMA MEDIANTE EL ENRIQUECIMIENTO DE BACTERIAS PROBIOTICAS SE USA ACTUALMENTE PARA TRATAR ENFERMEDADES INFECCIOSAS COMO LA VAGINOSIS BACTERIANA (BV). SIN EMBARGO, ESTOS TRATAMIENTOS RESULTA... ver más

01/01/2023

UIC

100K€

Presupuesto del proyecto: 100K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT INTERNACIONAL DE CATALUNYA, FUNDA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2023-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UIC

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT INTERNACIONAL DE CATALUNYA, FUNDA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Sin perfil tecnológico

Presupuesto del proyecto 100K€

Descripción del proyecto LA RESTAURACION DE LA DISBIOSIS DEL MICROBIOMA MEDIANTE EL ENRIQUECIMIENTO DE BACTERIAS PROBIOTICAS SE USA ACTUALMENTE PARA TRATAR ENFERMEDADES INFECCIOSAS COMO LA VAGINOSIS BACTERIANA (BV). SIN EMBARGO, ESTOS TRATAMIENTOS RESULTAN INEFICACES, ESPECIALMENTE EN PRESENCIA DE BIOPELICULAS FORMADAS POR BACTERIAS PATOGENAS. HEMOS DEMOSTRADO, MEDIANTE INGENIERIA BACTERIANA, QUE PODEMOS ELIMINAR ESTAS BIOPELICULAS. SIN EMBARGO, SE DESCONOCE EL IMPACTO DE ESTAS BACTERIAS RECOMBINANTES (CHASIS) EN LA HOMEOSTASIS DE LOS MICROBIOMAS. PARA PODER DISEÑAR TRATAMIENTOS EFICIENTES ES IMPRESCINDIBLE ENTENDER COMO SE MODULA EL EQUILIBRIO DEL MICROBIOMA, ASI COMO IDENTIFICAR PROTEINAS QUE PODRIAN EXPRESARSE POR LOS CHASIS PARA RESTAURAR LA DISBIOSIS.PESE A QUE EL PROYECTO MICROBIOMA HUMANO (HMB) HA PERMITIDO LA SECUENCIACION MASIVA DE GENOMAS MICROBIANOS PRESENTES EN DIFERENTES ORGANOS DEL CUERPO, LA ANOTACION DE ESTOS GENOMAS NO ES COMPLETA. ESTOS ESTUDIOS PRINCIPALMENTE ANOTARON ORF QUE CODIFICAN PROTEINAS GRANDES (> 100AA). HEMOS ENCONTRADO QUE, EN PROMEDIO, EL 16 % DE UN GENOMA BACTERIANO PODRIA CODIFICAR PARA PROTEINAS PEQUEÑAS (SEPS; <100AA), ALGUNAS DE ELLAS ESENCIALES PARA LA VIABILIDAD CELULAR Y LA INFECCION. PESE A QUE LAS SEPS PODRIAN TENER PAPELES IMPORTANTES EN EL CONTROL DE LOS DIFERENTES MICROBIOMAS HUMANOS, ASEGURANDO LA COEXISTENCIA Y PREVINIENDO INFECCIONES, SU PEQUEÑO TAMAÑO DIFICULTA SU IDENTIFICACION. EN VENUS, ABORDAREMOS EL PRIMER OBJETIVO PRESENTADO EN LA PROPUESTA DEL ERC CONSOLIDATOR; LA IDENTIFICACION Y ANOTACION DE SEPS EN GENOMAS BACTERIANOS DEL MICROBIOMA VAGINAL. EN PRIMER LUGAR, EMPLEAREMOS UN SOFTWARE DESARROLLADO POR NOSOTROS, BASADO EN MACHINE LEARNING (RANSEPS) QUE PERMITE CLASIFICAR E IDENTIFICAR TODOS LOS SMORFS QUE PODRIAN CODIFICAR PARA SEPS A PARTIR DE LA SECUENCIA DEL GENOMA. EN SEGUNDO LUGAR, PARA LA VALIDACION EXPERIMENTAL DE DICHAS SEPS, APLICAREMOS PROTINSEQ, UN ENFOQUE EXPERIMENTAL QUE COMBINA LIBRERIAS DE MUTANTES GENERADOS POR TRANSPOSICION CON ULTRA-SEQUENCIACION.EN VENUS EMPLEANDO ESTAS TECNICAS COMPLEMENTARIAS EN DIVERSOS GENOMAS BACTERIANOS, REANOTAREMOS LOS GENOMAS DEL MICROBIOMA VAGINAL (VMB). HEMOS SELECCIONADO ESTE MICROBIOMA POR SU SIMPLICIDAD, FACIL ACCESO A MUESTRAS DE PACIENTES Y EL HECHO QUE LA DISBIOSIS DEL VMB CONLLEVE A LA BV. TRAS IDENTIFICAR Y REANOTAR LAS SEPS TENDRIAMOS LA POSIBILIDAD DE ESTUDIAR SU FUNCION EN LA REGULACION DE LA HOMEOSTASIS DEL VMB Y DISEÑAR CHASIS BACTERIANOS PARA EL TRATAMIENTO DE LA BV.LA ANOTACION COMPLETA DE LOS GENOMAS BACTERIANOS ES CLAVE PARA ENTENDER LOS DIFERENTES PROCESOS BIOLOGICOS, ES EL PUNTO DE PARTIDA EN BIOLOGIA DE SISTEMAS Y EN MUCHAS OTRAS DISCIPLINAS. LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO PERMITIRIAN IMPLEMENTAR UN SISTEMA DE ANOTACION DE GENOMAS EXTRAPOLABLE A OTROS MICROBIOMAS PERMITIENDO ASI UN MEJOR ENTENDIMIENTO DE PROCESOS BIOLOGICOS COMPLEJOS COMO LA HOMEOSTASIS. MICROBIOMA\BACTERIAS RECOMBINANTES\INFERTILIDAD\VAGINOSIS BACTERIANA\EQUILIBRIO\PROTEINAS PEQUEÑAS

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